UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F14F9.6F14F9.61e-72chrV 5,148,306
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3D2089.3D2089.3n/achrII 10,663,519contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC150383; ENSEMBL:ENSP00000325301
4C40H1.3C40H1.3n/achrIII 9,328,239contains similarity to Homo sapiens Protein; VG:OTTHUMP00000003630
5R10D12.6R10D12.6n/achrV 13,949,458contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
6T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
7W03G1.8W03G1.8n/achrIV 527,981
8srw-113ZK1037.9n/achrV 15,333,837C. elegans SRW-113 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
9B0496.1B0496.1n/achrIV 7,446,888contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
10nhr-159C17E7.7n/achrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11F59D6.4F59D6.4n/achrV 3,030,897contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
12nhr-219T19A5.5n/achrV 8,966,534C. elegans NHR-219 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13srb-1C27D6.10n/achrII 5,170,361C. elegans SRB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
14T23H2.4T23H2.4n/achrI 6,455,456
15dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
16T11G6.5T11G6.5n/achrIV 10,839,263contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
17srbc-11C18B10.1n/achrV 7,494,565C. elegans SRBC-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19str-63C17B7.1n/achrV 3,352,167C. elegans STR-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21nhr-223T26E4.8n/achrV 15,796,934C. elegans NHR-223 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
22T25F10.4T25F10.4n/achrV 6,761,420contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
23F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
24elks-1F42A6.9n/achrIV 3,346,268elks-1 encodes the C. elegans homolog of the vertebrate ELKS (glutamine, leucine, lysine, and serine-rich) proteins; although loss of elks-1 activity results in no obvious developmental or behavioral abnormalities, the ELKS-1 C-terminus interacts with the PDZ domain of UNC-10/RIM in vitro, and in vivo each protein appears to play a nonessential role in localizing the other to the presynaptic active zone; in addition to the active zone, ELKS-1 also localizes to the pharyngeal basal lamina.
25C35C5.2C35C5.2n/achrX 11,539,654contains similarity to Pfam domains PF04389 (Peptidase family M28) , PF02225 (PA domain) , PF04253 (Transferrin receptor-like dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR007365 (Transferrin receptor-like, dimerisation), IPR007484 (Peptidase M28), IPR003137 (Protease-associated PA)
26ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
27M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
28sre-6F28H7.9n/achrV 10,761,699C. elegans SRE-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
29srb-8F37C12.15n/achrIII 7,172,652C. elegans SRB-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
30math-50ZK250.8n/achrII 1,957,153math-50 encodes a protein which has a meprin-associated Traf homology (MATH) domain and may be involved in apoptosis.
31str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F35E12.2F35E12.2n/achrV 13,723,593contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
33B0228.9B0228.9n/achrII 7,762,795
34him-14ZK1127.11n/achrII 7,067,448him-14 encodes a germline-specific member of the MutS family of DNA mismatch repair (MMR) proteins that is orthologous to human MSH4 and Saccharomyces cerevisiae Msh4p; during the pachytene stage of meiosis, HIM-14 activity is required for promoting crossing over between homologous chromosomes and thus, for chiasmata formation and proper chromosome segregation; in contrast, HIM-14 activity does not appear to be required for mismatch repair, nor for chromosome pairing or synapsis; him-14 mRNA expression is detected exclusively in the germline.
35K02E2.1K02E2.1n/achrV 20,348,590contains similarity to Salmo salar NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 2 (EC 1.6.5.3).; SW:NU2M_SALSA
36ZK721.3ZK721.3n/achrX 8,785,606
37C03D6.1C03D6.1n/achrI 9,669,662contains similarity to Canine parvovirus Coat protein VP1 [Contains: Coat protein VP2].; SW:COAT_PAVC7
38F28D1.8F28D1.8n/achrIV 12,388,613contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype)
39F26A1.6F26A1.6n/achrIII 4,816,522contains similarity to Lumbricus rubellus Amine oxidase-like protein (Fragment).; TR:Q94610
40T09F5.2T09F5.2n/achrV 15,151,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae cell wall mannoprotein; SGD:YOR009W
41T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
42xnp-1B0041.7n/achrI 4,668,742xnp-1 encodes an ATP-dependent DNA helicase of the SNF2 family that is orthologous to human XNP/ATR-X, which is associated with a number of X-linked mental retardation syndromes; in C. elegans, xnp-1 activity is required at high temperatures for embryogenesis, somatic gonad development, fertility, and vulval morphogenesis; in addition, animals doubly mutant for xnp-1 and lin-35/Rb, hpl-2/HP1, or nucleosome remodelling and histone deacetylase (NuRD) complex members such as lin-53 and let-418, display larval arrest with growth cessation but continued cell proliferation; xnp-1 is also required, with lin-35/Rb and hpl-2/HP1, for proper regulation of transgene expression; xnp-1 mRNA, detectable in embryos and the germline by in situ hybridization, is expressed at highest levels in embryos with decreasing levels seen in successive larval stages; xnp-1 transcriptional reporter fusions exhibit strong expression beginning at mid-embryogenesis but fading by embryonic morphogenesis; at hatching, expression is observed in all dividing cells including the P lineage, and at later larval stages expression is observed in the vulval precursor cells.
43Y59C2A.1Y59C2A.1n/achrII 2,210,488contains similarity to Pfam domain PF00246 Zinc carboxypeptidase contains similarity to Interpro domains IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A), IPR009020 (Proteinase inhibitor, propeptide), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44srh-74C45B11.4n/achrV 11,047,962C. elegans SRH-74 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45srx-19T05A12.1n/achrIV 6,874,033C. elegans SRX-19 protein ;
46Y75B8A.31Y75B8A.31n/achrIII 12,353,159contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of UPF0528 protein C5orf21 precursor; ENSEMBL:ENSP00000265139
47R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
48K07C11.10K07C11.10n/achrV 8,226,436contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein isoform 1; ENSEMBL:ENSP00000381337
49nhr-111F44G3.9n/achrV 16,123,891nhr-111 encodes a member of the nuclear receptor superfamily; by homology, NHR-111 is predicted to function as a ligand-dependent transcriptional regulator, but as loss of nhr-111 activity via large-scale RNAi screens does not result in any abnormalities, the precise role of NHR-111 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; an nhr-111 reporter construct is expressed in embryos and early larvae in a pair of neurons in the ventral ganglion of the head and in two cells that may be the somatic gonad precursors.
50lgc-20B0491.4n/achrII 11,341,749C. elegans LGC-20 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)