UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F13G3.3F13G3.30chrI 7,298,454contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3K10D3.4K10D3.4n/achrI 7,137,354contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) , PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
4F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
5F57F5.3F57F5.3n/achrV 12,005,558contains similarity to Streptococcus pyogenes Putative histidine kinase.; TR:Q8P2Q1
6F41C3.7F41C3.7n/achrII 4,730,652
7dhs-25F09E10.3n/achrX 1,487,910dhs-25 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
8F32G8.4F32G8.4n/achrV 10,559,356contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
9Y47D3B.1Y47D3B.10.00000003chrIII 11,385,678contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008166 (Protein of unknown function DUF23), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
10arx-3Y79H2A.6n/achrIII 12,055,279arx-3 encodes the C. elegans ortholog of the p41Arc subunit of the actin-related protein (Arp)2/3 complex.
11T22G5.3T22G5.3n/achrV 13,882,397This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
12C13C12.2C13C12.2n/achrV 12,524,627contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
13srh-40Y40D12A.3n/achrIII 6,611,482C. elegans SRH-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14crb-1F11C7.4n/achrX 17,408,117crb-1 encodes a homolog of Drosophila CRUMBS that affects dauer formation and feeding behavior; CRB-1 can bind cyclic AMP-response element (CRE) sites and be phosphorylated by PKA in vitro, and is expressed immediately apical to the zonula adherens in embryos and then ubiquitously later during development and in adults; CRB-1 is homologous to human CRB1 (OMIM:604210, mutated in retinitis pigmentosa 12 or Leber congenital amaurosis).
15K07C11.4K07C11.4n/achrV 8,204,685contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
16C29F7.6C29F7.6n/achrX 13,439,091C29F7.6 encodes a putative histone H3 di/trimethyllysine-27 (H3K27me2/me3) demethylase; C29F7.6 contains a C-terminal JmjC domain, and is homologous to human JMJD3, UTX (OMIM:300128), and UTY (OMIM:400009); C29F7.6 is expected to antagonize transcriptional repression by polycomb repressor complexes, which mark stem cells (and presumably germline) by H3K27me3-mediated repression of somatic genes; however, C29F7.6 has no obvious function in mass RNAi assays.
17F55A4.5F55A4.5n/achrX 1,031,456contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
18F57B10.5F57B10.5n/achrI 6,563,176contains similarity to Pfam domain PF01105 emp24/gp25L/p24 family/GOLD contains similarity to Interpro domains IPR009038 (GOLD), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
19F42A6.6F42A6.6n/achrIV 3,336,420contains similarity to Pfam domain PF05603 Protein of unknown function (DUF775) contains similarity to Interpro domain IPR008493 (Protein of unknown function DUF775)
20C18H7.5C18H7.5n/achrIV 587,001
21ugt-53T03D3.1n/achrV 2,850,684C. elegans UGT-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR002416 (Bacterial general secretion pathway protein H), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
22H19J13.1H19J13.1n/achrX 12,268,942contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
23fbxb-55W03D2.2n/achrIV 4,069,157This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
24F09G8.3F09G8.3n/achrIII 8,266,869contains similarity to Pfam domain PF00380 Ribosomal protein S9/S16 contains similarity to Interpro domains IPR000754 (Ribosomal protein S9), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold)
25F18A11.3F18A11.3n/achrII 13,036,522contains similarity to Candida albicans Multidrug resistance protein CDR2.; SW:CDR2_CANAL
26F12F6.1F12F6.1n/achrIV 11,586,743contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
27npp-7T19B4.2n/achrI 5,694,480C. elegans NPP-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001876 (Zinc finger, RanBP2-type)
28snx-1C05D9.1n/achrX 1,130,709C. elegans SNX-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF09325 (Vps5 C terminal like) , PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR001683 (Phox-like), IPR013822 (Signal recognition particle, SRP54 subunit, helical bundle), IPR015404 (Vps5 C terminal like)
29F53A2.1F53A2.1n/achrIII 13,321,932contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114), IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
30ZK829.1ZK829.1n/achrIV 11,941,464contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
