UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F16B12.5F16B12.50chrX 14,100,488contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3B0524.6B0524.6n/achrIII 1,903,905
4T22F3.10T22F3.10n/achrV 3,608,429contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
5C05B5.5C05B5.5n/achrIII 10,002,152This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
6ugt-10T19H12.11n/achrV 4,899,135C. elegans UGT-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
7F26D11.1F26D11.1n/achrV 7,982,245contains similarity to Pfam domain PF01202 Shikimate kinase contains similarity to Interpro domains IPR000623 (Shikimate kinase), IPR006001 (Carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase)
8F33H12.1F33H12.1n/achrII 2,601,167contains similarity to Pfam domain PF00533 BRCA1 C Terminus (BRCT) domain contains similarity to Interpro domain IPR001357 (BRCT)
9srh-8K09D9.8n/achrV 4,006,527C. elegans SRH-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR005394 (P2Y12 purinoceptor)
10T13C5.4T13C5.4n/achrX 6,192,236T13C5.4 encodes a paired-like homeodomain protein of the Q50 class, which has no obvious function in mass RNAi assays.
11srh-270F37B4.5n/achrV 2,860,866C. elegans SRH-270 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12srg-45C51F7.2n/achrV 12,308,051C. elegans SRG-45 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
13Y75B12B.3Y75B12B.3n/achrV 15,186,069contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
14F27D9.3F27D9.3n/achrX 7,651,282
15Y39A1A.22Y39A1A.22n/achrIII 10,705,056contains similarity to Pfam domains PF03124 (EXS family) , PF03105 (SPX domain) contains similarity to Interpro domains IPR004342 (EXS, C-terminal), IPR004331 (SPX, N-terminal)
16D1005.6D1005.6n/achrX 1,463,763
17C14B1.5C14B1.5n/achrIII 3,708,022C14B1.5 encodes an ortholog of S. cerevisiae YIL103 and human DPH2L1/OVCA1 (OMIM:603527, deleted or downregulated in ovarian tumors); C14B1.5 is paralogous to S. cerevisiae DPH2/YKL191W, a protein component of diphtamide synthesis; C14B1.5 has no obvious function in mass RNAi assays.
18F29C12.6F29C12.6n/achrII 13,129,953contains similarity to Helicobacter pylori Cytotoxicity associated immunodominant antigen (120 kDa protein)s(CAG pathogenicity island protein 26).; SW:CAGA_HELPY
19ZK892.3ZK892.3n/achrII 10,002,830contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
20M01B2.10M01B2.10n/achrV 15,261,657contains similarity to Homo sapiens Phytanoyl-CoA 2-hydroxylase-interacting protein-like; ENSEMBL:ENSP00000362987
21tag-143ZK856.9n/achrV 10,211,282C. elegans TAG-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF04438 HIT zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR007529 (Zinc finger, HIT-type)
22F22H10.5F22H10.5n/achrX 16,687,280contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
23Y18D10A.9Y18D10A.9n/achrI 12,855,664contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
24sri-4C05E4.4n/achrV 749,407C. elegans SRI-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25tgt-1ZK829.6n/achrIV 11,958,629tgt-1 encodes a tRNA-guanine transglycosylase predicted to be mitochondrial.
26E03H12.9E03H12.9n/achrIV 4,990,834contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
27nspc-14F42F12.7n/achrX 12,358,778C. elegans NSPC-14 protein ;
28gpa-4T07A9.7n/achrIV 403,531gpa-4 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ASI.
29ZC395.4ZC395.4n/achrIII 5,270,595contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
30F56A8.1F56A8.1n/achrIII 13,252,041contains similarity to Pfam domain PF04547 Protein of unknown function, DUF590 contains similarity to Interpro domain IPR007632 (Protein of unknown function DUF590)
31R102.6R102.6n/achrIV 10,699,884contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
32F22H10.6F22H10.6n/achrX 16,690,126
33srh-200F07C4.13n/achrV 7,652,983C. elegans SRH-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34Y116A8C.25Y116A8C.25n/achrIV 17,076,616contains similarity to Pfam domain PF03881 Fructosamine kinase contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR005581 (Fructosamine kinase)
35srd-68F09C6.7n/achrV 16,901,990C. elegans SRD-68 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
36C07D8.2C07D8.2n/achrX 7,362,559contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
37cah-5R173.1n/achrX 7,021,932cah-5 encodes a member of the carbonic anhydrase family.
38C53C11.1C53C11.1n/achrX 17,340,978contains similarity to Interpro domain IPR010993 (Sterile alpha motif homology)
39srh-41Y54G11A.12n/achrII 14,286,480C. elegans SRH-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000264 (Serum albumin), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F16D3.4F16D3.4n/achrI 8,366,932F16D3.4 encodes a putative beta-tubulin folding cofactor D, orthologous to human TBCD (OMIM:604649); in early embryos, F16D3.4 is required for normally rapid microtubule elongation; F16D3.4 may be a ligand and effector of the ARL2 ortholog EVL-20; F16D3.4 is expressed in larval and adult pharynx, intestine, and neurons; in mass RNAi assays, F16D3.4 is required for normal mitotic spindle elongation, embryonic and larval viability, fertility, locomotion, body shape, vulval development, and cuticular integrity.
41T05B4.13T05B4.13n/achrV 4,126,750contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
42str-177T18H9.4n/achrV 9,198,343C. elegans STR-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43twk-3M110.2n/achrII 8,211,638C. elegans TWK-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2)
44his-34F17E9.9n/achrIV 8,336,138his-34 encodes an H2B histone; his-34 is contained within the histone gene cluster HIS5.
45K09F5.4K09F5.4n/achrX 7,710,385
46T10G3.4T10G3.4n/achrV 13,483,233contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
47VW02B12L.2VW02B12L.2n/achrII 11,439,443contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
48cdh-1R10F2.1n/achrIII 2,923,253cdh-1 encodes a cadherin that is similar, in the extracellular domain, to the Drosophila cadherin Dachsous (Ds); although the precise role of cdh-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, loss of cdh-1 activity via RNAi using the hypersensitive rrf-3 strain can result in locomotion and growth defects, as well as larval lethality.
49C50H11.13C50H11.13n/achrV 3,070,772contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
50C14C6.13C14C6.13n/achrV 573,386