UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F10E7.3F10E7.32e-94chrII 7,124,926
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3R05F9.12R05F9.12n/achrII 4,919,859contains similarity to Pfam domains PF01055 (Glycosyl hydrolases family 31) , PF00088 (Trefoil (P-type) domain) contains similarity to Interpro domains IPR000519 (P-type trefoil), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR000322 (Glycoside hydrolase, family 31)
4T21C9.6T21C9.6n/achrV 10,584,474contains similarity to Pfam domains PF00391 (PEP-utilising enzyme, mobile domain) , PF01326 (Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR008279 (PEP-utilising enzyme, mobile region), IPR013815 (ATP-grasp fold, subdomain 1), IPR002192 (Pyruvate phosphate dikinase, PEP/pyruvate-binding), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2)
5amx-3F25C8.2n/achrV 20,896,026C. elegans AMX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR001613 (Flavin-containing amine oxidase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
6F02D8.4F02D8.4n/achrV 14,986,177contains similarity to Pfam domain PF00246 Zinc carboxypeptidase contains similarity to Interpro domains IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A), IPR009020 (Proteinase inhibitor, propeptide)
7C26E1.2C26E1.2n/achrV 13,306,168contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Eukaryotic thiol (cysteine) protease)
8F07A11.5F07A11.5n/achrII 11,613,153contains similarity to Pfam domain PF00294 pfkB family carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domains IPR011611 (Carbohydrate/purine kinase), IPR011877 (Ribokinase, bacterial), IPR002139 (Ribokinase)
9F56A12.2F56A12.2n/achrV 14,377,560contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
10col-103F56B3.1n/achrIV 763,047C. elegans COL-103 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000817 (Prion protein), IPR008160 (Collagen triple helix repeat), IPR013286 (Annexin, type VII)
11pxn-1ZK994.3n/achrV 8,498,505C. elegans PXN-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF07686 (Immunoglobulin V-set domain) , PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF00560 (Leucine Rich Repeat) (4), PF01462 (Leucine rich repeat N-terminal domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR010255 (Haem peroxidase), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR013106 (Immunoglobulin V-set), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
12srxa-2F56D5.10n/achrIV 9,423,882C. elegans SRXA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
13K08E3.4K08E3.4n/achrIII 13,760,645contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00241 (Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein) contains similarity to Interpro domains IPR002108 (Actin-binding, cofilin/tropomyosin type), IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
14sbp-1Y47D3B.7n/achrIII 11,435,265sbp-1 encodes a basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor homologous to the mammalian Sterol Regulatory Element Binding Proteins (SREBPs, OMIM:184756, overexpression of nuclear form of SREBP-1c is associated with insulin resistance and features of congenital generalized lipodystrophy); in C. elegans, SBP-1 activity is required for normal lipid metabolism and wild-type levels of lipogenic enzyme expression, as well as for embryonic and larval development; sbp-1 expression is detected exclusively in the intestine, the major site of fat storage, from early embryogenesis through adulthood.
15C44C8.1C44C8.1n/achrIV 904,383This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
16grd-14T01B10.2n/achrX 8,500,290grd-14 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground domain; the Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-14 is required for normal growth to full size, locomotion, and vulval morphogenesis; all of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
17B0286.3B0286.3n/achrII 4,371,091contains similarity to Pfam domains PF01259 (SAICAR synthetase) , PF00731 (AIR carboxylase) contains similarity to Interpro domains IPR001636 (SAICAR synthetase), IPR000031 (1-(5-Phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole-carboxylate (AIR) carboxylase), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2)
18F53C11.1F53C11.1n/achrV 13,776,738contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
19zig-6T03G11.8n/achrX 5,187,948zig-6 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; loss of zig-6 activity in large-scale RNAi screens results in a Clear phenotype; a zig-6::gfp reporter fusion is expressed in anterior and posterior body wall muscle.
20F59A2.6F59A2.6n/achrIII 3,420,133contains similarity to Pfam domains PF02524 (KID repeat) , PF01465 (GRIP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004089 (Chemotaxis methyl-accepting receptor, signalling), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin), IPR000237 (GRIP)
21T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
22cyp-35B1K07C6.4n/achrV 3,940,140C. elegans CYP-35B1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
23C05D12.2C05D12.2n/achrII 11,420,763contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006582 (Region of unknown fuction MD, Caenorhabditis elegans)
24T05C12.4T05C12.4n/achrII 8,178,909contains similarity to Interpro domain IPR003566 (T-cell surface glycoprotein CD5)
25F55A11.7F55A11.7n/achrV 11,785,988contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
26T06D8.10T06D8.10n/achrII 11,244,135contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR001007 (von Willebrand factor, type C)
27pmp-4T02D1.5n/achrIV 17,404,001The pmp-4 gene encodes a homolog of human ALD, which when mutated leads to X-linked adrenoleukodystrophy (OMIM:300100).
