UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F21D9.1F21D9.10chrV 19,267,093This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F39B3.2F39B3.2n/achrX 17,569,704contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
4F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
5C41C4.3C41C4.3n/achrII 8,110,504contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
6K06A9.3K06A9.3n/achrX 1,534,681contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
7T09E11.3T09E11.3n/achrI 12,369,888contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
8C36B7.1C36B7.1n/achrX 7,113,827contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
9T11F9.7T11F9.7n/achrV 11,476,386contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
10vps-32.2C37C3.3n/achrV 7,850,487C. elegans VPS-32.2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
11ZC482.3ZC482.3n/achrIII 12,762,606contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
12F54A5.2F54A5.2n/achrI 966,565contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
13gpa-5F53B1.7n/achrX 2,119,972gpa-5 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in AWA, with faint expression in ASI.
14tpi-1Y17G7B.7n/achrII 12,038,108tpi-1 encodes a putative triosephosphate isomerase orthologous to human TPI1 (OMIM:190450, mutated in TPI deficiency) and Drosophila WASTED AWAY; despite the severity of TPI mutant phenotypes in humans and Drosophila, TPI-1 has no obvious function in mass RNAi assays.
15R102.6R102.6n/achrIV 10,699,884contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
16nhr-96F44C8.11n/achrV 2,234,310nhr-96 encodes a member of the superfamily of nuclear receptors, which is one of the most abundant class of transcriptional regulators; nuclear receptors have a well conserved DNA binding domain and a less conserved C-terminal ligand binding domain.
17H12I19.4H12I19.4n/achrIV 14,147,395contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
18F49E12.8F49E12.8n/achrII 8,393,450contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0335; TR:O15044
19F52H2.7F52H2.7n/achrX 2,569,600contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR001565 (Synaptotagmin), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
20str-177T18H9.4n/achrV 9,198,343C. elegans STR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21srh-200F07C4.13n/achrV 7,652,983C. elegans SRH-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22W04G5.9W04G5.9n/achrI 11,644,012contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
23C27C12.4C27C12.4n/achrX 14,855,245contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
24fbxa-171C38D9.1n/achrV 17,564,573This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
25clk-1ZC395.2n/achrIII 5,278,572clk-1 encodes the C. elegans ortholog of COQ7/CAT5, a highly conserved demethoxyubiquinone (DMQ) hydroxylase that is necessary for the biosynthesis of ubiquinone (coenzyme Q, Q9) from 5-demethoxyubiquinone (DMQ9); in C. elegans, CLK-1 activity is required for normal physiological rates of growth, development, behavior, and aging, as well as for normal brood sizes.
26Y11D7A.8Y11D7A.8n/achrIV 9,252,608contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
27M04C9.4M04C9.4n/achrI 9,356,115contains similarity to Bos taurus Osteopontin precursor (Bone sialoprotein 1).; SW:OSTP_BOVIN
28str-247B0213.9n/achrV 3,954,734C. elegans STR-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29srh-186F36G9.2n/achrV 15,956,387C. elegans SRH-186 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30F52H2.1F52H2.1n/achrX 2,574,893
31tax-4ZC84.2n/achrIII 9,183,509tax-4 is orthologous to the human gene ROD PHOTORECEPTOR CGMP-GATED CHANNEL (CNGA1; OMIM:123825), which when mutated leads to disease.
32pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
33pkc-1F57F5.5n/achrV 12,019,252pkc-1 encodes a serine/threonine protein kinase that is orthologous to mammalian protein kinase C epsilon (PRKCE), a member of the nPKC subgroup of the protein kinase C superfamily; together with UNC-13, PKC-1 may act downstream of goa-1 to modulate phorbol ester-induced stimulation of acetylcholine release at NMJs; PKC-1 positively regulates locomotion, and affects thermotaxis and chemotaxis together with kin-11; PKC-1 is required for regulating several behaviors including sensation of volatile and soluble compounds, osmolarity, and temperature (thermosensation); PKC-1 is also required for phorbolester-induced stimulation of acetylcholine release at neuromuscular junctions; PKC-1 localizes to the processes and cell bodies of approximately 75 sensory neurons and interneurons, and pkc-1 mRNA is detectable at varying levels during larval and adult stages.
34T21D11.1T21D11.1n/achrIII 7,246,672contains similarity to Pfam domain PF00413 Matrixin contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
35zag-1F28F9.1n/achrIV 3,858,673zag-1 encodes a homeodomain protein of the ZFH class which consists of a homeodomain flanked by two clusters of C2H2-type zinc fingers and is related to transcriptional repressors encoded by Drosophila zfh-1 and the vertebrate ZEB genes; ZAG-1 is required for locomotion, for neuronal differentiation, and for proper axonal branching and fasciculation; from late embryogenesis through adult stages of development, ZAG-1 is expressed dynamically in head and tail neurons and in the intestinal and anal depressor muscles.
36C25A1.12C25A1.12n/achrI 10,192,090contains similarity to Pfam domain PF00561 alpha/beta hydrolase fold contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase), IPR002410 (Peptidase S33, prolyl aminopeptidase)
37C50H11.13C50H11.13n/achrV 3,070,772contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
38F54B11.7F54B11.7n/achrX 13,600,836contains similarity to Neurospora crassa GTP cyclohydrolase I (EC 3.5.4.16) (GTP-CH-I).; SW:GCH1_NEUCR
39T11F9.1T11F9.1n/achrV 11,460,688contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40srh-111F08E10.6n/achrV 17,484,578C. elegans SRH-111 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F46F5.8F46F5.8n/achrII 821,517
42C35A5.5C35A5.5n/achrV 10,506,811contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
43aps-1F29G9.3n/achrV 6,018,404aps-1 encodes an adaptin: specifically, it encodes an ortholog of the sigma1 subunit of adaptor protein complex 1 (AP-1).
44srh-41Y54G11A.12n/achrII 14,286,480C. elegans SRH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000264 (Serum albumin), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45T07G12.4T07G12.4n/achrIV 10,537,682contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
46mom-1T07H6.2n/achrX 6,295,619mom-1 encodes a predicted O-acyltransferase that is orthologous to Porcupine proteins conserved across a wide range of species; MOM-1 functions as part of a Wnt/MAPK signaling pathway that is required maternally for endoderm induction in the early embryo; by homology, MOM-1 is predicted to be a membrane-spanning endoplasmic reticulum protein that stimulates post-translational processing of Wnt signaling molecules such as MOM-2; embryonic mosaic analysis indicates that MOM-1 activity is required in the signaling cell, P2, for proper specification of endoderm, consistent with its predicted role in processing MOM-2/Wnt.
47nhr-164C41G6.5n/achrV 15,234,803C. elegans NHR-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
48sre-12T07H8.7n/achrV 6,978,417C. elegans SRE-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001680 (WD40 repeat)
49F13D12.8F13D12.8n/achrII 11,731,826contains similarity to White spot syndrome virus WSSV473 (Major virion protein VP19).; TR:Q8QTB2
50C26D10.4C26D10.4n/achrII 8,331,544contains similarity to Pfam domains PF08544 (GHMP kinases C terminal) , PF00288 (GHMP kinases N terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001174 (Galactokinase/homoserine kinase), IPR006204 (GHMP kinase), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold), IPR013750 (GHMP kinase, C-terminal)