UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F07H5.8F07H5.80chrII 8,802,913contains similarity to Pfam domains PF06493 (Protein of unknown function (DUF1096)) , PF02363 (Cysteine rich repeat) (21)contains similarity to Interpro domains IPR003341 (Cysteine rich repeat, tripleX), IPR009475 (Protein of unknown function DUF1096), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
2ZC190.2ZC190.2n/achrV 8,682,033contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
3pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
4abu-2F19G12.72e-49chrX 1,409,740abu-2 encodes a transmembrane protein with a predicted signal sequence, a glutamine/asparagine-rich domain and multiple cysteine-rich repeats (DUF139); abu-2 expression is induced by blockage of the unfolded-protein response in the endoplasmic reticulum, and ABU-2 may help protect the organism from damage by improperly folded nascent protein.
5pgp-13F22E10.2n/achrX 12,741,422pgp-13 encodes a member of the ABC transporter family with high similarity to the vertebrate MDR (multidrug resistance) family; PGP-13 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of pgp-13 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious defects, the precise role of pgp-13 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; pgp-13 promoter-gfp fusion proteins are expressed in larvae and adults in the posterior intestine and the amphids.
6T11G6.4T11G6.4n/achrIV 10,850,812contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR008075 (Lipocalin-1 receptor), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
7H25K10.1H25K10.1n/achrIV 16,204,661contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR015914 (Purple acid phosphatase, N-terminal), IPR004843 (Metallophosphoesterase)
8K09C4.10K09C4.10n/achrX 3,278,116contains similarity to Staphylococcus aureus Serine-rich adhesin for platelets precursor (Staphylococcus aureusssurface protein A).; SW:Q7A362
9fut-8C10F3.6n/achrV 5,988,610fut-8 encodes a core alpha 1,6-fucosyltransferase; characterization of a recombinant form of the protein that contains the catalytic region of FUT-8 reveals a sustrate requirement for unsubstituted nonreducing terminal GlcNAc residues.
10ptr-23ZK270.1n/achrI 14,911,168ptr-23 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-23 is strongly required for normal molting from L4 to adult stages (a role conserved in C. briggsae); PTR-23 is also required for normal male tail development, vulval morphogenesis, adult alae formation, and (partly) for endocytosis of yolk by oocytes.
11F55F3.4F55F3.4n/achrX 13,787,328contains similarity to Interpro domain IPR016112 (Major coat protein hexon/vp54/p3, dsDNA virus)
12C34B2.6C34B2.6n/achrI 10,679,640contains similarity to Pfam domains PF00004 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) , PF02190 (ATP-dependent protease La (LON) domain) , PF05362 (Lon protease (S16) C-terminal proteolytic domain) , PF07728 (ATPase family associated with various cellular activities (AAA)) contains similarity to Interpro domains IPR003959 (AAA ATPase, core), IPR008268 (Peptidase S16, active site), IPR000767 (Disease resistance protein), IPR001270 (Chaperonin clpA/B), IPR011704 (ATPase associated with various cellular activities, AAA-5), IPR004815 (Peptidase S16, ATP-dependent protease La), IPR008269 (Peptidase S16, lon C-terminal), IPR003111 (Peptidase S16, lon N-terminal), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
13pxn-2K09C8.5n/achrX 10,975,651C. elegans PXN-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF00560 (Leucine Rich Repeat) (3), PF01462 (Leucine rich repeat N-terminal domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR010255 (Haem peroxidase), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
14grd-6T18H9.1n/achrV 9,223,090grd-6 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity proline-rich domain, and a C-terminal Ground domain; GRD-6 is expressed in hypodermis and in various neurons, in both head and tail, and the PVT interneuron; the Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-6 has no obvious function in RNAi assays.
15C38D9.2C38D9.2n/achrV 17,568,988contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
16nhr-210R11G11.12n/achrV 518,366C. elegans NHR-210 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17pgp-2C34G6.4n/achrI 5,891,285pgp-2 encodes a member of the ABC transporter family with highest similarity to the vertebrate MDR (multidrug resistance) family and that is orthologous to human MDR1 (ABCB1; OMIM:171050, mutated in Crohn disease); during development, pgp-2 activity is required, in parallel with that of the AP-3 adaptor complex, for the proper formation of gut granules, lysosome-related fat storage organelles found in the C. elegans intestine; pgp-2 is expressed in the intestine, from the E2 stage of embryonic development through adulthood; PGP-2 localizes to the gut granule membrane.
18pqn-40F52D1.3n/achrX 454,005The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
19T09E8.3T09E8.3n/achrV 13,180,913contains similarity to Pfam domain PF03311 Cornichon protein contains similarity to Interpro domain IPR003377 (Cornichon)
20H23N18.4H23N18.4n/achrV 4,902,178contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
21sri-48ZC239.9n/achrII 3,200,257C. elegans SRI-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22C33D3.3C33D3.3n/achrX 10,485,911contains similarity to Interpro domains IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
23H02F09.3H02F09.3n/achrX 1,570,762contains similarity to Interpro domain IPR001757 (ATPase, P-type, K/Mg/Cd/Cu/Zn/Na/Ca/Na/H-transporter)
24abts-2F52D10.1n/achrX 11,587,609abts-2 encodes an anion transporter; when expressed in Xenopus oocytes, ABTS-2 does not exhibit detectable transport of chloride, sulfate, or oxolate anions; ABTS-2::GFP fusion proteins are expressed in the larval excretory cell and the adult ovaries, while an abts-2::gfp promoter fusion is seen in only one tail ganglion neuron; in intestinal cells, the ABTS-2::GFP fusion protein localizes to the basolateral membrane.
