UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F08G2.5F08G2.55e-47chrII 13,833,272contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
2M04G7.1M04G7.1n/achrIV 456,400contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000877 (Proteinase inhibitor I12, Bowman-Birk), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
3C49G7.10C49G7.10n/achrV 4,041,191contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
4C49G7.6C49G7.6n/achrV 4,041,399
5ttr-28R90.3n/achrV 12,904,670C. elegans TTR-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
6dod-6T20G5.7n/achrIII 10,197,925C. elegans DOD-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
7sol-1C15A11.3n/achrI 7,392,485C. elegans SOL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
8F28A12.3F28A12.3n/achrV 8,641,003
9mec-9C50H2.3n/achrV 9,911,331mec-9 encodes a predicted extracellular protein containing six EGF-like repeats,five Kunitz-type protease inhibitor domains, and a glutamic acid-rich region possibly involved in protein-protein interactions; mec-9 encodes two proteins, only one of which, MEC-9L, appears to be required for normal mechanosensory response to gentle touch and proper functioning of the touch receptor neurons; mec-9 interacts genetically with mec-5, which encodes a unique C. elegans collagen secreted by the hypodermis; MEC-9L is expressed and secreted by the touch receptor neurons.
10ins-30ZC334.2n/achrI 14,035,617ins-30 encodes an insulin-like peptide.
11C55A6.6C55A6.6n/achrV 11,514,222contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
12hen-1C36B7.7n/achrX 7,116,551hen-1 encodes a secreted protein that contains a low-density lipoprotein (LDL) receptor motif A; HEN-1 activity is required for integration of sensory stimuli and behavioral plasticity; a hen-1::GFP reporter is expressed in pharyngeal muscles, the vulva, and weakly in a subset of neurons; antibodies to HEN-1 protein detect expression exclusively in the AIY and ASE neurons, where HEN-1 appears to localize to cell bodies and in a punctate pattern in nerve ring axons at sites of synapse formation; HEN-1 expression in AIY appears to be under the control of the TTX-3 LIM domain transcription factor.
13C01G10.6C01G10.6n/achrV 15,087,952contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q6GED5
14C01G10.4C01G10.4n/achrV 15,089,864contains similarity to Staphylococcus aureus Staphylococcal secretory antigen ssaA2 precursor.; SW:Q5HDQ9
15F41D3.8F41D3.8n/achrI 12,267,803contains similarity to Pfam domain PF01697 (Domain of unknown function)
16flp-13F33D4.3n/achrIV 7,697,747C. elegans FLP-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
17cal-4T07G12.1n/achrIV 10,528,321cal-4 encodes one of five predicted C. elegans calcium-binding calmodulin homologs (the others being CAL-1, CAL-2, CAL-3 and CMD-1); as loss of cal-4 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of CAL-4 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
18flp-17C52D10.11n/achrIV 17,191,022C. elegans FLP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
19nhr-6C48D5.1n/achrIII 3,576,162nhr-6 encodes a nuclear receptor of the NR4A4 subfamily that is orthologous to the mammalian NGFI-B receptors and the Drosophila HR38 nuclear receptor (DHR38) that has been implicated in molting and metamorphosis; by homology, NHR-6 likely functions as a transcription factor that, based upon RNAi experiments, is required for normal ovulation and/or spermathecal development or function; an nhr-6 reporter fusion is expressed primarily in the anterior and posterior spermatheca during L3 and L4 larval stages, with some weak and variable expression also observed in two chemosensory neurons; nhr-6 mRNA is expressed in an oscillating manner throughout larval development, in a pattern that is slightly irregular with respect to the timing of larval molts and that exhibits consistently lower expression at the times when these molts actually occur.
20gst-40F56B3.10n/achrIV 761,476C. elegans GST-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
21E02C12.11E02C12.11n/achrV 9,379,644contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
22clec-193Y116A8A.3n/achrIV 16,805,692C. elegans CLEC-193 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
23H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
24glb-3C06H2.5n/achrV 11,139,410glb-3 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
25F44G4.6F44G4.6n/achrII 9,001,316contains similarity to Interpro domain IPR001209 (Ribosomal protein S14)
26F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
27F35H12.1F35H12.1n/achrX 936,580contains similarity to Interpro domain IPR015649 (Schwannomin interacting protein 1)
28T27A10.2T27A10.2n/achrX 3,586,399
29C04E6.8C04E6.8n/achrV 5,883,601
30cho-1C48D1.3n/achrIV 13,212,115cho-1 encodes a high-affinity choline transporter orthologous to members of the sodium-dependent glucose transporter family; CHO-1 is expressed in cholinergic neurons.
31ZC204.1ZC204.1n/achrII 1,666,906contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
32T02E9.1T02E9.1n/achrV 11,351,210contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33F46F5.4F46F5.4n/achrII 805,580contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
34F07G11.7F07G11.7n/achrV 7,303,485contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
35R13A5.9R13A5.9n/achrIII 7,577,267contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
36T02D1.6T02D1.6n/achrIV 17,410,914contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37nhr-120C25B8.6n/achrX 6,638,552C. elegans NHR-120 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
39C15C7.4C15C7.4n/achrX 3,146,822
40F13E9.9F13E9.9n/achrIV 10,898,387contains similarity to Homo sapiens Similar to Dentin sialophosphoprotein preproprotein; ENSEMBL:ENSP00000282478
41pqn-60R11G11.7n/achrV 504,306pqn-60 encodes a 154-residue, glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion'-like) protein, predicted to have coiled-coil structure, with many paralogs in nematodes but no obvious non-nematode orthologs; PQN-60 inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
42glr-5ZC196.7n/achrV 8,718,671glr-5 encodes a kainate (non-NMDA)-type ionotropic glutamate receptor subunit; GLR-5 activity is required for normal brood sizes, especially at high temperatures; GLR-5 is expressed in neurons.
43clec-194Y116A8A.8n/achrIV 16,832,361C. elegans CLEC-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44F34D10.6F34D10.6n/achrIII 3,756,086contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
45R13A1.5R13A1.5n/achrIV 7,191,489
46F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
47ZC239.3ZC239.3n/achrII 3,216,335contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
48cyp-34A7B0213.12n/achrV 3,962,772C. elegans CYP-34A7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
49sul-2D1014.1n/achrV 8,158,775sul-2 is orthologous to the human gene ARYLSULFATASE A (ARSA; OMIM:250100), which when mutated leads to metachromatic leukodystrophy.
50sue-1F07A5.5n/achrI 7,365,960C. elegans SUE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)