UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F22B3.5F22B3.52e-88chrIV 11,416,056contains similarity to Interpro domains IPR001304 (C-type lectin), IPR006583 (CW)
2C43H6.7C43H6.7n/achrX 2,400,426contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domains IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type), IPR016201 (Plexin-like fold)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4C41D11.6C41D11.6n/achrI 4,461,426
5clec-93ZK39.4n/achrI 11,143,094C. elegans CLEC-93 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
6C41H7.4C41H7.4n/achrII 3,004,748contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
7T07F12.2T07F12.2n/achrX 4,891,246contains similarity to Pfam domain PF02225 PA domain contains similarity to Interpro domain IPR003137 (Protease-associated PA)
8bath-39F25H9.4n/achrV 13,460,604C. elegans BATH-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
9F52H2.4F52H2.4n/achrX 2,546,392contains similarity to Pfam domain PF00474 Sodium:solute symporter family contains similarity to Interpro domains IPR010979 (Ribosomal protein S13-like, H2TH), IPR001734 (Na+/solute symporter)
10C26E1.1C26E1.1n/achrV 13,297,767contains similarity to Rattus norvegicus GLUT4 vesicle protein.; TR:Q9Z1X1
11sprr-2F42D1.3n/achrX 14,802,137C. elegans SPRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12fbxb-100Y63D3A.2n/achrI 14,093,529This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
13F53A2.1F53A2.1n/achrIII 13,321,932contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114), IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
14ZK757.2ZK757.2n/achrIII 9,875,718contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
15C29G2.3C29G2.3n/achrV 2,581,907
16C43H6.4C43H6.4n/achrX 2,405,689
17ceh-20F31E3.1n/achrIII 6,980,772ceh-20 encodes the C. elegans ortholog of the homeodomain co-factor Extradenticle (Exd/Pbx); together with ceh-40 and unc-62, ceh-20 activity is required for embryonic viability; ceh-20 is also required as a cofactor for LIN-39- and MAB-5- dependent postembryonic mesoderm patterning; in addition, ceh-20 is required for regulating post-embryonic migrations of the Q neuroblast descendants and for regulating vulval development; a CEH-20::GFP fusion protein is expressed in embryos and postembryonically in many cell types including the Q, P, and V cells and their descendants; CEH-20 localizes to the nucleus.
18srx-3R03H4.3n/achrV 9,006,212C. elegans SRX-3 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19EEED8.4EEED8.4n/achrII 5,410,795contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
20T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
21col-72W09G10.1n/achrII 3,521,069C. elegans COL-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
22F41G3.2F41G3.2n/achrII 6,759,863
23K10H10.6K10H10.6n/achrII 14,504,011contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
24lips-12T13B5.6n/achrII 1,113,234C. elegans LIPS-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
25srx-41F59B1.7n/achrV 3,635,917C. elegans SRX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26ncs-1C44C1.3n/achrX 961,929The ncs-1 gene encodes a neuronal calcium sensor protein that, along with calcium, is essential for thermotaxis along isothermal paths in thermal gradients.
27F53G2.8F53G2.8n/achrII 2,483,639
28mog-4C04H5.6n/achrII 14,556,957The mog-4 gene encodes a DEAH helicase orthologous to the Drosophila CG10689 and the S. cerevisiae PRP2 proteins.
29F33D11.5F33D11.5n/achrI 5,836,021contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
30srt-15C50H11.10n/achrV 3,060,908C. elegans SRT-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31F21G4.5F21G4.5n/achrX 9,906,914contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
32F25D1.4F25D1.4n/achrV 10,543,032contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
33Y57G11A.4Y57G11A.4n/achrIV 14,484,352contains similarity to Interpro domain IPR005018 (DOMON related)
34T02G5.11T02G5.11n/achrII 7,080,284contains similarity to Pfam domain PF05741 Nanos RNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR008705 (Zinc finger, Nanos)
35F49H6.8F49H6.8n/achrV 17,022,485contains similarity to Rattus norvegicus Transcription factor 8 (Zinc finger homeodomain enhancer-bindingsprotein) (Zfhep).; SW:TCF8_RAT
36F54B11.4F54B11.4n/achrX 13,593,035contains similarity to Neurospora crassa Hypothetical protein.; TR:Q8X031
37T05H4.11T05H4.11n/achrV 6,425,085
38chw-1F22E12.2n/achrV 10,463,355C. elegans CHW-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR002041 (Ran GTPase), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
39rpb-4F43E2.2n/achrII 7,374,771C. elegans RPB-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03874 RNA polymerase Rpb4 contains similarity to Interpro domains IPR010997 (HRDC-like), IPR005574 (RNA polymerase II, Rpb4), IPR006590 (RNA polymerase II, Rpb4, core)
40F54B11.10F54B11.10n/achrX 13,582,322contains similarity to Conus arenatus Conotoxin scaffold VI/VII.; TR:Q9BP99
41lgc-40T24D8.1n/achrX 2,362,451C. elegans LGC-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
42F16D3.6F16D3.6n/achrI 8,376,505contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
43nhr-78F36A4.14n/achrIV 4,276,441C. elegans NHR-78 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44M199.2M199.2n/achrIV 15,109,806contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
45fbxb-76H02I12.2n/achrIV 11,378,732This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46T24H10.1T24H10.1n/achrII 9,099,835contains similarity to Pfam domains PF07500 (Transcription factor S-II (TFIIS), central domain) , PF08711 (Transcription elongation factor S-II protein N terminal) , PF01096 (Transcription factor S-II (TFIIS)) contains similarity to Interpro domains IPR001222 (Zinc finger, TFIIS-type), IPR003618 (Transcription elongation factor S-II, central region), IPR014754 (Transcription elongation factor, TFIIS, N-terminal, fungal-type), IPR003617 (Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal, sub-type), IPR014765 (Transcription elongation factor, TFIIS/CRSP70, N-terminal), IPR016492 (Transcription elongation factor, IIS), IPR006289 (Transcription elongation factor, TFIIS), IPR010990 (Transcription elongation factor, TFIIS/elongin A/CRSP70, N-terminal)
47F26D2.14F26D2.14n/achrV 16,436,268contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
48srz-74K03D3.1n/achrIV 16,330,219C. elegans SRZ-74 protein ;
49srw-117C44C3.6n/achrV 2,982,800C. elegans SRW-117 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50C05G5.3C05G5.3n/achrX 14,751,355contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Matrix-remodeling-associated protein 7; ENSEMBL:ENSP00000348050