UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srg-14F26B1.60chrI 6,313,673C. elegans SRG-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
2C16D9.3C16D9.3n/achrV 8,239,232
3C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
4C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
5F46B3.2F46B3.2n/achrV 20,594,388contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
6C50E3.8C50E3.8n/achrV 7,598,180
7T07D10.1T07D10.1n/achrI 12,604,999contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Katanin p80 subunit.; TR:O61585
8F44A2.7F44A2.7n/achrV 9,322,227
9str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
11srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12F36H5.8F36H5.8n/achrII 1,749,990This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
13T24D5.1T24D5.1n/achrX 12,575,561contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV156 hypothetical protein.; TR:Q9YVT6
14W03A5.1W03A5.1n/achrIII 5,410,601contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001452 (Src homology-3), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
15F53B1.3F53B1.3n/achrX 2,106,394
16srbc-10C18B10.2n/achrV 7,492,430C. elegans SRBC-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
18K06A9.2K06A9.2n/achrX 1,538,348This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
19F42A6.2F42A6.2n/achrIV 3,341,612
20srb-17F01D4.7n/achrIV 10,455,510C. elegans SRB-17 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
21F55E10.2F55E10.2n/achrX 8,340,780
22aqp-6C32C4.2n/achrV 10,651,251apq-6 encodes an aquaporin whose expression in Xenopus oocytes increases water permeability five- to seven-fold; aqp-6 has no function in mass RNAi assays, perhaps reflecting genetic redundancy with its paralogs AQP-4 and AQP-5; AQP-6 is expressed in the cilia and cell bodies of IL1 sensory neurons; AQP-6 is orthologous to human AQP8 (OMIM:603750).
23sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
24lgc-31F21A3.7n/achrV 15,516,308C. elegans LGC-31 protein
25D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
26clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27F08G12.5F08G12.5n/achrX 11,309,490contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
28C01G5.4C01G5.4n/achrIV 6,533,692contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
29sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30Y12A6A.2Y12A6A.2n/achrX 13,619,323contains similarity to Phaseolus lunatus Double-headed bowman-birk inhibitor (Fragment).; TR:Q941H3
31srh-258T06E6.7n/achrV 15,405,935C. elegans SRH-258 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32C17C3.6C17C3.6n/achrII 5,550,261This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
33C03H5.7C03H5.7n/achrII 381,414contains similarity to Interpro domains IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA)
34D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.
35Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
36C39D10.5C39D10.5n/achrX 7,891,348
37str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38hlh-17F38C2.2n/achrIV 16,255,479C. elegans HLH-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
39F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
40T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
41F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
42C03C10.2C03C10.2n/achrIII 4,092,033contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
43str-196T01G6.3n/achrV 492,687C. elegans STR-196 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
44C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
45Y42A5A.1Y42A5A.1n/achrV 11,093,039contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
46E02H4.4E02H4.4n/achrX 14,259,690contains similarity to Arabidopsis thaliana Uncharacterized protein At1g15830.1.; TR:Q3EDB7
47K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
48C17A2.3C17A2.3n/achrII 3,844,552contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2975-PA;; FLYBASE:CG2975
49str-115F07B10.3n/achrV 11,269,735C. elegans STR-115 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50nlp-22T24D8.3n/achrX 2,341,705C. elegans NLP-22 protein ;