UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F23C8.1F23C8.13.9999999999999997e-63chrI 2,447,555
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F23B12.1F23B12.1n/achrV 14,429,754contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
4W01B6.5W01B6.5n/achrIV 10,077,459contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
5nas-5T23H4.3n/achrI 9,887,167nas-5 encodes an astacin-like metalloprotease; loss of nas-5 activity in an RNAi hypersensitive strain results in axon guidance defects, including a failure of DD/VD motoneuron commissures to reach the dorsal cord, defasciculation of the dorsal nerve cord, and midline crossing defects in the ventral nerve cord.
6T22B2.7T22B2.7n/achrX 3,909,459
7F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
8F59E12.3F59E12.3n/achrII 5,638,690contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
9W01B11.1W01B11.1n/achrI 3,300,049contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
10C10G11.10C10G11.10n/achrI 6,305,695
11lips-2C04B4.3n/achrX 12,286,461C. elegans LIPS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
12F11D5.5F11D5.5n/achrX 3,302,988contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)
14srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15F09E8.1F09E8.1n/achrIV 13,141,838contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domains IPR011052 (Proteinase and amylase inhibitor), IPR002593 (Protein of unknown function DX)
16Y41C4A.1Y41C4A.1n/achrIII 11,648,712contains similarity to Oryza sativa Putative aspartate kinase.; TR:Q851Z6
17Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
18srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
19C44F1.2C44F1.2n/achrIII 3,769,375contains similarity to Pfam domains PF01342 (SAND domain) , PF02178 (AT hook motif) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR010919 (SAND-like), IPR000770 (SAND)
20srt-44M199.1n/achrIV 15,105,017C. elegans SRT-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
22C17C3.5C17C3.5n/achrII 5,552,099contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
23clec-119F47F6.5n/achrII 1,256,978C. elegans CLEC-119 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
24H04M03.11H04M03.11n/achrIV 5,883,356
25srv-12T04B2.4n/achrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
26F54D1.1F54D1.1n/achrIV 11,262,424contains similarity to Interpro domain IPR004087 (K Homology)
27grl-2T16G1.8n/achrV 12,945,836grl-2 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-2 is expressed in neurons, amphid socket cells, and other cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
28F23C8.8F23C8.8n/achrI 2,431,177contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
29T09B4.3T09B4.3n/achrI 6,177,087
30str-86F59E11.14n/achrV 8,983,013C. elegans STR-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31C26B2.2C26B2.2n/achrIV 8,021,582
32D2062.7D2062.7n/achrII 2,617,140
33fbxb-1T26H2.1n/achrV 19,240,953This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
34T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
35sra-38T21H8.3n/achrX 13,898,963C. elegans SRA-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
36W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
37srg-46F32H5.5n/achrV 13,364,203C. elegans SRG-46 protein ;
38C18H2.1C18H2.1n/achrIII 7,667,218contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) (2), PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
39Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
40try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
41tag-191C53A5.4n/achrV 14,535,355C. elegans TAG-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
42C23H4.6C23H4.6n/achrX 12,238,124contains similarity to Pfam domain PF02463 RecF/RecN/SMC N terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR003395 (RecF/RecN/SMC protein, N-terminal)
43Y45F3A.1Y45F3A.1n/achrIII 10,559,860contains similarity to Homo sapiens Tropomyosin 2; ENSEMBL:ENSP00000367550
44C08G5.2C08G5.2n/achrII 740,228
45T02H6.4T02H6.4n/achrII 690,572contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
46F28H7.4F28H7.4n/achrV 10,746,917contains similarity to Interpro domain IPR011893 (SelT/selW/selH selenoprotein)
47C24D10.1C24D10.1n/achrIV 5,167,373contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
48T24E12.10T24E12.10n/achrII 3,770,931contains similarity to Magnetococcus sp MJ0042 family finger-like protein.; TR:A0LDP7
49K10C9.7K10C9.7n/achrV 1,066,687
50T07E3.2T07E3.2n/achrIII 6,907,721