UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F18E2.1F18E2.10chrV 12,758,672contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR015914 (Purple acid phosphatase, N-terminal), IPR004843 (Metallophosphoesterase)
2F02H6.1F02H6.1n/achrIV 14,200,489contains similarity to Human herpesvirus 8 ORF73.; TR:Q91LX9
3bath-13F40B1.1n/achrII 2,521,505C. elegans BATH-13 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
4F30F8.1F30F8.1n/achrI 7,834,052contains similarity to Mus musculus Nuclear factor of activated T cells 5 (T cell transcription factorsNFAT5) (NF-AT5) (Rel domain-containing transcription factor NFAT5).; SW:NFT5_MOUSE
5T09E11.9T09E11.9n/achrI 12,348,814contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
6Y40H7A.3Y40H7A.3n/achrIV 15,162,987contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
7unc-8R13A1.4n/achrIV 7,200,978unc-8 encodes an amiloride-sensitive DEG/ENaC cation-selective channel subunit orthologous to human ENaCB (OMIM:600760, associated with Liddle syndrome, an autosomal dominant form of hypertension); UNC-8 is predicted to function as part of a mechanically gated channel that responds to stretch, and is required for modulating the sinusoidal body wave that is characteristic of C. elegans locomotion; unc-8 interacts genetically with unc-1 and unc-24, which encode stomatin-like proteins, and with mec-6, which encodes a paraoxonase; UNC-8 is expressed in motor neurons, sensory neurons, and interneurons in the nerve ring; UNC-8 may form a channel with the degenerin DEL-1, with which it is coexpressed in ventral cord motor neurons.
8sel-12F35H12.3n/achrX 917,054sel-12 encodes a transmembrane domain protein orthologous to presenilins; during gonadal, germline, and vulval development, sel-12 functions, within receiving cells, to positively regulate lin-12 and glp-1 Notch-like signaling pathways; sel-12 presenilin activity and/or levels are likely regulated by the SET/NAP protein sub-family member encoded by spr-2, as mutations in sel-12 are suppressed by mutations in spr-2; spr-2 regulation of sel-12 occurs in a hop-1 presenilin dependent manner.
9fbxa-157C06H5.2n/achrV 17,900,819This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
10T12E12.1T12E12.1n/achrIV 5,554,964contains similarity to Pfam domain PF01485 IBR domain contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
11C33H5.1C33H5.1n/achrIV 7,809,904contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
12C47F8.6C47F8.6n/achrI 12,320,092contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
13srh-72ZC204.5n/achrII 1,639,907C. elegans SRH-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14H20E11.2H20E11.2n/achrIV 6,828,617contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003366 (CUB-like region)
15srh-247C31B8.13n/achrV 2,933,658C. elegans SRH-247 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F48G7.4F48G7.4n/achrV 620,860
17W03C9.1W03C9.1n/achrII 11,961,452contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
18age-1B0334.8n/achrII 11,523,196age-1 encodes the C. elegans ortholog of the phosphoinositide 3-kinase (PI3K) p110 catalytic subunit; AGE-1, supplied maternally and embryonically, is a central component of the C. elegans insulin-like signaling pathway, lying downstream of the DAF-2/insulin receptor and upstream of both the PDK-1 and AKT-1/AKT-2 kinases and the DAF-16 forkhead type transcription factor, whose negative regulation is the key output of the insulin signaling pathway; in accordance with its role in insulin signaling, AGE-1 activity is required for regulation of metabolism, life span, dauer formation, stress resistance, salt chemotaxis learning, fertility, and embryonic development; although the age-1 expression pattern has not yet been reported, ectopic expression studies indicate that pan-neuronal age-1 expression is sufficient to rescue life-span defects, while neuronal, intestinal, or muscle expression can partially rescue dauer formation, and neuronal or muscle expression can rescue metabolic defects.
