UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1F21A3.4F21A3.42e-89chrV 15,537,300contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC338999 isoform 2; HI:HIT000389435
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F44D12.8F44D12.8n/achrIV 10,024,253contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of MAP7 domain-containing protein 1; ENSEMBL:ENSP00000362244
4F25C8.1F25C8.1n/achrV 20,903,971contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
5F11F1.4F11F1.4n/achrIII 13,401,247contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
6F49F1.12F49F1.12n/achrIV 4,142,374contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
7F26A1.4F26A1.4n/achrIII 4,818,558contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
8C50E10.2C50E10.2n/achrII 12,306,600contains similarity to Pfam domain PF06887 (Protein of unknown function (DUF1265))
9Y43F8A.2Y43F8A.2n/achrV 19,373,855contains similarity to Homo sapiens Cytokine receptor common beta chain precursor; ENSEMBL:ENSP00000262825
10F36H12.14F36H12.14n/achrIV 5,263,576
11C49A1.3C49A1.3n/achrI 14,218,454contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
12cwp-1C37H5.10n/achrV 4,840,930cwp-1 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
13F59B2.12F59B2.12n/achrIII 9,019,194contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
14K10H10.7K10H10.7n/achrII 14,507,311contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
15clc-4T05A10.2n/achrX 10,783,378clc-4 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; CLC-4 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
16T04A8.13T04A8.13n/achrIII 4,709,804contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
17T05A7.6T05A7.6n/achrII 4,670,226contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
18srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19C18E9.8C18E9.8n/achrII 8,986,939C18E9.8 is orthologous to the human gene JOINED TO JAZF1 (JJAZ1; OMIM:606245), which when mutated leads to disease.
20Y54E2A.7Y54E2A.7n/achrII 14,772,378contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA Helicase; identified as an ExtraCellular Mutant; homology exists between ECM32 and two other identified DNA helicases, DNA2 and NAM7; SGD:YER176W
21T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
22C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
23T22H9.3T22H9.3n/achrV 345,542contains similarity to Pfam domains PF02170 (PAZ domain) , PF02171 (Piwi domain) contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
24T05D4.5T05D4.5n/achrIII 13,582,099contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein), IPR000533 (Tropomyosin)
25C47E8.1C47E8.1n/achrV 14,666,582
26W06F12.3W06F12.3n/achrIII 13,735,661contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
27kin-26T06C10.6n/achrIV 7,876,748C. elegans KIN-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
28Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
29B0432.11B0432.11n/achrII 294,279contains similarity to Interpro domain IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding)
30cyp-25A3C36A4.3n/achrIII 3,838,517C. elegans CYP-25A3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
31ZK1010.5ZK1010.5n/achrIII 12,985,882contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
32nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
33F49F1.10F49F1.10n/achrIV 4,138,758contains similarity to Pfam domain PF00337 Galactoside-binding lectin contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
34ZK1225.4ZK1225.4n/achrI 13,215,147contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8EL91
35fbxa-202T28C12.3n/achrV 6,328,019This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
36C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
37ZC581.7ZC581.7n/achrI 6,661,388contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
38R10D12.10R10D12.10n/achrV 13,957,221contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
39C16C8.8C16C8.8n/achrII 3,461,412
40Y39F10A.3Y39F10A.3n/achrII 782,448contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
41scl-7C39E9.5n/achrIV 13,070,819C. elegans SCL-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
42C15H11.1C15H11.1n/achrV 14,394,129contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
43srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44Y40H4A.2Y40H4A.2n/achrV 14,584,349contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
45C07E3.4C07E3.4n/achrII 10,361,814contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
46F47B3.1F47B3.1n/achrI 3,972,934contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
47K08C9.1K08C9.1n/achrI 11,485,648
48Y45F10B.2Y45F10B.2n/achrIV 13,595,366contains similarity to Mycoplasma pulmonis Hypothetical protein MYPU_6700.; TR:Q98PP9
49C48B6.4C48B6.4n/achrI 6,890,348contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
50C15A11.2C15A11.2n/achrI 7,388,033contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CF92