UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nspd-9F26A1.10n/achrIII 4,830,156C. elegans NSPD-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF05611 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF780) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR008498 (Protein of unknown function DUF780, Caenorhabditis species)
2clc-4T05A10.2n/achrX 10,783,378clc-4 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; CLC-4 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4Y39F10A.3Y39F10A.3n/achrII 782,448contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
5K11D12.6K11D12.6n/achrV 5,034,830K11D12.6 encodes a putative serine protease inhibitor, with no obvious non-nematode orthologs but multiple C. elegans paralogs; K11D12.6 antagonizes CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
6F49F1.10F49F1.10n/achrIV 4,138,758contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
7F25C8.1F25C8.1n/achrV 20,903,971contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
8C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92
9F11F1.4F11F1.4n/achrIII 13,401,247contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
10C17F3.3C17F3.3n/achrI 6,682,871contains similarity to Interpro domains IPR000956 (Stathmin), IPR005819 (Histone H5), IPR000533 (Tropomyosin), IPR005398 (Tubby, N-terminal)
11scl-7C39E9.5n/achrIV 13,070,819C. elegans SCL-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
12cyp-25A3C36A4.3n/achrIII 3,838,517C. elegans CYP-25A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
13F20A1.8F20A1.8n/achrV 7,047,347
14F19H6.5F19H6.5n/achrX 12,364,231contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of O75143 Hypothetical protein KIAA0652; ENSEMBL:ENSP00000310321
15W03D8.5W03D8.5n/achrI 2,817,203contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
16clec-123Y25C1A.1n/achrII 3,115,497C. elegans CLEC-123 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17K03H1.12K03H1.12n/achrIII 9,941,867contains similarity to Gallus gallus BDNF/NT-3 growth factors receptor precursor (EC 2.7.1.112) (TrkBstyrosine kinase) (Trk-B).; SW:TRKB_CHICK
18clec-96ZK39.5n/achrI 11,151,582C. elegans CLEC-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
19cwp-1C37H5.10n/achrV 4,840,930cwp-1 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
20F21A3.4F21A3.4n/achrV 15,537,300contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC338999 isoform 2; HI:HIT000389435
21F49F1.3F49F1.3n/achrIV 4,115,363contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
22T05A7.6T05A7.6n/achrII 4,670,226contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23Y81G3A.1Y81G3A.1n/achrII 13,082,998Y81G3A.1 encodes a nematode-specific sperm protein; Y81G3A.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, F44F4.10, and T08G11.2); Y81G3A.1(RNAi) animals exhibit aldicarb resistance; Y81G3A.1 expression is enriched in spermatogenesis.
24C08H9.10C08H9.10n/achrII 9,854,672contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
25F02E9.3F02E9.3n/achrI 8,405,244contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein required for the decapping of mRNAs, functions to allow the production of active Dcp1p, contains a pyrophosphatase MutT motif and several alpha-helical leucine-rich motifs; SGD:YNL118C
26K12H6.5K12H6.5n/achrII 2,826,180
27R02F2.5R02F2.5n/achrIII 5,479,799contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
28C16C8.8C16C8.8n/achrII 3,461,412
29W01B6.8W01B6.8n/achrIV 10,083,904contains similarity to Xenopus laevis Nuclear/mitotic apparatus protein.; TR:P70012
30W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
31Y40H4A.2Y40H4A.2n/achrV 14,584,349contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
32T04A8.13T04A8.13n/achrIII 4,709,804contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
33clec-130W10G11.14n/achrII 3,574,098C. elegans CLEC-130 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
35F20A1.2F20A1.2n/achrV 7,047,678contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36B0432.11B0432.11n/achrII 294,279contains similarity to Interpro domain IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding)
37F47B3.1F47B3.1n/achrI 3,972,934contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
38ZC262.1ZC262.1n/achrIII 8,341,087
39K10H10.7K10H10.7n/achrII 14,507,311contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
40srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42F09E10.1F09E10.1n/achrX 1,503,048
43C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))
44Y106G6D.3Y106G6D.3n/achrI 10,113,137contains similarity to Ensis minor Nuclear protein.; TR:Q24898
45Y43F8C.17Y43F8C.17n/achrV 19,712,303contains similarity to Rhodosporidium toruloides Rhodotorucine A precursor 2.; SW:RHT2_RHOTO
46R04B5.11R04B5.11n/achrV 10,090,998contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000248104
47C06A8.6C06A8.6n/achrII 7,773,165contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR000875 (Cecropin)
48F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
49Y113G7C.1Y113G7C.1n/achrV 20,316,312contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000217 (Tubulin), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
50E03H12.7E03H12.7n/achrIV 4,988,167contains similarity to Danio rerio Protein FAM133.; SW:A1A5I1