UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1his-43F08G2.29.999999999999999e-43chrII 13,827,426his-43 encodes an H2A histone.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3his-61F55G1.109.999999999999999e-43chrIV 7,485,966his-61 encodes an H2A histone.
4gpdh-1F47G4.3n/achrI 14,077,014gpdh-1 encodes one of two C. elegans glycerol 3-phosphate dehydrogenases; although loss of gpdh-1 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious defects, gpdh-1 mRNA expression is upregulated in response to hypertonicity, suggesting that GPDH-1 does play a role in osmotic stress adaptation in C. elegans.
5C42D4.2C42D4.2n/achrIV 7,181,781contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
6T07C4.10T07C4.10n/achrIII 10,323,248contains similarity to Interpro domains IPR002957 (Keratin, type I), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin)
7T17H7.7T17H7.7n/achrIII 756,721
8H06O01.2H06O01.2n/achrI 7,012,174H06O01.2 encodes a large (1,461-aa) putative chromodomain helicase DNA-binding protein that inhibits DHC-1 in vivo; H06O01.2 is orthologous to budding yeast CHD1, human CHD1 (OMIM:602118), and human CHD2 (OMIM:602119); H06O01.2(RNAi) suppresses the lethality of conditional dhc-1 mutations, as well as the spindle length and cytokinesis defects of dhc-1(or195), indicating that H06O01.2 negatively regulates dynein; H06O01.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
9sri-27ZK697.4n/achrV 1,726,643C. elegans SRI-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10his-57F54E12.59.999999999999999e-43chrIV 11,340,574his-57 encodes an H2A histone.
11C15H9.3C15H9.3n/achrX 6,116,887contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12C46H3.1C46H3.1n/achrX 1,210,043
13K09F6.3K09F6.3n/achrII 2,258,704contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
14C09F9.2C09F9.2n/achrII 14,708,961contains similarity to Pfam domains PF01390 (SEA domain) , PF01826 (Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain) (3), PF07974 (EGF-like domain) , PF03351 (DOMON domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR005018 (DOMON related), IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR000082 (SEA), IPR008960 (Carbohydrate-binding family 9/cellobiose dehydrogenase, cytochrome), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013050 (DOMON)
15C18B2.6C18B2.6n/achrX 3,615,375contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
16F22G12.4F22G12.4n/achrI 13,157,287contains similarity to Pfam domains PF01363 (FYVE zinc finger) , PF00023 (Ankyrin repeat) (17)contains similarity to Interpro domains IPR000306 (Zinc finger, FYVE-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002110 (Ankyrin), IPR017455 (Zinc finger, FYVE-related), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
17M05B5.4M05B5.4n/achrI 7,189,526The M05B5.4 gene encodes an ortholog of the human gene LECITHIN-CHOLESTEROL ACYLTRANSFERASE (LCAT; OMIM:606967), which when mutated leads to lecithin-cholesterol acyltransferase deficiency (OMIM:245900).
18K09F6.8K09F6.8n/achrII 2,295,399
19M195.2M195.2n/achrII 8,362,076contains similarity to Pfam domain PF02363 Cysteine rich repeat
20C11D2.3C11D2.3n/achrIV 6,154,348
21F39E9.7F39E9.7n/achrII 3,306,570contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
22K09H11.1K09H11.1n/achrV 5,749,898contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF01636 (Phosphotransferase enzyme family) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF00702 (haloacid dehalogenase-like hydrolase) contains similarity to Interpro domains IPR011945 (Predicted HAD-superfamily phosphatase, subfamily IA/Epoxide hydrolase, N-terminal), IPR005833 (Haloacid dehydrogenase/epoxide hydrolase), IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR006402 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR002575 (Aminoglycoside phosphotransferase)
23his-33F17E9.139.999999999999999e-43chrIV 8,335,508his-33 encodes an H2A histone; by homology, HIS-33 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-33 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS5 cluster on chromosome IV.
24ZK899.3ZK899.3n/achrX 9,454,242contains similarity to Homo sapiens C10ORF6; ENSEMBL:ENSP00000238961
25T19C3.4T19C3.4n/achrIII 619,226contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
26T15D6.11T15D6.11n/achrI 12,397,457contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
27tre-1F57B10.7n/achrI 6,556,662C. elegans TRE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
28H04D03.1H04D03.1n/achrIII 10,437,086contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
29F47G9.3F47G9.3n/achrV 11,315,117contains similarity to Pfam domains PF00100 (Zona pellucida-like domain) , PF00024 (PAN domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
30R07E3.2R07E3.2n/achrX 10,336,549contains similarity to Homo sapiens MYST histone acetyltransferase 3; ENSEMBL:ENSP00000265713
31F55G1.13F55G1.13n/achrIV 7,496,503F55G1.13 encodes a protein that contains EGF-like repeats that are most closely related to those of Notch family members.
32gbh-1D2089.5n/achrII 10,692,053gbh-1 encodes a predicted ortholog of human hBBOX1; expressed in the intestine and in head and body muscles.
33C56G2.15C56G2.15n/achrIII 6,367,144contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR008125 (Streptothricin acetyltransferase)
34F56D1.2F56D1.2n/achrII 5,476,416contains similarity to Pfam domain PF08357 SEFIR domain contains similarity to Interpro domain IPR013568 (SEFIR)
35F56A12.2F56A12.2n/achrV 14,377,560contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36ulp-2Y38A8.3n/achrII 4,957,746C. elegans ULP-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02902 Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain contains similarity to Interpro domain IPR003653 (Peptidase C48, SUMO/Sentrin/Ubl1)
37pps-1T14G10.1n/achrIV 10,163,166pps-1 is orthologous to human PAPSS1 (OMIM:603262) and human PAPSS2 (OMIM:603005, mutated in spondyloepimetaphyseal dysplasia).
38K01D12.5K01D12.5n/achrV 12,398,255contains similarity to Interpro domain IPR003980 (Histamine H3 receptor)
39F32B4.6F32B4.6n/achrI 11,516,108contains similarity to Pfam domains PF07819 (PGAP1-like protein) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR012908 (PGAP1-like)
40fbxa-58C29F9.11n/achrIII 110,182C. elegans FBXA-58 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
41F49F1.7F49F1.7n/achrIV 4,124,635contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
42pqn-39F48F7.4n/achrX 13,967,574The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
43del-3F26A3.6n/achrI 7,671,514C. elegans DEL-3 protein ;
44C08F11.7C08F11.7n/achrIV 13,637,874contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR002398 (Peptidase C14, caspase precursor p45)
45C56C10.11C56C10.11n/achrII 6,599,683
46T07G12.3T07G12.3n/achrIV 10,535,145contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
47col-113C34D4.15n/achrIV 7,151,565C. elegans COL-113 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR009143 (Wnt-6 protein), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
48evl-14H38K22.1n/achrIII 4,308,081evl-14 encodes a homolog of the yeast sister cohesion protein Pds5p that functions during both mitosis and meiosis and is implicated in the maintenance of sister chromatid cohesion in late prophase, and affects vulval morphology, meiotic germline development, embryonic and larval viability, fertility, and cell divisions in the germ line as well as in vulval and somatic gonad lineages; some of the defects, such as somatic gonad defects, are due at least partially to cell division defects.
49F45H10.2F45H10.2n/achrII 13,492,421contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
50C06G1.5C06G1.5n/achrX 16,640,570contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)