UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F18G5.5F18G5.53e-155chrX 9,256,665
2nhr-119K12H6.1n/achrII 2,799,024C. elegans NHR-119 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3C31G12.4C31G12.4n/achrV 18,177,707contains similarity to Pfam domain PF00646 (F-box domain)
4F54D12.2F54D12.2n/achrII 1,399,803contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
5C42C1.3C42C1.3n/achrIV 12,269,969contains similarity to Trypanosoma cruzi Hypothetical protein.; TR:Q4CVC5
6R06C1.6R06C1.6n/achrI 11,950,040contains similarity to Saccharomyces cerevisiae CCR4 Associated Factor 120 kDa; SGD:YNL278W
7cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
8srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
10ins-39F21E9.4n/achrX 1,344,119ins-39 encodes an insulin-like peptide.
11Y62H9A.13Y62H9A.13n/achrX 11,918,504contains similarity to Homo sapiens Hu-Claspin; ENSEMBL:ENSP00000251195
12Y7A5A.3Y7A5A.3n/achrX 15,783,069
13M163.1M163.1n/achrX 14,503,087contains similarity to Mus musculus Adapter-related protein complex 3 beta 1 subunit (Beta-adaptin 3A)s(AP-3 complex beta-3A subunit) (Beta-3A-adaptin).; SW:A3B1_MOUSE
14B0524.2B0524.2n/achrIII 1,896,968contains similarity to Pfam domain PF01734 Patatin-like phospholipase contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin)
15srh-61T21B4.8n/achrII 12,515,614C. elegans SRH-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001360 (Glycoside hydrolase, family 1)
16T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
17T24C4.4T24C4.4n/achrIII 873,063contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domains IPR008368 (Voltage-dependent calcium channel, gamma subunit), IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
18C43G2.4C43G2.4n/achrIV 6,562,982contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
19C26F1.6C26F1.6n/achrV 7,772,218C26F1.6 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C26F1.6 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
20sri-36F33H12.5n/achrII 2,584,688C. elegans SRI-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21T05A7.7T05A7.7n/achrII 4,680,482contains similarity to Interpro domain IPR000118 (Granulin)
224R79.24R79.2n/achrIV 17,481,819contains similarity to Pfam domains PF00071 (Ras family) , PF08477 (Miro-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR006688 (ADP-ribosylation factor), IPR002041 (Ran GTPase), IPR013753 (Ras), IPR006687 (GTP-binding protein SAR1), IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR013684 (Miro-like), IPR003578 (Ras small GTPase, Rho type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type)
23R04A9.1R04A9.1n/achrX 405,128
24T02E9.1T02E9.1n/achrV 11,351,210contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25T08B6.5T08B6.5n/achrIV 4,890,263contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
26srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
27ZK353.3ZK353.3n/achrIII 8,396,275
28F09C6.3F09C6.3n/achrV 16,879,465contains similarity to Saccharomyces cerevisiae DNA damage-responsive protein, expression is increased in response to heat-shock stress or treatments that produce DNA lesions; SGD:YMR173W
29clec-175R08C7.6n/achrIV 4,424,420C. elegans CLEC-175 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
30F56H6.6F56H6.6n/achrI 12,295,311contains similarity to Mus musculus N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferases(EC 2.4.1.149) (Poly-N-acetyllactosamine extension enzyme) (I-beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase) (iGnT) (UDP-GlcNAc:betaGal beta-s1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 1).; SW:Q8BWP8
31lgc-30F58H7.3n/achrIV 932,249C. elegans LGC-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
32ZC155.2ZC155.2n/achrIII 5,219,635contains similarity to Interpro domains IPR000164 (Histone H3), IPR009072 (Histone-fold)
33F14D7.1F14D7.1n/achrV 14,289,203contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
34C29F5.5C29F5.5n/achrII 6,297,911
35K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
36BE10.1BE10.1n/achrIII 12,788,458contains similarity to Homo sapiens PRO2015; TR:Q9P185
37F18C5.4F18C5.4n/achrII 6,564,443contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
38C16D9.6C16D9.6n/achrV 8,249,274contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9520-PA;; FLYBASE:CG9520
39C01B12.4C01B12.4n/achrII 7,948contains similarity to Interpro domain IPR005178 (Protein of unknown function DUF300)
40H32C10.1H32C10.1n/achrIV 5,935,928contains similarity to Interpro domains IPR006353 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, CECR5), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA)
41H04M03.11H04M03.11n/achrIV 5,883,356
42F28C10.4F28C10.4n/achrX 539,044
43Y57G11C.23Y57G11C.23n/achrIV 14,858,495contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44Y8A9A.2Y8A9A.2n/achrII 3,798,109contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000694 (Proline-rich region)
45T21E3.2T21E3.2n/achrI 3,931,189contains similarity to Homo sapiens 55 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000273725
46fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
47C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
48str-66Y73C8C.5n/achrV 3,103,680C. elegans STR-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49F28H7.4F28H7.4n/achrV 10,746,917contains similarity to Interpro domain IPR011893 (SelT/selW/selH selenoprotein)
50C35A11.2C35A11.2n/achrV 5,387,617