31F23B2.3F23B2.3n/achrIV 9,134,019contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
32T15B7.8T15B7.8n/achrV 6,822,465contains similarity to Ostreococcus tauri Predicted CDS, putative cytoplasmic protein family member, with ascoiled coil-4 domain, of ancient origin (ISS).; TR:Q010X5
33tap-1C44H4.5n/achrX 14,590,650C. elegans TAP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
34ZC328.1ZC328.1n/achrI 6,405,136
35T01A4.3T01A4.3n/achrI 4,465,379contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
36ugt-59R11A8.3n/achrIV 10,362,030C. elegans UGT-59 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
37K10H10.1K10H10.1n/achrII 14,491,241contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38T27A3.2T27A3.2n/achrI 6,112,337contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF00627 (UBA/TS-N domain) (2), PF02148 (Zn-finger in ubiquitin-hydrolases and other protein) contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR016652 (Ubiquitinyl hydrolase), IPR005924 (Arginase), IPR000449 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal), IPR001607 (Zinc finger, UBP-type), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
39rnf-1C06A5.9n/achrI 6,010,654C. elegans RNF-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
40folt-1C06H2.4n/achrV 11,142,257folt-1 encodes a folate transporter required for folate uptake; FOLT-1 is orthologous to human SLC19A1 (OMIM:600424), SLC19A2 (OMIM:603941, mutated in thiamine-responsive megaloblastic anemia syndrome), and SLC19A3 (OMIM:606152, mutated in biotin-responsive basal ganglia disease); heterologously expressed FOLT-1 transports folate in vitro; FOLT-1 activity is acid-dependent, is sodium-independent, and is inhibited by folate derivatives, sulfasalazine, or anion transport inhibitors such as 4,4''-diisothio-cyanatostilbene-2,2''-disulphonic acid (DIDS); folt-1(ok1460) and folt-1(RNAi) animals show significantly lowered folate uptake; folt-1 is expressed in several tissues, including (most strongly) pharynx and posterior intestine, as well as head, body wall, and vulva muscles, and gonad sheath cells; FOLT-1's intestinal expression diminishes with age from larvae to adults; both FOLT-1 intestinal expression and whole-animal folate uptake are lowered in folate-supplemented food media; FOLT-1 has no obvious function in mass RNAi assays, perhaps because of genetic redundancy with its paralogs FOLT-2 and FOLT-3; however, folt-1(ok1460) mutants are sluggish and sterile, which might instead indicate that FOLT-1 is required for locomotion and fertility.
41pac-1C04D8.1n/achrIII 8,508,167C. elegans PAC-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00620 (RhoGAP domain) , PF00169 (PH domain) contains similarity to Interpro domains IPR008936 (Rho GTPase activation protein), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000198 (RhoGAP)
42F13E6.5F13E6.5n/achrX 10,696,500contains similarity to Pfam domain PF01569 PAP2 superfamily contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR016118 (Phosphatidic acid phosphatase/chloroperoxidase, N-terminal)
43R05D3.9R05D3.9n/achrIII 8,365,541contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold)
44T10F2.4T10F2.4n/achrIII 5,171,158contains similarity to Pfam domains PF08606 (Prp19/Pso4-like) , PF00400 (WD domain, G-beta repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR003613 (U box), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR009053 (Prefoldin), IPR001680 (WD40 repeat), IPR013915 (Pre-mRNA-splicing factor 19), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
45F59B10.3F59B10.3n/achrII 10,511,687contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46F46G11.1F46G11.1n/achrX 5,794,401F46G11.1 is orthologous to the human gene TRUNCATED PUTATIVE T7-LIKE MITOCHONDRIAL DNA HELICASE (C10orf2; OMIM:606075), which when mutated leads to disease.
47tra-3LLC1.1n/achrIV 14,440,241tra-3 encodes an atypical calpain regulatory protease that lacks calcium-binding EF hand domains; during development, TRA-3 likely promotes female development in XX hermaphrodites by cleaving the membrane-associated TRA-2A protein to generate a TRA-2 peptide likely to have feminizing activity; in addition, TRA-3 is one of several proteases that mediate necrotic cell death during neurodegeneration.
48ZK470.6ZK470.6n/achrX 4,176,765
49math-21C40D2.3n/achrII 1,994,852C. elegans MATH-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
50R07B7.8R07B7.8n/achrV 12,082,679contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)