UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ugt-38F10D2.70chrV 7,146,544C. elegans UGT-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
4ctl-1Y54G11A.6n/achrII 14,304,828ctl-1 encodes one of three C. elegans catalases; CTL-1 exhibits catalase activity in vitro, and thus likely functions in vivo as an antioxidant enzyme that protects cells from reactive oxygen species; ctl-1 activity contributes to the extended lifespan seen in daf-2 mutant animals; in addition, ctl-1 expression is negatively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling; as CTL-1 does not possess a C-terminal peroxisomal targeting signal (PTS), it is predicted to be a cytosolic catalase.
5T28C12.2T28C12.2n/achrV 6,330,074contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6M117.1M117.1n/achrIV 11,816,824contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7F32H5.4F32H5.4n/achrV 13,362,228contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
8AC8.4AC8.4n/achrX 227,022
9B0238.13B0238.13n/achrV 5,245,859contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
10pgp-14F22E10.3n/achrX 12,747,072pgp-14 encodes a member of the ABC transporter family with high similarity to the vertebrate MDR (multidrug resistance) family; PGP-14 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of pgp-14 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious defects, the precise role of pgp-14 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; pgp-14 promoter-gfp fusion proteins are expressed in larvae and adults in the anterior pharynx.
11inx-12ZK770.3n/achrI 3,757,299inx-12 (innexin=invertebrate connexin analogue) encodes a protein of the innexin family; innexins are gap junction proteins similar in function, though dissimilar in sequence to the vertebrate connexins; innexins are the only known gap junction proteins in invertebrates; inx-12 and inx-13 appear to be a tandom duplication; RNA interference of inx-12 results in an arrest at the L1 larval stage with fluid filled dead rods; this phenotype and sequence homology to Drosophila innexins suggest that INX-12 may be required to form gap junctions between the excretory canal and hypodermis, thus playing an essential role in osmoregulation; an INX-12::GFP fusion protein is expressed in the excretory canal.
12T01D3.1T01D3.1n/achrV 13,691,269contains similarity to Pfam domain PF00008 (EGF-like domain)
13daf-14F01G10.8n/achrIV 10,254,701daf-14 encodes a Smad-related protein that is unusual in that while its C-terminus is well-conserved with Smad proteins, it lacks the N-terminal DNA binding domain found in all other known Smads; DAF-14 is predicted to function as a transducer of the DAF-7/TGF-beta-mediated signal that promotes reproductive growth and negatively regulates dauer formation; as reduction of daf-14 function enhances the dauer constitutive phenotype of daf-8 mutants, and overexpression of daf-14 can rescue daf-8 mutant animals, it is likely that the DAF-14 and DAF-8 Smad proteins function in parallel to control dauer formation; further genetic analyses suggest that DAF-14 and DAF-8 function to antagonize the activities of the DAF-3 Smad and DAF-5 Sno/Ski oncoprotein, which are required for dauer formation; a DAF-14::GFP reporter is expressed in a dynamic pattern in tissues, such as the hypodermis, intestine, and pharynx, that are remodeled during dauer development.
14ZK652.8ZK652.8n/achrIII 7,842,935
15nhr-248ZK218.6n/achrV 17,103,987C. elegans NHR-248 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
16nhr-142F44E7.8n/achrV 5,787,730C. elegans NHR-142 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17glb-13F19H6.2n/achrX 12,374,995glb-13 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
18ins-26ZC334.1n/achrI 14,037,463ins-26 encodes an insulin-like peptide.
19mec-18C52B9.9n/achrX 4,272,688mec-18 encodes a protein similar to firefly luciferase and plant protein 4-coumarate coA ligase; mec-18 is involved in sensory mechanotransduction; genetic interactions with other mec genes suggest that mec-18 may be involved in negative regulation of the degenerin channel in the touch receptor neurons; mec-18 is expressed exclusively in the touch cells.
20cyp-33C7F41B5.2n/achrV 2,251,536C. elegans CYP-33C7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
21ZC239.15ZC239.15n/achrII 3,224,089contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
22nas-25F46C5.3n/achrII 8,827,065nas-25 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-25::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx and pharyngeal-intestinal valve.
23sgn-1F07H5.2n/achrII 8,782,783C. elegans SGN-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04790 Sarcoglycan complex subunit protein contains similarity to Interpro domain IPR006875 (Sarcoglycan complex subunit protein)
24unc-14K10D3.2n/achrI 7,125,516The unc-14 gene encodes an activity required for both axonogenesis and sex myoblast migration.
