UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srbc-15F15E11.104e-148chrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
2C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981
3C30E1.2C30E1.2n/achrX 16,927,410
4Y116A8C.1Y116A8C.1n/achrIV 16,901,344contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
5T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
6srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
7T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
9T06E8.2T06E8.2n/achrV 10,036,032
10Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
11C32B5.3C32B5.3n/achrII 981,863
12srh-99C46E10.7n/achrII 3,715,771C. elegans SRH-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13srd-28M01B2.2n/achrV 15,251,113C. elegans SRD-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
14F52D2.5F52D2.5n/achrX 1,974,154
15T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
16C05D9.4C05D9.4n/achrX 1,108,239
17Y16B4A.2Y16B4A.2n/achrX 14,766,829contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
18F58A6.2F58A6.2n/achrII 5,137,627
19T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
20M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
21K09C4.9K09C4.9n/achrX 3,271,553
22nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
23srw-76W06G6.6n/achrV 16,637,565C. elegans SRW-76 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
24C41G6.12C41G6.12n/achrV 15,207,410contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
25F52F10.4F52F10.4n/achrV 1,544,140contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
26rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
27srj-44T03D3.11n/achrV 2,845,216C. elegans SRJ-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28ZK1010.4ZK1010.4n/achrIII 12,982,581contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
29T07A5.1T07A5.1n/achrIII 10,304,668contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
30B0336.12B0336.12n/achrIII 5,710,236
31F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
32W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
33C48A7.2C48A7.2n/achrIV 7,395,373contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domains IPR000804 (Clathrin adaptor, sigma subunit/coatomer, zeta subunit), IPR001204 (Phosphate transporter)
34F56C4.1F56C4.1n/achrIV 10,638,106contains similarity to Brachydanio rerio D121 protein (Fragment).; TR:Q90ZG9
35cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
36glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
37Y44A6D.1Y44A6D.1n/achrV 20,782,907contains similarity to Escherichia coli TraT.; TR:Q7WUD7
38sra-7AH6.11n/achrII 9,545,368C. elegans SRA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
39str-71T23F1.4n/achrV 15,458,547C. elegans STR-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40nhr-156C17E7.1n/achrV 3,906,529C. elegans NHR-156 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type)
41M02B1.2M02B1.2n/achrIV 12,846,951contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV233 hypothetical protein.; TR:Q9YVK8
42W09C3.3W09C3.3n/achrI 4,708,334contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
43srsx-2F20E11.2n/achrV 17,437,669C. elegans SRSX-2 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44srt-37F47D2.8n/achrV 4,280,809C. elegans SRT-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
45srx-131F09F3.2n/achrV 13,846,060C. elegans SRX-131 protein ;
46fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
47B0284.3B0284.3n/achrIII 4,380,175contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
48nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49dhs-27C04F6.5n/achrX 3,415,914dhs-27 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
50H35N09.2H35N09.2n/achrX 8,604,813