UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F22F7.6F22F7.60chrV 2,116,951contains similarity to Homo sapiens N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase; ENSEMBL:ENSP00000309096
2C02B8.6C02B8.6n/achrX 8,134,694contains similarity to Pfam domains PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF02825 (WWE domain) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR004170 (WWE), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
3T15B7.12T15B7.12n/achrV 6,818,884contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4R01H2.1R01H2.1n/achrIII 7,062,968
5srsx-27C51E3.2n/achrV 10,151,415C. elegans SRSX-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
6C03B1.10C03B1.10n/achrX 6,357,809contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ42885 fis, clone BRHIP3007586; HI:HIT000044748
7srd-3K10B4.5n/achrII 127,822C. elegans SRD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F54F11.1F54F11.1n/achrII 13,505,368contains similarity to Interpro domain IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
9F11C3.1F11C3.1n/achrI 14,869,588contains similarity to Xenopus laevis ATP-dependent DNA helicase PIF1 (EC 3.6.1.-).; SW:Q0R4F1
10R09E10.5R09E10.5n/achrIV 10,299,194contains similarity to Pfam domains PF03782 (AMOP domain) , PF06119 (Nidogen-like) contains similarity to Interpro domains IPR005533 (AMOP), IPR003886 (Nidogen, extracellular region), IPR016060 (Complement control module)
11K02E7.4K02E7.4n/achrII 1,073,572contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
12C49H3.9C49H3.9n/achrIV 7,908,266contains similarity to Pfam domain PF07967 C3HC zinc finger-like contains similarity to Interpro domain IPR012935 (Zinc finger, C3HC-like)
13srh-233Y113G7A.1n/achrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14srx-137F09F3.13n/achrV 13,863,436C. elegans SRX-137 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15fbxb-79R07H5.7n/achrIV 11,189,235C. elegans FBXB-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
16T14F9.2T14F9.2n/achrX 2,235,334
17T02H6.3T02H6.3n/achrII 692,115
18srbc-18C45H4.6n/achrV 2,169,987C. elegans SRBC-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19C24A3.1C24A3.1n/achrX 9,003,584contains similarity to Aedes aegypti Condensin, SMC5-subunit, putative (Fragment).; TR:Q16IF0
20nhr-271T03E6.3n/achrV 16,579,462C. elegans NHR-271 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
21C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
22F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
23knl-1C02F5.1n/achrIII 8,252,399knl-1 encodes a novel acidic protein with a coiled-coil region at its C-terminus; KNL-1 is an essential kinetochore component that is required for proper spindle elongation and chromosome separation, and in the kinetochore assembly pathway, plays a key role in linking the initiation of kinetochore formation with the construction of a functional microtubule-binding interface; in the assembly pathway, KNL-1 functions downstream of the DNA-proximal kinetochore components CeCENP-A/HCP-3 and CeCENP-B/HCP-4 and upstream of the outer kinetochore components HIM-10/Nuf2p, NDC-80/HEC1, CeBUB-1, HCP-1, and CeCLASP2/CLS-2; in expression studies in the one-cell embryo, KNL-1 localizes to kinetochores throughout mitosis.
24brc-2T07E3.5n/achrIII 6,901,783brc-2 encodes a BRC domain-containing protein that is homologous to human BRCA2 which when mutated leads to early-onset breast cancer 2 or hereditary male breast cancer (OMIM:600185); in C. elegans, BRC-2 activity is essential for RAD-51-mediated repair of meiotic and radiation-induced double-strand breaks (DSBs); BRC-2 physically interacts with RAD-51 and single-stranded DNA and is required for proper localization of RAD-51 to sites of DNA damage and stabilization of RAD-51-DNA filaments; BRC-2 can also promote RAD-51-independent DSB repair via single-strand annealing (SSA) when the homologous recombination (HR) and nonhomologous end joining pathways (NHEJ) are compromised; in nonirradiated animals, BRC-2 is seen at diffuse, low levels in germline nuclei, but upon radiation treatment BRC-2 localizes to discrete foci that coincide with presumptive sites of DNA damage.
25R10D12.7R10D12.7n/achrV 13,950,209contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
26F52G3.4F52G3.4n/achrX 16,950,151
27sru-4C33A12.10n/achrIV 9,498,965C. elegans SRU-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
28athp-1C44B9.4n/achrIII 10,887,899C. elegans ATHP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF02178 (AT hook motif) (2), PF00628 (PHD-finger) contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000294 (Vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic region), IPR000253 (Forkhead-associated), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
29R148.2R148.2n/achrIII 3,184,321
30T14G10.8T14G10.8n/achrIV 10,146,609contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P08235 Mineralocorticoid receptor; ENSEMBL:ENSP00000281330
31B0250.8B0250.8n/achrV 20,465,482contains similarity to Mycoplasma mycoides FtsY protein.; TR:O05289
32tbx-8T07C4.2n/achrIII 10,348,548C. elegans TBX-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
33srv-8F53F1.7n/achrV 13,419,959C. elegans SRV-8 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002456 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
34F11A1.2F11A1.2n/achrX 10,658,016
35srh-204E03D2.3n/achrV 4,239,757C. elegans SRH-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36lin-8B0454.1n/achrII 3,058,509lin-8 is a class A synthetic multivulva (synMuv) gene that functions redundantly with class B synMuv genes to negatively regulate Ras-mediated signaling during vulval induction.
37hlh-8C02B8.4n/achrX 8,118,315The hlh-8 gene encodes a helix-loop-helix protein required for normal muscle development, and hence for normal defecation and egg-laying.
38srh-47T03F7.4n/achrV 11,299,983C. elegans SRH-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
39K09F5.4K09F5.4n/achrX 7,710,385
40B0361.10B0361.10n/achrIII 7,286,727contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domains IPR010908 (Longin), IPR001388 (Synaptobrevin), IPR011012 (Longin-like)
41H03G16.1H03G16.1n/achrX 15,054,187contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
42W06G6.9W06G6.9n/achrV 16,646,169contains similarity to Ralstonia solanacearum Hypothetical protein RSc2317.; TR:Q8XX01
43Y116A8C.15Y116A8C.15n/achrIV 16,996,337contains similarity to Homo sapiens similar to KIAA1357 protein; ENSEMBL:ENSP00000258005
44C18G1.7C18G1.7n/achrV 4,746,815contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
45T08G5.7T08G5.7n/achrV 14,044,675contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
46fip-5F41E7.4n/achrX 10,302,828C. elegans FIP-5 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000480 (Glutelin)
47R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
48T02G6.6T02G6.6n/achrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
49lis-1T03F6.5n/achrIII 13,373,822lis-1 encodes an ortholog of human LIS1, which when mutated leads to lissencephaly (OMIM:247200); it also encodes an ortholog of the Aspergillus nidulans nudF, which mediates nuclear migration along Aspergillus hyphae.
50Y56A3A.11Y56A3A.11n/achrIII 11,896,407contains similarity to Pfam domain PF01974 tRNA intron endonuclease, catalytic C-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006677 (tRNA intron endonuclease, catalytic domain-like), IPR011856 (Endonuclease TnsA, N-terminal/resolvase Hjc/tRNA endonuclease, C-terminal)