UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-83F09G2.70chrV 7,165,183C. elegans SRH-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2srh-78DC2.22e-85chrV 218,314C. elegans SRH-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3T19C3.5T19C3.5n/achrIII 626,220contains similarity to Pfam domains PF02886 (LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain) , PF01273 (LBP / BPI / CETP family, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
4ZK1320.5ZK1320.5n/achrII 9,664,562contains similarity to Interpro domain IPR008107 (Mycoplasma P48 major surface lipoprotein)
5C17C3.2C17C3.2n/achrII 5,566,360
6F31B12.2F31B12.2n/achrX 10,822,704contains similarity to Mus musculus Splicing factor, arginine/serine-rich 12 (Serine-arginine-richssplicing regulatory protein 86) (SRrp86).; SW:SFRC_MOUSE
7F58A4.6F58A4.6n/achrIII 9,614,710contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ36688; ENSEMBL:ENSP00000256538
8C16C8.18C16C8.18n/achrII 3,430,314contains similarity to Bos taurus Protein FAM82A.; SW:Q2TBQ7
9T05A8.5T05A8.5n/achrII 2,733,284contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
10F17E5.2F17E5.2n/achrX 12,396,800contains similarity to Pfam domains PF00153 (Mitochondrial carrier protein) (3), PF00036 (EF hand) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003842 (Vacuolating cytotoxin), IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR002167 (Graves disease carrier protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
11sdz-13F13E9.6n/achrIV 10,878,328C. elegans SDZ-13 protein ;
12fbxb-107F29A7.2n/achrII 2,760,240C. elegans FBXB-107 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
13T15B7.6T15B7.6n/achrV 6,826,715
14T09E11.6T09E11.6n/achrI 12,367,467contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
15Y56A3A.6Y56A3A.6n/achrIII 11,874,979contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002951 (Atrophin)
16D2063.2D2063.2n/achrV 4,330,780contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
17sra-22F28C12.7n/achrI 12,702,151C. elegans SRA-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
18tag-192T04D1.4n/achrI 4,692,225C. elegans TAG-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF07533 (Associated with TFs and helicases) , PF00385 ('chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR000330 (SNF2-related), IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016197 (Chromo domain-like), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR006576 (BRK), IPR009057 (Homeodomain-like), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
19Y45F10A.3Y45F10A.3n/achrIV 13,511,278contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1
20mtx-1F39B2.11n/achrI 14,755,776C. elegans MTX-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017410 (Metaxin), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
21cyp-33D1K05D4.4n/achrV 16,174,796C. elegans CYP-33D1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR008071 (Cytochrome P450, E-class, group I, CYP2J-like), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
22F36H5.9F36H5.9n/achrII 1,752,922This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
23F54H12.5F54H12.5n/achrIII 7,971,111This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
24Y116A8C.23Y116A8C.23n/achrIV 17,054,490contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
25T24B8.4T24B8.4n/achrII 9,067,183contains similarity to Pfam domain PF02205 WH2 motif contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003124 (Actin-binding WH2)
26F39E9.4F39E9.4n/achrII 3,284,898F39E9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F39E9.4 has no clear orthologs in other organisms.
27C01B7.5C01B7.5n/achrV 8,800,549contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
28twk-4ZK1067.5n/achrII 9,192,128C. elegans TWK-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
29skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
30T14B4.2T14B4.2n/achrII 6,736,402contains similarity to Pfam domain PF01084 Ribosomal protein S18 contains similarity to Interpro domain IPR001648 (Ribosomal protein S18)
31ceh-33C10G8.7n/achrV 5,323,911ceh-33 encodes a Six/sine oculis class homeodomain transcription factor; preliminary RNAi experiments suggest that CEH-33 activity may be required for gonad development; a ceh-33::gfp reporter shows very weak pharyngeal expression in late embryos and early larvae.
32F09G2.3F09G2.3n/achrV 7,186,673contains similarity to Pfam domain PF01384 Phosphate transporter family contains similarity to Interpro domain IPR001204 (Phosphate transporter)
33dsl-2W09G12.1n/achrIV 1,203,808dsl-2 encodes a putative transmembrane protein whose extracellular domain has single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-2 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
34R06C7.6R06C7.6n/achrI 7,246,472contains similarity to Mus musculus Uncharacterized protein C8orf32 homolog.; SW:Q80WB5
35C06A5.10C06A5.10n/achrI 5,982,746
36dyb-1F47G6.1n/achrI 1,486,779The dyb-1 gene encodes a homolog of mammalian alpha-dystrobrevin (DTNA; OMIM:601239), mutation of which can lead to left ventricular noncompaction with congenital heart defects.
37F02D10.4F02D10.4n/achrX 13,458,404contains similarity to Emericella nidulans Anucleate primary sterigmata protein B.; SW:APSB_EMENI
38ubxn-4ZK353.8n/achrIII 8,404,541C. elegans UBXN-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00789 UBX domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR001012 (UBX)
39C35D10.12C35D10.12n/achrIII 4,873,622contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR011644 (Haem NO binding), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
40F53G12.4F53G12.4n/achrI 135,809
41Y39E4B.10Y39E4B.10n/achrIII 13,147,942contains similarity to Buchnera aphidicola Hypothetical protein BUsg080.; SW:Y080_BUCAP
42F55C12.2F55C12.2n/achrII 5,877,311
43C43E11.5C43E11.5n/achrI 4,237,822contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
44C33C12.4C33C12.4n/achrII 2,165,992
45T09B9.3T09B9.3n/achrX 9,760,250contains similarity to Pfam domain PF03009 Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase family contains similarity to Interpro domain IPR004129 (Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase)
46T23F1.3T23F1.3n/achrV 15,456,730contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47E02C12.9E02C12.9n/achrV 9,374,371contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
48C40A11.3C40A11.3n/achrII 2,142,086contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
49C01H6.2C01H6.2n/achrI 7,206,143contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
50Y57G11B.2Y57G11B.2n/achrIV 14,566,202contains similarity to Guillardia theta Hypothetical protein orf176 from chromosome 3.; TR:Q98SC3