UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-123F08E10.30chrV 17,474,702C. elegans SRH-123 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
3hex-3Y39A1C.4n/achrIII 10,851,789hex-3 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
4C34E10.8C34E10.8n/achrIII 5,251,598contains similarity to Leishmania major strain Friedlin Proteophosphoglycan 5.; TR:Q4FX62
5dro-1F53A2.5n/achrIII 13,342,882C. elegans DRO-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00808 (Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone) , PF00125 (Core histone H2A/H2B/H3/H4) contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR007125 (Histone core), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
6rpb-6C06A1.5n/achrII 10,579,552C. elegans RPB-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01192 RNA polymerase Rpb6 contains similarity to Interpro domains IPR006110 (RNA polymerase Rpb6), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR006111 (DNA-directed RNA polymerase, 14 to 18 kDa subunit), IPR012293 (RNA polymerase subunit, RPB6/omega)
7srh-215T20B3.36.999999999999999e-19chrV 16,831,260C. elegans SRH-215 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001356 (Homeobox)
8Y49A10A.1Y49A10A.1n/achrX 10,359,445contains similarity to Pfam domain PF06565 Repeat of unknown function (DUF1126) contains similarity to Interpro domains IPR010554 (Protein of unknown function DUF1126), IPR006602 (Region of unknown function DM10)
9R144.6R144.6n/achrIII 5,003,956contains similarity to Pfam domain PF07857 CEO family (DUF1632) contains similarity to Interpro domain IPR012435 (Protein of unknown function DUF1632)
10srab-2C04F5.5n/achrV 5,104,023C. elegans SRAB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domains IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
11fbxa-120C33E10.2n/achrX 17,303,205This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
12flh-2C26E6.2n/achrIII 4,953,580C. elegans FLH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF04500 FLYWCH zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR007588 (Zinc finger, FLYWCH-type)
13W05H7.2W05H7.2n/achrX 1,435,503
14F23H12.7F23H12.7n/achrV 12,372,277contains similarity to Interpro domain IPR001463 (Sodium:alanine symporter)
15R11H6.4R11H6.4n/achrV 14,610,325contains similarity to Homo sapiens Steerin3 protein; ENSEMBL:ENSP00000228327
16F55A3.5F55A3.5n/achrI 10,782,421contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
17Y55H10A.2Y55H10A.2n/achrIV 3,364,812contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
20Y5F2A.4Y5F2A.4n/achrIV 11,077,311contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
21F26A1.1F26A1.1n/achrIII 4,851,165
22C10A4.6C10A4.6n/achrX 7,391,386
23F21D5.5F21D5.5n/achrIV 8,737,526contains similarity to Pfam domain PF08645 Polynucleotide kinase 3 phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR013954 (Polynucleotide kinase 3 phosphatase, central region), IPR006549 (HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIIA), IPR015636 (Polynucleotide kinase 3, phosphatase), IPR006551 (DNA 3-phosphatase)
24clec-223C03E10.5n/achrV 11,275,618C. elegans CLEC-223 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
25F35H10.6F35H10.6n/achrIV 8,300,273contains similarity to Pfam domain PF02996 Prefoldin subunit contains similarity to Interpro domains IPR004127 (Prefoldin alpha-like), IPR009053 (Prefoldin)
26fbxa-181F35E12.3n/achrV 13,726,386This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27ekl-5Y26E6A.1n/achrX 13,915,941C. elegans EKL-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001579 (Glycoside hydrolase, chitinase active site), IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
28str-5T23D5.12n/achrV 15,753,810C. elegans STR-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
29R09A8.2R09A8.2n/achrX 12,621,311contains similarity to Staphylococcus aureus Serine-rich adhesin for platelets precursor (Staphylococcus aureusssurface protein A).; SW:Q8NUJ3
30R08H2.10R08H2.10n/achrV 15,373,870contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
31srd-17Y2H9A.2n/achrV 13,431,663C. elegans SRD-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32F35G12.7F35G12.7n/achrIII 4,586,958contains similarity to Pfam domain PF03091 CutA1 divalent ion tolerance protein contains similarity to Interpro domains IPR004323 (Divalent ion tolerance protein, CutA1), IPR011322 (Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta)
33B0304.2B0304.2n/achrII 4,524,073
34srab-20T20D4.1n/achrV 3,429,701C. elegans SRAB-20 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
35rnf-5C16C10.7n/achrIII 4,165,557This gene encodes a homolog of mammalian RNF5, a C3HC4 (RING-finger) zinc-finger protein.
36C33H5.8C33H5.8n/achrIV 7,778,475contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
37nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.
38F22B5.6F22B5.6n/achrII 8,455,504
39W02D7.6W02D7.6n/achrV 8,300,526contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
40W09C5.1W09C5.1n/achrI 13,627,524contains similarity to Pfam domain PF01201 Ribosomal protein S8e contains similarity to Interpro domain IPR001047 (Ribosomal protein S8e)
41pfd-6F21C3.5n/achrI 7,283,387pfd-6 encodes a putative prefoldin 6 subunit, orthologous to human PFDN6 (OMIM:605660), required for normal microtubule growth and distal tip cell migration; PFD-6 is expressed cytoplasmically in most, if not all, tissues, including the germline; in mass RNAi assays, PFD-6 is required for normal mitotic spindle position, embryonic and larval viability, fertility, body shape, vulval development, and locomotion, and for normally rapid growth; pfd-6(RNAi) embryos show a reduced microtubule growth rate.
42C24H10.4C24H10.4n/achrX 5,058,527
43C38D4.9C38D4.9n/achrIII 4,803,842contains similarity to Pfam domains PF01170 (Putative RNA methylase family UPF0020) , PF05175 (Methyltransferase small domain) , PF08242 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR007848 (Methyltransferase small), IPR000241 (Putative RNA methylase), IPR002296 (N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class), IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site), IPR002723 (Protein of unknown function DUF43)
44R07E4.5R07E4.5n/achrX 5,951,318contains similarity to Plasmodium lophurae Histidine-rich glycoprotein precursor.; SW:P04929
45F53F8.5F53F8.5n/achrV 20,697,686contains similarity to Pfam domain PF00536 SAM domain (Sterile alpha motif) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR013761 (Sterile alpha motif-type), IPR001660 (Sterile alpha motif SAM)
46srx-1F59E11.1n/achrV 9,004,313C. elegans SRX-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47F38E1.11F38E1.11n/achrV 8,379,393
48C34D4.13C34D4.13n/achrIV 7,133,813
49fbxa-104T06E6.13n/achrV 15,422,084C. elegans FBXA-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
50B0281.4B0281.4n/achrII 2,298,366contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)