UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F14F9.5F14F9.55e-177chrV 5,128,571contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domain IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
2C05B5.1C05B5.1n/achrIII 9,987,900contains similarity to Clostridium acetobutylicum Membrane associated chemotaxis sensory transducer protein (MSPsdomain and HAMP domain).; TR:Q97JD4
3kin-26T06C10.6n/achrIV 7,876,748C. elegans KIN-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
4C18G1.3C18G1.3n/achrV 4,762,839contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
5nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6T15H9.5T15H9.5n/achrII 9,610,953contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q55FI4
7F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
8R13F6.5R13F6.5n/achrIII 6,848,166contains similarity to Pfam domain PF01529 DHHC zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR001594 (Zinc finger, DHHC-type)
9ubc-24F49E12.4n/achrII 8,406,159ubc-24 encodes a predicted conjugating enzyme (UBCs/E2s) of the ubiquitin-conjugation system.
10clec-261ZC15.6n/achrV 20,287,601C. elegans CLEC-261 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000817 (Prion protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
11T01H3.5T01H3.5n/achrII 7,880,026T01H3.5 encodes an unfamiliar protein; T01H3.5 and T01H3.5 share an operon divergently transcribed from another operon containing vha-4.
12M110.7M110.7n/achrII 8,235,210contains similarity to Pfam domain PF01237 Oxysterol-binding protein contains similarity to Interpro domain IPR000648 (Oxysterol-binding protein)
13R13G10.4R13G10.4n/achrIII 3,827,770R13G10.4 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C01H6.6, C33D12.2, C52D10.12, M02F4.3, and R04E5.2; by orthology with MAM3, R13G10.4 may participate in metal homoeostasis; R13G10.4, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; R13G10.4 is required for normal development in mass RNAi assays.
14srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
17ani-1Y49E10.19n/achrIII 12,449,658ani-1 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-1 activity is required in the early embryo for cortical contractile events, including polar body extrusion, membrane ruffling, and pseudocleavage; at later stages of development, ANI-1 also plays a role in cuticle formation, coordinated locomotion, vulval development, and male tail formation; in regulating cortical events, ANI-1 appears to function by positively regulating septin (UNC-59 and UNC-61) localization to the contractile ring as well as formation of septin- and NMY-2-containing cortical patches; in telophase embryos, ANI-1 localizes to the cell cortex and cleavage furrow.
18F20D6.1F20D6.1n/achrV 8,191,303contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
19D2062.5D2062.5n/achrII 2,623,045
20clec-135C16A11.8n/achrII 4,257,930C. elegans CLEC-135 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
21T05C12.9T05C12.9n/achrII 8,192,426contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF02149 (Kinase associated domain 1) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001772 (Kinase-associated KA1), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
22F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
23C24D10.1C24D10.1n/achrIV 5,167,373contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
24H32C10.1H32C10.1n/achrIV 5,935,928contains similarity to Interpro domains IPR006353 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA, CECR5), IPR006357 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIA)
25C16C8.17C16C8.17n/achrII 3,441,631contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
26F14D7.1F14D7.1n/achrV 14,289,203contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domain IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)
27B0432.11B0432.11n/achrII 294,279contains similarity to Interpro domain IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding)
28Y23H5A.4Y23H5A.4n/achrI 2,618,955contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
29klp-17W02B12.7n/achrII 11,466,706klp-17 encodes a C-terminal kinesin motor protein orthologous to Drosophila NCD and Saccharomyces cerevisiae KAR3; by homology, KLP-17 is predicted to function as a minus-end directed motor; loss of klp-17 activity via RNAi results in embryonic lethality generally at the one- or two-cell stage with disorganized mitotic spindles and polyploid nuclei, suggesting that KLP-17 plays a role in chromosome segregation and germline development; in situ hybridization studies reveal that klp-17 mRNA is localized specifically to cell nuclei during early development, from the one-cell stage of embryogenesis until early larval stages; a klp-17::gfp transgene did not yield detectable GFP expression, but did result in a small percentage of morphologically abnormal males and intersexual animals that grew slowly and died upon reaching maturity, consistent with a role for klp-17 in chromosome dynamics.
30Y54E5A.3Y54E5A.3n/achrI 14,698,399contains similarity to Escherichia coli Orf732.; TR:Q46767
31C08E8.3C08E8.3n/achrV 18,351,418contains similarity to Clostridium perfringens Probable Ser-type protease.; TR:Q8XHC4
32F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
33T28D9.9T28D9.9n/achrII 6,484,502
34ferl-1T05E8.1n/achrI 5,457,629C. elegans FERL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) , PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
35T09A12.1T09A12.1n/achrIV 8,245,495contains similarity to Xenopus laevis DNA topoisomerase 1 (EC 5.99.1.2) (DNA topoisomerase I).; SW:P41512
36AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
37clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38K03H1.9K03H1.9n/achrIII 9,941,014contains similarity to Homo sapiens DAN15 protein; TR:Q99491
39skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
40snf-7ZK1010.9n/achrIII 13,008,187C. elegans SNF-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
41str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
44C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
45K05F1.1K05F1.1n/achrII 5,802,499contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
46F28A10.9F28A10.9n/achrII 834,544contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
47Y57G11C.14Y57G11C.14n/achrIV 14,800,135contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, highly expressed in the mutants lacking the telomerase component TLC1; potentially phosphorylated by Cdc28p; SGD:YLR467W
48W06F12.3W06F12.3n/achrIII 13,735,661contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49T08H10.1T08H10.1n/achrV 4,484,972contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
50C25G4.7C25G4.7n/achrIV 12,457,730contains similarity to Pfam domain PF06887 Protein of unknown function (DUF1265) contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR009676 (Protein of unknown function DUF1265)