UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F25H9.7F25H9.78.000000000000001e-76chrV 13,468,733contains similarity to Pfam domain PF05882 ACN9 family contains similarity to Interpro domain IPR008381 (ACN9)
2F07G6.3F07G6.3n/achrX 1,723,986
3K08D9.1K08D9.1n/achrV 3,236,735
4str-200F20E11.4n/achrV 17,457,362C. elegans STR-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5C08A9.8C08A9.8n/achrX 17,103,774contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
6F01F1.14F01F1.14n/achrIII 5,882,603
7F07H5.7F07H5.7n/achrII 8,793,642
8C53D6.6C53D6.6n/achrIV 9,030,151contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
9K01A2.6K01A2.6n/achrII 300,268
10srd-25F07C4.4n/achrV 7,632,583C. elegans SRD-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11ZC190.10ZC190.10n/achrV 8,696,074
12sqv-8ZK1307.5n/achrII 9,648,550The sqv-8 gene encodes a glucuronyl transferase, biochemically active in vitro, that is required for cytokinesis of one-cell embryos and for vulval morphogenesis; SQV-8 is homologous to three distinct glucuronyl transferases (GlcAT-I, GlcAT-P and GlcAT-D) that play a role in the synthesis of different glycoconjugates; the common requirement for SQV-8 in both cytokinesis and morphogenesis may be to promote filling an extracellular space with hygroscopic proteoglycans (either in the eggshell, or underneath the L4 cuticle), which in turn may cause the space to fill with fluid.
13T18D3.7T18D3.7n/achrX 12,442,974contains similarity to Pfam domain PF01166 TSC-22/dip/bun family contains similarity to Interpro domain IPR000580 (TSC-22 / Dip / Bun)
14scl-19ZK384.1n/achrV 18,732,354C. elegans SCL-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
15F22E12.3F22E12.3n/achrV 10,461,278contains similarity to Petroselinum crispum Reverse transcriptase (Fragment).; TR:Q9ZRL1
16str-183T13F3.1n/achrV 16,276,778C. elegans STR-183 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17W09C5.1W09C5.1n/achrI 13,627,524contains similarity to Pfam domain PF01201 Ribosomal protein S8e contains similarity to Interpro domain IPR001047 (Ribosomal protein S8e)
18str-116F07B10.2n/achrV 11,267,629C. elegans STR-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F15H10.6F15H10.6n/achrV 10,411,166contains similarity to Mycoplasma pneumoniae Oligopeptide transport ATP-binding protein oppF.; SW:OPPF_MYCPN
20Y38H8A.5Y38H8A.5n/achrIV 13,467,731The Y38H8A.5 gene encodes a homolog of the human gene ZNF195 (or p57KIP2), which when mutated leads to Beckwith-Wiedemann syndrome (OMIM:130650).
21K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
22math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
23arx-2K07C5.1n/achrV 10,336,882arx-2 encodes the C. elegans ortholog of the Arp2 subunit of the actin-related protein (Arp)2/3 complex.
24spp-11T25D10.3n/achrII 6,406,317C. elegans SPP-11 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
25T24E12.5T24E12.5n/achrII 3,755,632contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
26T03E6.8T03E6.8n/achrV 16,601,940contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27nhr-269R08H2.9n/achrV 15,369,318C. elegans NHR-269 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
28C50H11.1C50H11.1n/achrV 3,090,166contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
29str-102R08H2.13n/achrV 15,385,819C. elegans STR-102 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30ZK353.2ZK353.2n/achrIII 8,398,849contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
31twk-10K04A8.4n/achrV 6,553,200C. elegans TWK-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
32col-78W07A12.5n/achrII 9,153,340C. elegans COL-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
33ZC266.2ZC266.2n/achrV 4,696,862
34glb-17F49E2.4n/achrX 9,574,890glb-17 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
35sqv-3R10E11.4n/achrIII 9,779,478sqv-3 encodes a beta(1,4)-galactosyltransferase, biochemically active in vitro, that is required for cytokinesis of one-cell embryos, vulval morphogenesis, and chondroitin synthesis; SQV-3 is orthologous to human human galactosyltransferase I (B4GALT7; OMIM:604327, mutated in the progeroid form of Ehlers-Danlos syndrome); sqv-3 transgenically rescues hamster cells lacking galactosyl transferase I; the common requirement for SQV-3 in both cytokinesis and morphogenesis may be to promote filling an extracellular space with hygroscopic proteoglycans (either in the eggshell, or underneath the L4 cuticle), which in turn may cause the space to fill with fluid.
36srt-45M162.3n/achrV 19,780,434C. elegans SRT-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
37F14H12.7F14H12.7n/achrX 4,362,080
38C44B12.6C44B12.6n/achrIV 1,131,250contains similarity to Interpro domain IPR010345 (Interleukin-17)
39str-225C07G3.6n/achrV 3,508,534C. elegans STR-225 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001307 (Thiosulphate sulphurtransferase, conserved site)
40C04E6.3C04E6.3n/achrV 5,920,241
41sdz-34Y73C8C.7n/achrV 3,108,727C. elegans SDZ-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
42F45G2.7F45G2.7n/achrIII 13,433,876contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Two-component response regulator involved in modulation ofsflagellar.; TR:Q8EQW9
43T08E11.1T08E11.1n/achrII 1,838,405This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
44JC8.5JC8.5n/achrIV 13,245,638contains similarity to Pfam domain PF04442 Cytochrome c oxidase assembly protein  CtaG / Cox11 contains similarity to Interpro domain IPR007533 (Cytochrome c oxidase assembly protein CtaG/Cox11)
45ccdc-55C16C10.6n/achrIII 4,167,827C. elegans CCDC-55 protein ; contains similarity to Mus musculus Coiled-coil domain-containing protein 55.; SW:Q5NCR9
46uev-3F26H9.7n/achrI 9,311,457uev-3 encodes a ubiquitin-conjugating enzyme (UBC or E2) variant that contains the UBC motif, but lacks the critical active-site cysteine residue necessary for catalytic activity; as loss of UEV-3 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UEV-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; based on similarity to Saccharomyces cerevisiae and human proteins, however, UEV-3 may play a role in cell cycle control or response to stress or DNA damage.
47H25K10.6H25K10.6n/achrIV 16,235,400contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
48btb-9F45C12.4n/achrII 1,729,278C. elegans BTB-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
49bath-36Y75B12B.4n/achrV 15,189,546C. elegans BATH-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
50ztf-9ZK287.6n/achrV 9,691,558C. elegans ZTF-9 protein; contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)