UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1F25D7.5F25D7.50chrI 10,425,982contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
2F40B5.1F40B5.1n/achrX 8,376,670F40B5.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F40B5.1 has no clear orthologs in other organisms.
3F42A8.1F42A8.1n/achrII 9,343,914contains similarity to Yersinia pestis ORF4.; TR:Q9RPN3
4str-252C06B3.9n/achrV 13,917,252C. elegans STR-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5M01A8.1M01A8.1n/achrIII 9,259,292contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0544; ENSEMBL:ENSP00000262370
6Y42A5A.1Y42A5A.1n/achrV 11,093,039contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
7F46G10.2F46G10.2n/achrX 13,325,413contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
8Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
9Y70G10A.3Y70G10A.3n/achrIII 10,241,665contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) , PF07648 (Kazal-type serine protease inhibitor domain) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter), IPR011497 (Protease inhibitor, Kazal-type)
10C26E6.1C26E6.1n/achrIII 4,957,176contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
11gnrr-5H22D07.1n/achrV 4,452,877C. elegans GNRR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12Y12A6A.2Y12A6A.2n/achrX 13,619,323contains similarity to Phaseolus lunatus Double-headed bowman-birk inhibitor (Fragment).; TR:Q941H3
13srab-21T20D4.18n/achrV 3,423,693C. elegans SRAB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
14F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
15Y26D4A.9Y26D4A.9n/achrI 13,088,824contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus)
16R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
17T28A11.13T28A11.13n/achrV 3,249,973contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR006662 (Thioredoxin-related)
18sri-21T24A6.4n/achrV 3,550,559C. elegans SRI-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20B0310.3B0310.3n/achrX 512,692
21F55C7.2F55C7.2n/achrI 4,005,729
22C01G5.4C01G5.4n/achrIV 6,533,692contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
23twk-40T28A8.1n/achrIII 13,487,791C. elegans TWK-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
24F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
25sra-17F28C12.1n/achrI 12,689,638C. elegans SRA-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
26F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
27srh-32Y26G10.2n/achrV 17,702,215C. elegans SRH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28acl-12C01C10.3n/achrX 7,440,941C. elegans ACL-12 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002123 (Phospholipid/glycerol acyltransferase)
29sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
30K03A11.5K03A11.5n/achrX 13,066,078contains similarity to Enterobacteria phage RB49 Hypothetical protein.; TR:Q7Y3J5
31srbc-48F54B8.6n/achrV 15,820,807C. elegans SRBC-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
32T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
33C18D1.2C18D1.2n/achrII 10,057,912contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
34R03G5.6R03G5.6n/achrX 7,808,111
35srx-62K09D9.10n/achrV 3,995,344C. elegans SRX-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36M03D4.6M03D4.6n/achrIV 6,144,282contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
37K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
38T02H6.5T02H6.5n/achrII 687,130contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
39str-87F59E11.16n/achrV 8,987,304C. elegans STR-87 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
41C50E3.7C50E3.7n/achrV 7,595,623contains similarity to Interpro domain IPR001499 (Fungal pheromone STE3 GPCR)
42W02B8.3W02B8.3n/achrII 13,917,920contains similarity to Pfam domain PF04870 Protein of unknown function, DUF644 contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
43sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44C31A11.1C31A11.1n/achrV 16,294,149contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
45B0034.2B0034.2n/achrII 5,944,245
46R06A10.3R06A10.3n/achrI 1,078,831
47ZK994.1ZK994.1n/achrV 8,511,428contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
48T16H12.9T16H12.9n/achrIII 10,110,649contains similarity to Saccharomyces cerevisiae RNA polymerase I subunit A34.5; SGD:YJL148W
49D2007.2D2007.2n/achrIII 8,153,415D2007.2 is orthologous to the human gene TRANSKETOLASE (WERNICKE-KORSAKOFF SYNDROME) (TNF; OMIM:606781), which when mutated leads to disease.
50T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091