28C44C8.3C44C8.3n/achrIV 896,078This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
29mlt-7ZK430.8n/achrII 4,398,894C. elegans MLT-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) , PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
30C17H12.4C17H12.4n/achrIV 6,800,609contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
31F07C6.2F07C6.2n/achrIV 12,791,374contains similarity to Amblyomma hebraeum 9.8 kDa basic protein.; TR:Q9GPM1
32H03A11.1H03A11.1n/achrX 15,211,201H03A11.1 encodes an FAM20 ortholog; murine FAM20A is a secreted protein expressed in hematopoietic cells.
33C30B5.6C30B5.6n/achrII 6,220,573
34fbxa-59T12B5.8n/achrIII 942,155This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
35B0495.2B0495.2n/achrII 7,700,550contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR008351 (JNK MAP kinase), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
36C49C3.9C49C3.9n/achrIV 17,340,941contains similarity to Brassaiopsis tripteris NADH dehydrogenase subunit F (Fragment).; TR:Q85UX5
37E01G4.6E01G4.6n/achrII 13,483,996contains similarity to Caenorhabditis remanei P17 (Fragment).; TR:A0MIX2
38T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
39C18E9.9C18E9.9n/achrII 8,988,878contains similarity to Thermoplasma volcanium Hypothetical protein TV1312.; TR:Q978V3
40cut-4E04D5.3n/achrII 10,437,905C. elegans CUT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
41nas-38F57C12.1n/achrX 560,901C. elegans NAS-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
42C06G8.1C06G8.1n/achrIV 10,779,821contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domains IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
43dhs-30T25G12.7n/achrX 17,233,193dhs-30 encodes a member of the short-chain dehydrogenases/reductases family (SDR) homologous to HSD, which when mutated leads to cortisol 11-beta ketoreductase deficiency (OMIM:218030).
44rec-8W02A2.6n/achrIV 13,351,138rec-8 encodes a meiosis-specific cohesin complex subunit orthologous to Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe Rec8p; REC-8 is essential for pairing of homologoues and sister chromatids during meiosis and thus for proper chromosome disjunction; in the germline, REC-8 associates with chromatin of transition zone nuclei, and co-localizes with SMC-1 along the longitudinal axes of synapsed chromosomes at pachytene and in a cruciform pattern at diakinesis; REC-8 localization to chromatin is dependent upon TIM-1, a HEAT/Armadillo repeat-containing protein related to Drosophila TIMELESS, and additionally, REC-8 and SCC-3 are mutually required for chromatin localization; REC-8 cleavage and degradation during meiosis I is dependent on the AIR-2 aurora-like kinase and during meiosis II on AIR-2 and the PLK-1 polo-like kinase.
45C44C8.4C44C8.4n/achrIV 891,926This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46Y17G7B.8Y17G7B.8n/achrII 12,026,748contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain contains similarity to Interpro domain IPR001810 (Cyclin-like F-box)
47asg-2C53B7.4n/achrX 6,841,624asg-2 encodes a homolog of subunit G of the membrane-bound F0 proton channel portion of ATP synthase (mitochondrial respiratory chain [MRC] complex V); asg-2 activity is required for growth at a normally high rate and for normal osmoregulation; in addition, asg-2 activity is required for response to hermaphrodite contact, the first step in a series of stereotypical male mating behaviors; an ASG-2::GFP fusion localizes to mitochondria and to cilia of the male-specific CEM neurons.
48unc-31ZK897.1n/achrIV 12,780,334unc-31 encodes a pleckstrin homology (PH) domain-containing protein that is the C. elegans ortholog of human CADPS/CAPS (calcium-dependent activator protein for secretion OMIM:604667); UNC-31 functions in post-docking calcium-regulated dense-core vesicle fusion that is required for egg laying, locomotion, pharyngeal pumping, and recovery from the dauer larval stage; in addition, UNC-31 functions in the insulin receptor signaling pathway that regulates adult life span where it may control Ca[2+]-regulated secretion of an insulin-like ligand; UNC-31 is not required for synaptic vesicle exocytosis; unc-31::gfp transcriptional reporters are expressed in most, if not all, neurons, vulval muscles, vulval cells, the spermatheca, and secretory cells such as the uterine UV1 cells; UNC-31::GFP translational fusions localize to neuronal cell bodies, axonal projections and to sites of synaptic contact, consistent with other dense-core vesicle proteins.
49tag-290F35B12.6n/achrV 11,614,053C. elegans TAG-290 protein; contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
50ZK1058.9ZK1058.9n/achrIII 3,924,612contains similarity to Borrelia burgdorferi Probable O-sialoglycoprotein endopeptidase (EC 3.4.24.57)s(Glycoprotease).; SW:GCP_BORBU