25H03G16.5H03G16.5n/achrX 15,056,081contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Myo1 is a type II myosin, is localized to the actomyosin ring and is important for cytokinesis.; SGD:YHR023W
26D1054.1D1054.1n/achrV 10,769,166contains similarity to Pfam domain PF01734 Patatin-like phospholipase contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin)
27nas-38F57C12.1n/achrX 560,901C. elegans NAS-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
28srz-64Y57G7A.7n/achrII 1,291,002C. elegans SRZ-64 protein ;
29F21G4.1F21G4.1n/achrX 9,890,917contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF03137 (Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR000539 (Frizzled protein), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30klp-8C15C7.2n/achrX 3,162,174klp-8 encodes an atypical kinesin-like motor protein with the motor domain in the N-terminus; the motor domain of KLP-8 exhibits poor homology to the globular motor domain of the kinesin heavy chain.
31F26H9.5F26H9.5n/achrI 9,313,557contains similarity to Pfam domain PF00266 Aminotransferase class-V contains similarity to Interpro domains IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR003248 (Phosphoserine aminotransferase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
32F40F9.5F40F9.5n/achrV 9,721,836contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
33snf-12T25B6.7n/achrX 9,031,634C. elegans SNF-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
34F55G1.15F55G1.15n/achrIV 7,499,036
35F38B6.4F38B6.4n/achrX 6,677,310contains similarity to Pfam domains PF02844 (Phosphoribosylglycinamide synthetase, N domain) , PF02769 (AIR synthase related protein, C-terminal domain) , PF02843 (Phosphoribosylglycinamide synthetase, C domain) , PF01071 (Phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp (A) domain) , PF00551 (Formyl transferase) , PF00586 (AIR synthase related protein, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR016185 (PreATP-grasp-like fold), IPR011761 (ATP-grasp fold), IPR004733 (Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase), IPR002376 (Formyl transferase, N-terminal), IPR016188 (PurM, N-terminal-like), IPR000728 (AIR synthase related protein), IPR004607 (Phosphoribosylglycinamide formyltransferase), IPR013815 (ATP-grasp fold, subdomain 1), IPR010918 (AIR synthase related protein, C-terminal), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2), IPR013817 (Pre-ATP-grasp fold), IPR011054 (Rudiment single hybrid motif), IPR000115 (Phosphoribosylglycinamide synthetase)
36C54C8.2C54C8.2n/achrI 12,445,611contains similarity to Homo sapiens N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase; ENSEMBL:ENSP00000309096
37R151.1R151.1n/achrIII 7,218,656
38T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
39C39E9.7C39E9.7n/achrIV 13,074,688contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
40C32B5.13C32B5.13n/achrII 961,636contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
41F56D5.6F56D5.6n/achrIV 9,407,298contains similarity to Plasmodium falciparum Putative uncharacterized protein PFD0207c.; TR:Q8I1Y6
42C31E10.6C31E10.6n/achrX 13,997,720contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Mlp proteins restrict telomere length by influencing the Rif1-Tel1 pathway of telomerase regulation; also involved in the translocation of macromolecules between the nucleoplasm and the NPC; SGD:YKR095W
43C29F3.3C29F3.3n/achrV 15,347,032contains similarity to Oryza sativa OSJNBa0038P21.12 protein.; TR:Q7XKR9
44H43E16.1H43E16.1n/achrII 6,676,762contains similarity to Interpro domain IPR000082 (SEA)
45ugt-25C10H11.3n/achrI 4,733,442C. elegans UGT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
46sri-18Y22F5A.2n/achrV 10,259,578C. elegans SRI-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47che-14F56H1.1n/achrI 5,750,511che-14 encodes a protein with a sterol-sensing domain; CHE-14 protein is involved in the exocytotic secretion of lipid-modified proteins at the apical surface of certain epithelial cells.
48F52H2.6F52H2.6n/achrX 2,561,931F52H2.6 is orthologous to the human gene 3BETA-HYDROXYSTEROL DELTA 24 REDUCTASE (DHCR24; OMIM:606418), which when mutated leads to disease.
49abu-9R09F10.23e-35chrX 8,322,700abu-9 encodes a transmembrane protein (identical to that predicted for the pqn-57 gene) with a predicted signal sequence, a glutamine/asparagine-rich domain and multiple cysteine-rich repeats (DUF139); abu-9 expression is induced by blockage of the unfolded-protein response in the endoplasmic reticulum, and ABU-9 may help protect the organism from damage by improperly folded nascent protein.
50cul-6K08E7.7n/achrIV 12,588,438cul-6 encodes a member of the cullin family that may physically interact with SKR-3.