UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F25C8.1F25C8.10chrV 20,903,971contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
2cwp-1C37H5.10n/achrV 4,840,930cwp-1 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
3F11F1.4F11F1.4n/achrIII 13,401,247contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
4F21A3.4F21A3.4n/achrV 15,537,300contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC338999 isoform 2; HI:HIT000389435
5clec-130W10G11.14n/achrII 3,574,098C. elegans CLEC-130 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6C07E3.4C07E3.4n/achrII 10,361,814contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
7K12H6.5K12H6.5n/achrII 2,826,180
8clc-4T05A10.2n/achrX 10,783,378clc-4 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; CLC-4 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
9F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
10F59B2.12F59B2.12n/achrIII 9,019,194contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
11clec-108Y26D4A.6n/achrI 13,081,794C. elegans CLEC-108 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12scl-7C39E9.5n/achrIV 13,070,819C. elegans SCL-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
13F47C12.8F47C12.8n/achrIV 3,997,448contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
14C35E7.7C35E7.7n/achrI 10,814,340
15clec-96ZK39.5n/achrI 11,151,582C. elegans CLEC-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR001202 (WW/Rsp5/WWP)
16E02H9.9E02H9.9n/achrIII 2,467,742
17srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18scl-15F02E11.5n/achrII 3,284,156C. elegans SCL-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
19Y39F10A.3Y39F10A.3n/achrII 782,448contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
20R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
21F20A1.2F20A1.2n/achrV 7,047,678contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22Y43F8C.17Y43F8C.17n/achrV 19,712,303contains similarity to Rhodosporidium toruloides Rhodotorucine A precursor 2.; SW:RHT2_RHOTO
23C25F9.8C25F9.8n/achrV 19,395,796contains similarity to Nicotiana glutinosa Ribonuclease NW.; TR:Q7XZV5
24F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576
25F49F1.12F49F1.12n/achrIV 4,142,374contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
26srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27W02B3.7W02B3.7n/achrIII 691,490contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
28ZK1127.2ZK1127.2n/achrII 7,063,323contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
29ubc-24F49E12.4n/achrII 8,406,159ubc-24 encodes a predicted conjugating enzyme (UBCs/E2s) of the ubiquitin-conjugation system.
30K10H10.7K10H10.7n/achrII 14,507,311contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
31C49C8.6C49C8.6n/achrIV 8,657,801contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
32B0432.11B0432.11n/achrII 294,279contains similarity to Interpro domain IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding)
33clec-217F26D11.9n/achrV 7,958,038C. elegans CLEC-217 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
34ZK1290.11ZK1290.11n/achrII 7,561,190
35Y32B12A.4Y32B12A.4n/achrV 16,494,950contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
36C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
37K04H8.3K04H8.3n/achrI 14,256,314contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Putative phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismatesmutase.; TR:Q8A0T7
38Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
39nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40F58A4.1F58A4.1n/achrIII 9,599,163contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG34220-PA;; FLYBASE:CG34220
41cwp-2C37H5.11n/achrV 4,842,261cwp-2 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
42sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43H32C10.3H32C10.3n/achrIV 5,918,692contains similarity to Pfam domains PF00023 (Ankyrin repeat) (5), PF01529 (DHHC zinc finger domain) contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR002110 (Ankyrin)
44AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
45sfa-1Y116A8C.32n/achrIV 17,107,555Y116A8C.32 encodes an ortholog of splicing factor SF1, which enables 3' splice site recognition by binding U2AF65 and the intron branch site during splicing complex formation; Y116A8C.32 shares several domains with mammalian SF1 proteins (a U2AF65 binding domain, a hnRNP K homology domain, two RNA-binding zinc knuckles, and a proline-rich C-terminal domain), while also sharing a hydrophilic N-terminal domain (enriched for serine, arginine, lysine, and aspartate) with Drosophila but not mammalian SF1; Y116A8C.32's N-terminal domain resembles RS domains in other splicing proteins; Y116A8C.32 is required for embryonic viability, normally rapid growth, and proper body morphology.
46C15H11.1C15H11.1n/achrV 14,394,129contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
47F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
48C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
49F26A1.4F26A1.4n/achrIII 4,818,558contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
50Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825