UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F14D2.8F14D2.85e-167chrII 3,348,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
2F20C5.3F20C5.3n/achrIV 8,754,081contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
3F14H3.12F14H3.12n/achrV 16,074,705contains similarity to Pfam domain PF02149 Kinase associated domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001772 (Kinase-associated KA1)
4F19D8.2F19D8.2n/achrX 13,835,397contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q9UMN6 Myeloid/lymphoid or mixed-lineage leukemia protein 4; ENSEMBL:ENSP00000222270
5F53H2.1F53H2.1n/achrV 20,385,929contains similarity to Pfam domain PF05218 Protein of unknown function (DUF713) contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR007883 (Protein of unknown function DUF713)
6C24H10.4C24H10.4n/achrX 5,058,527
7dnj-4C01G8.4n/achrI 5,283,025This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
8str-227C07G3.3n/achrV 3,518,993C. elegans STR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9Y57G7A.8Y57G7A.8n/achrII 1,291,464
10ccdc-55C16C10.6n/achrIII 4,167,827C. elegans CCDC-55 protein ; contains similarity to Mus musculus Coiled-coil domain-containing protein 55.; SW:Q5NCR9
11F36G9.3F36G9.3n/achrV 15,958,350contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
12F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
13math-7C16C4.12n/achrII 1,885,961C. elegans MATH-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
14ZK632.9ZK632.9n/achrIII 9,825,065contains similarity to Barley yellow dwarf virus Coat protein.; SW:COAT_BYDVN
15K01A2.6K01A2.6n/achrII 300,268
16C47D12.5C47D12.5n/achrII 11,685,843
17str-139ZC513.9n/achrV 8,061,503C. elegans STR-139 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002091 (Aromatic amino acid permease)
18ZK930.2ZK930.2n/achrII 11,892,790contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
19srd-16C04E6.9n/achrV 5,899,272C. elegans SRD-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20F26F12.2F26F12.2n/achrV 5,838,075
21K08D8.1K08D8.1n/achrIV 12,893,458contains similarity to Fusobacterium nucleatum Tryptophanase (EC 4.1.99.1).; TR:Q8RHQ6
22ZK1240.4ZK1240.4n/achrII 2,315,354
23EEED8.13EEED8.13n/achrII 5,411,874contains similarity to Interpro domain IPR011038 (Calycin-like)
24hlh-12C28C12.8n/achrIV 8,478,993C. elegans HLH-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR002418 (Transcription regulator Myc)
25C46E10.8C46E10.8n/achrII 3,726,646contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
26ZK686.1ZK686.1n/achrIII 7,773,406contains similarity to Interpro domain IPR004038 (Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45)
27F56H6.4F56H6.4n/achrI 12,291,320contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
28F07G11.2F07G11.2n/achrV 7,304,229contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
29F14H12.7F14H12.7n/achrX 4,362,080
30C09G9.7C09G9.7n/achrIV 8,878,734contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
31M116.1M116.1n/achrIV 8,411,585
32W03G11.2W03G11.2n/achrX 12,107,432contains similarity to Pfam domain PF03381 LEM3 (ligand-effect modulator 3) family / CDC50 family contains similarity to Interpro domain IPR005045 (Protein of unknown function DUF284, transmembrane eukaryotic)
33F21F8.2F21F8.2n/achrV 8,275,167contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
34H25K10.6H25K10.6n/achrIV 16,235,400contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35F15D4.2F15D4.2n/achrII 13,216,307contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Protein ENDO16 (Fragment).; SW:P13665
36C53B4.6C53B4.6n/achrIV 8,985,786contains similarity to Pfam domain PF08449 UAA transporter family contains similarity to Interpro domain IPR013657 (UAA transporter)
37K09E2.1K09E2.1n/achrX 8,683,969contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
38srw-19T10H4.8n/achrV 15,280,555C. elegans SRW-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39sqv-3R10E11.4n/achrIII 9,779,478sqv-3 encodes a beta(1,4)-galactosyltransferase, biochemically active in vitro, that is required for cytokinesis of one-cell embryos, vulval morphogenesis, and chondroitin synthesis; SQV-3 is orthologous to human human galactosyltransferase I (B4GALT7; OMIM:604327, mutated in the progeroid form of Ehlers-Danlos syndrome); sqv-3 transgenically rescues hamster cells lacking galactosyl transferase I; the common requirement for SQV-3 in both cytokinesis and morphogenesis may be to promote filling an extracellular space with hygroscopic proteoglycans (either in the eggshell, or underneath the L4 cuticle), which in turn may cause the space to fill with fluid.
40F26H9.4F26H9.4n/achrI 9,306,326contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
41T13F2.6T13F2.6n/achrIV 9,779,719
42T05H10.1T05H10.1n/achrII 8,044,949contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR011051 (Cupin, RmlC-type)
43Y51B9A.8Y51B9A.8n/achrII 9,399,270contains similarity to Pfam domains PF04942 (CC domain) (2), PF01549 (ShK domain-like) contains similarity to Interpro domains IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
44C41G6.13C41G6.13n/achrV 15,208,853contains similarity to Homo sapiens Xylosyltransferase I; ENSEMBL:ENSP00000261381
45K02A2.1K02A2.1n/achrII 7,435,459contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
46mls-1H14A12.4n/achrIII 7,461,052mls-1 encodes a T-box transcription factor orthologous to members of the Tbx1 subfamily of T-box transcription factors (OMIM:602054, mutations in human TBX1 are associated with the developmental disorder DiGeorge syndrome (DGS)/velocardiofacial syndrome (VCFS)); MLS-1 is required for fate specification of the eight nonstriated uterine muscle cells generated during postembryonic development, and ectopic expression of MLS-1 is sufficient for uterine muscle specification in other mesodermal lineages; mls-1 reporter gene expression is detected in uterine progenitors and differentiated uterine muscles, Type 2 vulval muscles, the left and right intestinal muscles, and the anal depressor muscle; mls-1 expression is positively regulated by the basic helix-loop-helix transcription factors HLH-8/Twist and HLH-2/Daughterless.
47Y49A10A.1Y49A10A.1n/achrX 10,359,445contains similarity to Pfam domain PF06565 Repeat of unknown function (DUF1126) contains similarity to Interpro domains IPR010554 (Protein of unknown function DUF1126), IPR006602 (Region of unknown function DM10)
48T05A7.1T05A7.1n/achrII 4,678,765
49C53D6.6C53D6.6n/achrIV 9,030,151contains similarity to Pfam domain PF05699 hAT family dimerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR008906 (HAT dimerisation)
50nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.