25K07G5.4K07G5.4n/achrI 7,167,846contains similarity to Interpro domain IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
26AC8.3AC8.3n/achrX 228,920
27T22H9.4T22H9.4n/achrV 335,754contains similarity to Pfam domain PF00751 DM DNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001275 (DM DNA-binding)
28unc-41C27H6.1n/achrV 9,971,233unc-41 encodes an ortholog of Drosophila STONED A (STNA) required for normal locomotion; a beta-strand in the mu-adaptin-like domain of UNC-41 binds the C2A domain of SNT-1, and this binding is required for SNT-1 endocytosis, punctate localization of UNC-41 in neurons, and transgenic rescue of unc-41(e268) animals; UNC-41 is also required for normal secretion of EGL-17 from P6.p cells, and for embryonic viability; UNC-41 is expressed in the larval and adult nervous system; UNC-41, like other stonins, is an adaptin, and by orthology with stonins is predicted to be a protein adaptor that helps sort SNT-1 endocytotically.
29C06E4.3C06E4.3n/achrIV 7,261,440contains similarity to Pfam domains PF07993 (Male sterility protein) , PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR013120 (Male sterility, NAD-binding)
30F13A2.4F13A2.4n/achrV 4,399,097
31mec-17F57H12.7n/achrIV 7,985,506mec-17 encodes a protein that has no clearly recognizable motifs yet shares a domain of similarity with an additional C. elegans protein as well as proteins from Drosophila, mouse, and human; MEC-17 activity is required for maintaining the differentiated state of the touch receptors, and hence the animal's touch sensitivity, during later stages of larval development; mec-17 is expressed solely in the touch receptor cells from late embryogenesis through adulthood, and this expression is dependent upon the MEC-3 LIM homeodomain transcription factor; in turn, as MEC-17 is necessary for maintaining differentiated touch receptors, its activity is required for continued expression of MEC-3 and the MEC-7 beta-tubulin.
32F38H4.3F38H4.3n/achrIV 11,845,293contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
33F25F6.1F25F6.1n/achrX 4,445,262
34R02F2.8R02F2.8n/achrIII 5,494,067contains similarity to Pfam domain PF01490 Transmembrane amino acid transporter protein contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR013057 (Amino acid transporter, transmembrane)
35F35B12.4F35B12.4n/achrV 11,609,661contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
36C30F2.3C30F2.3n/achrX 16,084,008contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q1MVQ9
37grsp-2T28C6.1n/achrIV 8,817,412C. elegans GRSP-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein), IPR001151 (GPR6 orphan receptor)
38F20D6.8F20D6.8n/achrV 8,166,494contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
39F13E9.10F13E9.10n/achrIV 10,885,597contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to unknown protein (Hypothetical protein).; TR:Q9FFB3
40ttll-15K07C5.7n/achrV 10,359,962ttll-15 encodes a putative tubulin polyaminoacid ligase orthologous to Drosophila melanogaster CG4089 and Tetrahymena thermophila TTLL15; TTLL-15 has no obvious function in mass RNAi assays.
41Y43E12A.2Y43E12A.2n/achrIV 10,983,505contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
42F40F4.7F40F4.7n/achrX 3,244,931contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
43C52E4.5C52E4.5n/achrV 11,984,169contains similarity to Pfam domain PF01532 Glycosyl hydrolase family 47 contains similarity to Interpro domain IPR001382 (Glycoside hydrolase, family 47)
44F46F5.13F46F5.13n/achrII 803,511contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
45C29F9.6C29F9.6n/achrIII 115,990contains similarity to Pfam domain PF02135 TAZ zinc finger contains similarity to Interpro domains IPR003101 (Coactivator CBP, KIX), IPR000197 (Zinc finger, TAZ-type)
46E04F6.4E04F6.4n/achrII 7,190,903contains similarity to Pfam domains PF08371 (Phospholipase D/viral envelope) , PF00614 (Phospholipase D Active site motif) (2)contains similarity to Interpro domains IPR013582 (Phospholipase D/viral envelope), IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase)
47F55G11.7F55G11.7n/achrIV 12,961,290contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
48fbxa-115Y113G7B.3n/achrV 20,186,739This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49W02B12.1W02B12.1n/achrII 11,450,148contains similarity to Pfam domain PF00657 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001087 (Lipase, GDSL), IPR013830 (Esterase, SGNH hydrolase-type)
50tag-278C02F12.7n/achrX 3,686,384C. elegans TAG-278 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)