UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F14D2.6F14D2.60chrII 3,331,956contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F09E5.2F09E5.2n/achrII 5,376,151contains similarity to Pfam domain PF00534 Glycosyl transferases group 1 contains similarity to Interpro domain IPR001296 (Glycosyl transferase, group 1)
4K02B2.6K02B2.6n/achrIV 5,961,963
5grl-28T24A6.15n/achrV 3,551,603grl-28 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
6kin-34R02C2.2n/achrV 245,158C. elegans KIN-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
7sre-50C50E10.11n/achrII 12,304,243C. elegans SRE-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
8srx-96T01D3.4n/achrV 13,712,245C. elegans SRX-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9str-170T08B6.7n/achrIV 4,878,848C. elegans STR-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10R03A10.5R03A10.5n/achrX 15,448,432contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
11F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
12srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13F49D11.4F49D11.4n/achrI 10,914,398contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
14C17A2.7C17A2.7n/achrII 3,842,652contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domains IPR004101 (Mur ligase, C-terminal), IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
15srt-38F47D2.6n/achrV 4,270,408C. elegans SRT-38 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16Y38H6A.3Y38H6A.3n/achrV 20,342,053contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
17T04G9.6T04G9.6n/achrX 783,076contains similarity to Interpro domain IPR001759 (Pentaxin)
18morc-1ZC155.3n/achrIII 5,205,271C. elegans MORC-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR003594 (ATP-binding region, ATPase-like)
19F36D4.6F36D4.6n/achrV 9,427,160
20srsx-37M01B2.7n/achrV 15,258,341C. elegans SRSX-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21srh-279F11A5.2n/achrV 16,193,941C. elegans SRH-279 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22tbx-32ZK380.1n/achrX 1,656,225C. elegans TBX-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
23F21A9.1F21A9.1n/achrI 3,712,645
24rbr-2ZK593.4n/achrIV 10,923,428rbr-2 encodes a histone H3 lysine 4 (H3K4) demethylase that is required for normally short lifespan and reliable vulval development, that regulates genome-wide levels of H3K4 trimethylation, and that interacts genetically with CLK-2, GLP-1, LIN-15, and SEM-5; RBR-2 is orthologous to budding yeast Jhd2p, Drosophila LID, and human JARID1A (OMIM:180202), JARID1B (OMIM:605393), JARID1C (OMIM:314690, mutated in mental retardation), and JARID1D (OMIM:426000); rbr-2(tm1231) homozygotes display excess trimethylated H3K4 (H3K4me3) and erratic vulval development (either vulvaless or multivulva); rbr-2(RNAi) animals show extended lifespans, a strong synthetic multivulva and H3K4me3 phenotype in a lin-15(n765ts) mutant background at permissive temperature, and abnormally slow growth with clk-2(mn159), glp-1(or178), or sem-5(n2019) mutant backgrounds.
25B0564.7B0564.7n/achrIV 13,102,647contains similarity to Aedes aegypti Cell cycle progression.; TR:Q16U20
26C32B5.6C32B5.6n/achrII 969,468
27str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
29nhr-249ZK381.3n/achrIV 6,972,292C. elegans NHR-249 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30phy-3T20B3.7n/achrV 16,836,164C. elegans PHY-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
31R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
32C23H4.4C23H4.4n/achrX 12,231,444contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR000062 (Thymidylate kinase), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
33sre-32W05H5.7n/achrII 12,455,773C. elegans SRE-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
34F10C2.3F10C2.3n/achrV 12,022,395contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
35srh-248H05B21.2n/achrV 2,954,922C. elegans SRH-248 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
36ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
37ZK402.3ZK402.3n/achrX 1,402,534contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
38bli-3F56C11.1n/achrI 150,659bli-3 encodes a large homolog of dual oxidase ('Ce-Duox1'), with an N-terminal peroxidase domain, two central calmodulin-binding EF hands, and a C-terminal superoxide-generating NADPH-oxidase domain; BLI-3 is required for dityrosine cross-linking of collagen, and thus for cuticular integrity; BLI-3 is thought to use cytosolic NADPH to generate reactive oxygen, which then drives the peroxidase ectodomain to cross-link free tyrosine in collagen; BLI-3 is expressed exclusively in hypodermal cells at low levels, with peaks of expression corresponding to collagen/cuticle biosynthesis.
39B0496.2B0496.2n/achrIV 7,448,558contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
40M18.6M18.6n/achrIV 12,122,042contains similarity to Interpro domain IPR003111 (Peptidase S16, lon N-terminal)
41F44D12.10F44D12.10n/achrIV 10,036,818contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
42ZK488.5ZK488.5n/achrV 594,476contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
43C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
44T07D10.3T07D10.3n/achrI 12,627,858contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
45F28C10.1F28C10.1n/achrX 543,683
46scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
47B0491.1B0491.1n/achrII 11,349,105contains similarity to Pfam domain PF05007 Mannosyltransferase (PIG-M) contains similarity to Interpro domain IPR007704 (Mannosyltransferase, DXD)
48srg-61C24B9.11n/achrV 2,739,518C. elegans SRG-61 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
49W02D9.9W02D9.9n/achrI 12,557,310contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter).; TR:Q8AAL0
50C47F8.3C47F8.3n/achrI 12,315,930contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)