UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F20C5.4F20C5.40chrIV 8,766,075contains similarity to Pfam domain PF03381 LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family contains similarity to Interpro domain IPR005045 (Protein of unknown function DUF284, transmembrane eukaryotic)
2H20E11.2H20E11.2n/achrIV 6,828,617contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003366 (CUB-like region)
3F56B3.8F56B3.8n/achrIV 774,932contains similarity to Pfam domains PF00181 (Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain) , PF03947 (Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002171 (Ribosomal protein L2), IPR008991 (Translation protein SH3-like), IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR014722 (Translation protein SH3-like, subgroup)
4tag-184F18C5.3n/achrII 6,550,797C. elegans TAG-184 protein; contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
5fbxa-157C06H5.2n/achrV 17,900,819This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
6Y75B12B.3Y75B12B.3n/achrV 15,186,069contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
7srh-67T21B4.6n/achrII 12,509,457C. elegans SRH-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8W04G5.5W04G5.5n/achrI 11,635,717contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
9C50F2.2C50F2.2n/achrI 3,885,072contains similarity to Interpro domain IPR002951 (Atrophin)
10F53A2.9F53A2.9n/achrIII 13,357,930contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
11R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
12coq-6K07B1.2n/achrV 9,337,783coq-6 encodes a putative flavin-dependent aromatic-ring monooxygenase, homologous to yeast COQ6; COQ-6 is required for ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis and for normally short lifespan; coq-6(RNAi) animals have reduced levels of coenzyme Q9 and superoxide, and have abnormally long lifespans.
13sru-16Y45F10B.4n/achrIV 13,581,181C. elegans SRU-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
14srh-247C31B8.13n/achrV 2,933,658C. elegans SRH-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15F49E7.2F49E7.2n/achrX 1,096,278
16clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17K09E3.1K09E3.1n/achrX 17,126,661
18C33H5.1C33H5.1n/achrIV 7,809,904contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
19F53H4.3F53H4.3n/achrX 15,886,572contains similarity to Mus musculus Ataxin-1 (Spinocerebellar ataxia type 1 protein homolog).; SW:ATX1_MOUSE
20his-68T23D8.6n/achrI 9,989,347his-68 encodes an H2A histone.
21ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
22T18D3.6T18D3.6n/achrX 12,450,290contains similarity to Streptomyces coelicolor Chromosomal replication initiator protein dnaA.; SW:DNAA_STRCO
23Y40H7A.3Y40H7A.3n/achrIV 15,162,987contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
24R74.6R74.6n/achrIII 4,203,243contains similarity to Pfam domains PF03465 (eRF1 domain 3) , PF03464 (eRF1 domain 2) , PF03463 (eRF1 domain 1) contains similarity to Interpro domains IPR004405 (Probable translation factor pelota), IPR005140 (eRF1 domain 1), IPR005141 (eRF1 domain 2), IPR005142 (eRF1 domain 3)
25tag-324C27C12.5n/achrX 14,850,888C. elegans TAG-324 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
26ugt-11T19H12.10n/achrV 4,893,822C. elegans UGT-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
27C29F9.8C29F9.8n/achrIII 96,559
28Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
29F09F9.4F09F9.4n/achrX 4,125,084contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I)
30srz-74K03D3.1n/achrIV 16,330,219C. elegans SRZ-74 protein ;
31W08F4.10W08F4.10n/achrII 590,892contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
32C17G10.2C17G10.2n/achrII 5,595,518contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
33unc-8R13A1.4n/achrIV 7,200,978unc-8 encodes an amiloride-sensitive DEG/ENaC cation-selective channel subunit orthologous to human ENaCB (OMIM:600760, associated with Liddle syndrome, an autosomal dominant form of hypertension); UNC-8 is predicted to function as part of a mechanically gated channel that responds to stretch, and is required for modulating the sinusoidal body wave that is characteristic of C. elegans locomotion; unc-8 interacts genetically with unc-1 and unc-24, which encode stomatin-like proteins, and with mec-6, which encodes a paraoxonase; UNC-8 is expressed in motor neurons, sensory neurons, and interneurons in the nerve ring; UNC-8 may form a channel with the degenerin DEL-1, with which it is coexpressed in ventral cord motor neurons.
34nhr-256ZK697.2n/achrV 1,745,848C. elegans NHR-256 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35srx-16T07H8.1n/achrV 6,976,849C. elegans SRX-16 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36srz-32W05E7.2n/achrIV 3,437,096C. elegans SRZ-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
37C49A9.5C49A9.5n/achrIV 6,215,077contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
38F44E5.3F44E5.3n/achrII 11,763,830contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000304160
39str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40B0379.2B0379.2n/achrI 10,071,342contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Possible role for UBP3 in controlling the activity or assembly of the SIR protein complex.; SGD:YER151C
41D1007.8D1007.8n/achrI 4,604,894contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold)
42M02G9.3M02G9.3n/achrII 10,319,023contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
43T16G12.4T16G12.4n/achrIII 10,058,154contains similarity to Treponema denticola FlhB.; TR:Q9APY7
44srh-77DC2.6n/achrV 224,988C. elegans SRH-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45K09A9.4K09A9.4n/achrX 15,593,283contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
46srh-72ZC204.5n/achrII 1,639,907C. elegans SRH-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47W04G3.7W04G3.7n/achrX 11,084,822contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
48K07E8.7K07E8.7n/achrII 645,697contains similarity to Pfam domain PF00849 RNA pseudouridylate synthase contains similarity to Interpro domains IPR006145 (Pseudouridine synthase), IPR006224 (Pseudouridine synthase, conserved site), IPR002942 (RNA-binding S4), IPR006225 (Pseudouridine synthase, RluD)
49F07E5.5F07E5.5n/achrII 2,056,499contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
50sra-29F18C5.8n/achrII 6,575,011C. elegans SRA-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)