UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F22E5.13F22E5.131e-52chrII 2,648,208
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4F46G11.1F46G11.1n/achrX 5,794,401F46G11.1 is orthologous to the human gene TRUNCATED PUTATIVE T7-LIKE MITOCHONDRIAL DNA HELICASE (C10orf2; OMIM:606075), which when mutated leads to disease.
5F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
6ZK287.4ZK287.4n/achrV 9,682,882contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR000694 (Proline-rich region), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
7elc-2W03H1.2n/achrX 1,777,746elc-2 encodes a protein containing a Skp1 dimerisation domain that has homology to human transcription elongation factor B (SIII), polypeptide I (15kD, elonginsC).
8sfxn-1.1AH6.2n/achrII 9,518,171C. elegans SFXN-1.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF03820 Tricarboxylate carrier contains similarity to Interpro domain IPR004686 (Tricarboxylate/iron carrier)
9str-264C06B8.4n/achrV 15,491,810C. elegans STR-264 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10R08C7.4R08C7.4n/achrIV 4,436,206contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
11ZK829.1ZK829.1n/achrIV 11,941,464contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
12ins-35K02E2.4n/achrV 20,371,307ins-35 encodes one of several insulin-related peptides.
13F23B2.7F23B2.7n/achrIV 9,151,248contains similarity to Homo sapiens similar to Cylicin I (Multiple-band polypeptide I); ENSEMBL:ENSP00000331556
14F28D1.6F28D1.6n/achrIV 12,384,958contains similarity to Neurospora crassa ATP-dependent RNA helicase dbp-8 (EC 3.6.1.-).; SW:Q7RYZ7
15F55G7.1F55G7.1n/achrX 11,925,643contains similarity to Galleria mellonella Sericin-2 (Silk gum protein 2) (Fragment).; SW:SER2_GALME
16F40A3.7F40A3.7n/achrV 7,897,725contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18pqn-2AC3.4n/achrV 10,383,199The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
19C32D5.7C32D5.7n/achrII 6,337,900
20C10A4.1C10A4.1n/achrX 7,417,182contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
21T15B7.8T15B7.8n/achrV 6,822,465contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
22frm-7C51F7.1n/achrV 12,304,705C. elegans FRM-7 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR014352 (FERM/acyl-CoA-binding protein, 3-helical bundle), IPR000299 (Band 4.1, N-terminal)
23T08G5.9T08G5.9n/achrV 14,045,861contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
24M176.4M176.4n/achrII 9,421,150contains similarity to Pfam domain PF07947 YhhN-like protein contains similarity to Interpro domains IPR012506 (YhhN-like), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3)
25gcy-36C46E1.2n/achrX 15,482,280gcy-36 encodes a predicted soluble guanylate cyclase that genetically interacts with npr-1 with respect to feeding behavior; expressed in AQR, PQR, and URX3.
26F14B6.2F14B6.2n/achrI 12,220,319contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
27sprr-1R03A10.6n/achrX 15,467,342C. elegans SPRR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
29nph-4R13H4.1n/achrV 11,837,428nph-4 encodes an ortholog of human NPHP4 (OMIM:607215, mutated in juvenile nephronophthisis and Senior-Loken syndrome-4) that is required for normal chemotaxis, lifespan, and male mating behavior; NPH-4 is expressed in diverse neurons (amphid and phasmid sensory, URX, labial, male lumbar and cloacal ganglia, and male-specific CEM, HOB and RnB); within neurons, NPH-4 is a ciliary protein, localized to the transistion zone at cilial bases rather than ciliary axonemes, and absent from somata, axons, or dendrites; NPH-4 colocalizes with NPH-1 and PKD-2 in male-specific sensory cilia, and is required for the normal ciliary localization of NPH-1; NPH-4 expression requires DAF-19, and mutating an X-box in nph-4's promoter abolishes nph-4 expression; NPH-4 is required for NPH-1's localization to transistion zones; morphologically, nph-4 mutant cilia are normal, indicating a function for NPH-4 in signal transduction.
30sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
31K04A8.3K04A8.3n/achrV 6,559,849
32srx-45K01B6.2n/achrIII 9,305,269C. elegans SRX-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33R05D7.4R05D7.4n/achrI 12,182,156contains similarity to Pfam domains PF07819 (PGAP1-like protein) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR012908 (PGAP1-like), IPR000639 (Epoxide hydrolase-like), IPR008262 (Lipase, active site), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase)
34nhr-74C27C7.3n/achrI 11,430,558C. elegans NHR-74 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35T10H4.4T10H4.4n/achrV 15,271,231contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
36ist-1C54D1.3n/achrX 7,135,879ist-1 encodes a pleckstrin homology (PH) and phosphotyrosine binding (PTB) domain-containing insulin receptor substrate (IRS) homolog that negatively regulates lifespan and dauer development; IST-1 potentiates insulin-like signaling, although it is not absolutely required for such signaling under most conditions; in addition to acting through the AGE-1/PI3K branch of the insulin-like signaling pathway, IST-1 may also function in a parallel pathway to activate downstream protein-kinase Bs encoded by akt-1 and akt-2.
37C05C10.1C05C10.1n/achrII 9,918,735contains similarity to Pfam domain PF00328 Histidine acid phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000560 (Histidine acid phosphatase)
38F19C7.4F19C7.4n/achrIV 4,604,373contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
39F22G12.5F22G12.5n/achrI 13,172,567contains similarity to Interpro domain IPR001765 (Carbonic anhydrase)
40F46G10.2F46G10.2n/achrX 13,325,413contains similarity to Interpro domain IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold)
41F32B5.2F32B5.2n/achrI 2,698,698
42ugt-59R11A8.3n/achrIV 10,362,030C. elegans UGT-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43cmk-1K07A9.2n/achrIV 1,829,288cmk-1 encodes a Ca+2/calmodulin-dependent protein kinase I (CaMK1); CMK-1 activity is required, cell autonomously and downstream of the cyclic nucleotide-gated channel TAX-4, for several aspects of AFD thermosensory neuron differentiation, including expression of the gcy-8 guanylyl cyclase and nhr-38 nuclear hormone receptor genes and morphology of the AFD sensory endings; cmk-1 activity is thus also required for normal thermosensory behavior; a cmk-1::gfp reporter is expressed in head sensory and interneurons as well as in the ventral nerve cord; expression is seen specifically in the neurons of the thermosensory circuit, AFD, AIY, and AIZ; CMK-1 localizes exclusively to the cytoplasm.
44srh-7K09D9.7n/achrV 4,009,007C. elegans SRH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45mrp-6F20B6.3n/achrX 4,182,153C. elegans MRP-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00664 (ABC transporter transmembrane region) (2), PF00005 (ABC transporter) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR011527 (ABC transporter, transmembrane region, type 1), IPR001140 (ABC transporter, transmembrane region), IPR009147 (Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
46egrh-1C27C12.2n/achrX 14,847,486C27C12.2 is orthologous to the human gene BA436D10.3 (EARLY GROWTH RESPONSE 2 (KROX-20 (DROSOPHILA) HOMOLOG)) (EGR2; OMIM:129010), which when mutated leads to disease.
47srz-70C09G12.6n/achrIV 3,478,198C. elegans SRZ-70 protein ;
48F11A5.4F11A5.4n/achrV 16,195,957contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit), IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR013753 (Ras)
49srd-70F48F5.4n/achrV 20,450,660C. elegans SRD-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50unc-14K10D3.2n/achrI 7,125,516The unc-14 gene encodes an activity required for both axonogenesis and sex myoblast migration.