UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F20A1.1F20A1.19.999999999999999e-31chrV 7,051,922
2ZK809.1ZK809.1n/achrIV 11,642,874contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
3C10G11.1C10G11.1n/achrI 6,307,930
4F13H8.6F13H8.6n/achrII 6,285,852
5ZC190.8ZC190.8n/achrV 8,687,699contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
6mps-3T06A4.2n/achrI 761,378mps-3 encodes a single-pass transmembrane protein that is related to the vertebrate KCNE proteins, also known as MinK-related peptides (MiRPs) that associate with, and regulate, pore-forming ion channels; mps-1 is required for the normal function of several neurons and thus for normal body touch sensation, chemotaxis to select molecules, osmotic avoidance, and nose-touch; when coexpressed in tissue culture cells with C. elegans KVS-1, MPS-3 is able to alter the activity of this potassium-selective channel, suggesting that MPS-3 functions in vivo to regulate KVS-1 activity in neurons in which the two proteins are coexpressed; in addition, activity of MPS-2, MPS-3, and KVS-1 coexpressed in culture suggests that these three proteins can form a functional ternary complex that genetic analyses indicate likely plays a role in regulating responsiveness to sodium; MPS-3 reporter fusions are expressed in the ADF amphid sensory neuron, the PVC and PVN neurons, and two neurons in the anterior bulb of the pharynx.
7C07A12.2C07A12.2n/achrX 4,545,119
8F35A5.2F35A5.2n/achrX 3,805,400
9flp-3W07E11.2n/achrX 10,092,469flp-3 encodes nine copies of a GTMRFamide-containing peptide that is predicted to function as a neuropeptide that inhibits pharyngeal action potential in a manner similar to octopamine without having a significant effect on basal resting membrane potential; expressed in three pairs of neurons IL1D, OL1, URB.
10F52E1.2F52E1.2n/achrV 8,411,177contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR001304 (C-type lectin), IPR002353 (Type II antifreeze protein)
11T15H9.4T15H9.4n/achrII 9,612,560contains similarity to Interpro domains IPR002951 (Atrophin), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
12F19C7.5F19C7.5n/achrIV 4,596,309
13Y54E2A.5Y54E2A.5n/achrII 14,756,797
14D2045.5D2045.5n/achrIII 10,468,691contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
16ZC412.9ZC412.9n/achrV 14,881,691contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
17Y57G11B.3Y57G11B.3n/achrIV 14,572,262contains similarity to Pfam domain PF00042 Globin contains similarity to Interpro domains IPR012292 (Globin), IPR009050 (Globin-like), IPR013314 (Globin, lamprey/hagfish type), IPR000971 (Globin, subset)
18F36G9.15F36G9.15n/achrV 15,987,734contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
19F19B6.3F19B6.3n/achrIV 12,327,905contains similarity to Lactococcus lactis Unknown protein.; TR:Q9CF64
20clec-236Y70C5C.5n/achrV 16,720,176C. elegans CLEC-236 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21sbt-1T03D8.3n/achrV 20,823,688C. elegans SBT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05281 Neuroendocrine protein 7B2 precursor (Secretogranin V) contains similarity to Interpro domain IPR007945 (Neuroendocrine 7B2 precursor)
22fipr-14F13E9.2n/achrIV 10,877,191C. elegans FIPR-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005137 (Photosystem I assembly BtpA)
23tag-329C50F4.3n/achrV 9,535,638C. elegans TAG-329 protein; contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
24C14C6.2C14C6.2n/achrV 563,724contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) , PF01549 (ShK domain-like) (2)contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
25R09E10.2R09E10.2n/achrIV 10,317,896contains similarity to Pfam domain PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase)
26K02B12.6K02B12.6n/achrI 8,519,194contains similarity to Schistosoma mansoni Putative eggshell protein (Fragment).; SW:P08016
27C09H10.9C09H10.9n/achrII 11,105,179
28Y54E2A.9Y54E2A.9n/achrII 14,785,517contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
29H12D21.2H12D21.2n/achrV 14,888,059contains similarity to Tetrahymena thermophila Micronuclear linker histone polyprotein (MIC LH) [Contains:sMicronuclear linker histone-alpha; Micronuclear linker histone-beta;sMicronuclear linker histone-delta; Micronuclear linker histone-gamma].; SW:P40631
30F41G3.10F41G3.10n/achrII 6,749,016contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
31K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
32C26B2.2C26B2.2n/achrIV 8,021,582
33M7.8M7.8n/achrIV 11,094,455contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
34C53D6.5C53D6.5n/achrIV 9,026,997contains similarity to Enterococcus hirae V-type sodium pump subunit F (EC 3.6.3.14) (Na(+)-translocating ATPasessubunit F).; SW:P43437
35F09B9.1F09B9.1n/achrX 10,140,628contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
36R155.2R155.2n/achrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
37C55B7.10C55B7.10n/achrI 6,502,907contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
38F56F4.3F56F4.3n/achrI 6,142,912contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR002208 (SecY protein), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
39R07C3.13R07C3.13n/achrII 927,201
40F21F3.1F21F3.1n/achrI 4,909,304contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR000720 (Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013017 (NHL repeat, subgroup), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR001258 (NHL repeat)
41C17C3.5C17C3.5n/achrII 5,552,099contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
42F21F8.5F21F8.5n/achrV 8,265,454
43F37E3.3F37E3.3n/achrI 6,430,598contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
44F39G3.4F39G3.4n/achrV 4,725,680contains similarity to Pfam domain PF03188 Cytochrome b561 contains similarity to Interpro domains IPR004877 (Cytochrome b561), IPR006593 (Cytochrome b561 / ferric reductase transmembrane)
45clec-142K01C8.8n/achrII 8,279,792C. elegans CLEC-142 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
46Y41C4A.11Y41C4A.11n/achrIII 11,721,632Y41C4A.11 encodes a divergent paralog of F38E11.5, the beta' (beta-prime) subunit of the coatomer (COPI) complex; unlike F38E11.5, Y41C4A.11 has no obvious function in mass RNAi assays.
47C02H7.2C02H7.2n/achrX 734,085contains similarity to Pfam domains PF00001 (7 transmembrane receptor (rhodopsin family)) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48C18H2.1C18H2.1n/achrIII 7,667,218contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) (2), PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
49ZK795.2ZK795.2n/achrIV 12,557,986contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
50T27E4.6T27E4.6n/achrV 9,071,672contains similarity to Interpro domain IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)