19T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
20F41H8.1F41H8.1n/achrV 834,574contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21srw-69F18E3.5n/achrV 7,428,134C. elegans SRW-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22T19D12.7T19D12.7n/achrII 6,648,354contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
23K07C11.10K07C11.10n/achrV 8,226,436contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein isoform 1; ENSEMBL:ENSP00000381337
24F20C5.4F20C5.4n/achrIV 8,766,075contains similarity to Pfam domain PF03381 LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family contains similarity to Interpro domain IPR005045 (Protein of unknown function DUF284, transmembrane eukaryotic)
25H14E04.4H14E04.4n/achrIII 2,391,147
26fbxa-71T20H9.3n/achrIII 2,256,678C. elegans FBXA-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
27him-14ZK1127.11n/achrII 7,067,448him-14 encodes a germline-specific member of the MutS family of DNA mismatch repair (MMR) proteins that is orthologous to human MSH4 and Saccharomyces cerevisiae Msh4p; during the pachytene stage of meiosis, HIM-14 activity is required for promoting crossing over between homologous chromosomes and thus, for chiasmata formation and proper chromosome segregation; in contrast, HIM-14 activity does not appear to be required for mismatch repair, nor for chromosome pairing or synapsis; him-14 mRNA expression is detected exclusively in the germline.
28W04G5.5W04G5.5n/achrI 11,635,717contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
29srj-21F28H7.11n/achrV 10,745,530C. elegans SRJ-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30srj-10F14H3.1n/achrV 16,073,333C. elegans SRJ-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31elks-1F42A6.9n/achrIV 3,346,268elks-1 encodes the C. elegans homolog of the vertebrate ELKS (glutamine, leucine, lysine, and serine-rich) proteins; although loss of elks-1 activity results in no obvious developmental or behavioral abnormalities, the ELKS-1 C-terminus interacts with the PDZ domain of UNC-10/RIM in vitro, and in vivo each protein appears to play a nonessential role in localizing the other to the presynaptic active zone; in addition to the active zone, ELKS-1 also localizes to the pharyngeal basal lamina.
32T18D3.6T18D3.6n/achrX 12,450,290contains similarity to Streptomyces coelicolor Chromosomal replication initiator protein dnaA.; SW:DNAA_STRCO
33C35D10.1C35D10.1n/achrIII 4,880,584contains similarity to Interpro domain IPR013784 (Carbohydrate-binding-like fold)
34Y56A3A.30Y56A3A.30n/achrIII 11,976,478contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG6004-PB;; FLYBASE:CG6004
35C29E6.4C29E6.4n/achrIV 11,881,077contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
36srx-7C14C6.1n/achrV 561,828C. elegans SRX-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37Y73C8C.10Y73C8C.10n/achrV 3,126,667contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal), IPR002343 (Paraneoplastic encephalomyelitis antigen)
38D1065.1D1065.1n/achrV 4,075,636contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
39C50F2.2C50F2.2n/achrI 3,885,072contains similarity to Interpro domain IPR002951 (Atrophin)
40AH10.4AH10.4n/achrV 14,137,472contains similarity to Methanosarcina acetivorans Hypothetical protein MA1935.; TR:Q8TPH7
41W04A8.2W04A8.2n/achrI 13,840,793contains similarity to Streptococcus pyogenes Putative type I site-specific deoxyribonuclease hsdS subunit.; TR:Q8K5V9
42F56B3.8F56B3.8n/achrIV 774,932contains similarity to Pfam domains PF00181 (Ribosomal Proteins L2, RNA binding domain) , PF03947 (Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002171 (Ribosomal protein L2), IPR008991 (Translation protein SH3-like), IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR014722 (Translation protein SH3-like, subgroup)
43C35C5.6C35C5.6n/achrX 11,566,764contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2478-PA;; FLYBASE:CG2478
44F15A8.7F15A8.7n/achrX 4,443,129contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
45ddl-2Y48E1B.1n/achrII 13,545,140C. elegans DDL-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
46elpc-3ZK863.3n/achrV 12,180,438C. elegans ELPC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF04055 (Radical SAM superfamily) , PF00583 (Acetyltransferase (GNAT) family) contains similarity to Interpro domains IPR007197 (Radical SAM), IPR006638 (Elongator protein 3/MiaB/NifB), IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR005910 (Histone acetyltransferase ELP3)
47Y47D3B.4Y47D3B.4n/achrIII 11,407,290contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
48clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49str-112F10D2.4n/achrV 7,137,353C. elegans STR-112 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50F40G12.4F40G12.4n/achrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)