UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F23C8.8F23C8.82e-178chrI 2,431,177contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2F52F10.3F52F10.3n/achrV 1,540,095contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
3C33E10.6C33E10.6n/achrX 17,268,242contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227I5
4F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
5K10C9.7K10C9.7n/achrV 1,066,687
6Y51A2D.18Y51A2D.18n/achrV 18,484,174contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7kcc-3K02A2.3n/achrII 7,428,601C. elegans KCC-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR000076 (K-Cl co-transporter), IPR004841 (Amino acid permease-associated region)
8C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
9C48E7.8C48E7.8n/achrI 6,267,364contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
10C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
11tag-191C53A5.4n/achrV 14,535,355C. elegans TAG-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
12T22B2.7T22B2.7n/achrX 3,909,459
13trf-1F45G2.6n/achrIII 13,431,808The trf-1 gene encodes a protein with a meprin-associated Traf homology (MATH) domain that may be involved in apoptosis.
14grl-2T16G1.8n/achrV 12,945,836grl-2 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-2 is expressed in neurons, amphid socket cells, and other cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
15K07E12.2K07E12.2n/achrIII 6,737,547
16str-86F59E11.14n/achrV 8,983,013C. elegans STR-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
18Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6
19F21C3.6F21C3.6n/achrI 7,284,859contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Caldesmon; ENSEMBL:ENSP00000354826
20W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
21lgc-30F58H7.3n/achrIV 932,249C. elegans LGC-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
22Y45F3A.1Y45F3A.1n/achrIII 10,559,860contains similarity to Homo sapiens Tropomyosin 2; ENSEMBL:ENSP00000367550
23Y39E4A.1Y39E4A.1n/achrIII 12,951,765contains similarity to Mus musculus Nuclear protein ZAP3.; SW:ZAP3_MOUSE
24W05B5.1W05B5.1n/achrI 13,043,893contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Homolog of human WASP, proline-rich protein; SGD:YOR181W
25H08M01.1H08M01.1n/achrIV 13,835,341contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR003071 (Orphan nuclear receptor, HMR type)
26T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
27C03B1.6C03B1.6n/achrX 6,350,637
28H12D21.5H12D21.5n/achrV 14,894,419contains similarity to Interpro domains IPR001307 (Thiosulfate sulfurtransferase), IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding protein), IPR001763 (Rhodanese-like)
29F46B6.10F46B6.10n/achrV 9,801,717contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; TR:Q96QJ8
30srv-12T04B2.4n/achrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
31Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
32F40G9.14F40G9.14n/achrIII 176,962contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
33C42C1.3C42C1.3n/achrIV 12,269,969contains similarity to Trypanosoma cruzi Hypothetical protein.; TR:Q4CVC5
34C06C3.9C06C3.9n/achrII 9,377,271
35F35B3.7F35B3.7n/achrX 17,038,997contains similarity to Homo sapiens Leucine zipper putative tumor suppressor 2; ENSEMBL:ENSP00000359240
36srg-46F32H5.5n/achrV 13,364,203C. elegans SRG-46 protein ;
37Y48E1C.3Y48E1C.3n/achrII 13,439,410contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
38C08E8.3C08E8.3n/achrV 18,351,418contains similarity to Clostridium perfringens Probable Ser-type protease.; TR:Q8XHC4
39skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
40fbxa-96H03G16.4n/achrX 15,059,361This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
41abt-3F55G11.9n/achrIV 12,953,691abt-3 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-3 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-3 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-3 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
42C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
43F07E5.4F07E5.4n/achrII 2,050,852
44F58G1.9F58G1.9n/achrII 12,924,971contains similarity to Homo sapiens Adapter-related protein complex 4 mu 1 subunit; SW:O00189
45W03F8.2W03F8.2n/achrIV 5,191,305contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
46C25A8.5C25A8.50.0002chrIV 7,000,530contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
47rpl-42C09H10.1n/achrII 11,093,225C. elegans RPL-42 protein ;
48K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
49scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
50T19D7.5T19D7.5n/achrX 665,501