UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-46F07C4.94e-72chrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
2Y75B8A.34Y75B8A.34n/achrIII 12,360,286contains similarity to Homo sapiens Kappa-type opioid receptor; ENSEMBL:ENSP00000265572
3F16G10.1F16G10.1n/achrII 2,402,918contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
4srx-76K12G11.5n/achrV 11,892,608C. elegans SRX-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
5C50H2.6C50H2.6n/achrV 9,921,737contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
6srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7nas-16K03B8.1n/achrV 11,392,697nas-16 encodes an astacin-like metalloprotease.
8C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
9tbx-9T07C4.6n/achrIII 10,340,812C. elegans TBX-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
10str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11srj-6F31F4.8n/achrV 653,904C. elegans SRJ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12T22E5.6T22E5.6n/achrX 6,415,238contains similarity to Interpro domain IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
13tbx-38C24H11.3n/achrIII 11,785,014tbx-38 encodes a T box transcription factor; during embryonic development, tbx-38 functions redundantly with tbx-37 to effect Notch-mediated pharyngeal mesoderm induction in descendants of the ABa blastomere; in addition, tbx-38 and tbx-37 are required for proper cell fate specification of other ABa descendants, such as those that give rise to hypodermal tissue; TBX-38 expression appears to be limited to the 8 ABa descendents at the 24-cell stage of embryogenesis, with expression diminishing markedly during the next cell cycle; negative regulation of TBX-38 expression in ABp descendants depends upon Notch signaling, while negative regulation of expression in EMS descendents is likely controlled, in part, by ref-1 and unc-37, which encode bHLH and Groucho-like proteins, respectively.
14W09D10.4W09D10.4n/achrIII 10,713,760contains similarity to Pfam domain PF07228 Stage II sporulation protein E (SpoIIE) contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR010822 (Sporulation stage II, protein E C-terminal)
15F58E2.2F58E2.2n/achrIV 3,470,373
16clec-114C49A1.9n/achrI 14,233,796C. elegans CLEC-114 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold)
17C31B8.2C31B8.2n/achrV 2,917,112contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
18sri-19Y69E1A.6n/achrIV 10,960,112C. elegans SRI-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19F41D9.1F41D9.1n/achrX 8,380,568contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00018 (SH3 domain) , PF00566 (TBC domain) , PF02759 (RUN domain) contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR001452 (Src homology-3), IPR004012 (RUN), IPR013315 (Spectrin alpha chain), IPR011511 (Variant SH3)
20E03G2.1E03G2.1n/achrX 15,927,754contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamate--cysteine ligase (EC 6.3.2.2).; TR:Q9TY17
21F54H5.3F54H5.3n/achrII 6,622,759contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
22R10F2.5R10F2.5n/achrIII 2,924,200contains similarity to Interpro domain IPR000443 (Islet amyloid polypeptide)
23R12C12.4R12C12.4n/achrII 6,039,457
24srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25str-76C01B4.10n/achrV 2,514,913C. elegans STR-76 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
27str-67K10C9.6n/achrV 1,063,591C. elegans STR-67 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
29nhr-53K06B4.11n/achrV 15,701,459C. elegans NHR-53 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30T25E4.2T25E4.2n/achrII 5,581,240
31clec-39T25E12.70.000000004chrV 16,740,408C. elegans CLEC-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
33T05C1.1T05C1.1n/achrII 4,479,688
34K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
35W04G5.3W04G5.3n/achrI 11,629,776contains similarity to Arabidopsis thaliana Probable WRKY transcription factor 19 (WRKY DNA-binding protein 19).; SW:WR19_ARATH
36R52.5R52.5n/achrII 2,109,416contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
37F28F9.3F28F9.3n/achrIV 3,831,378
38srw-23F49A5.8n/achrV 16,874,669C. elegans SRW-23 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
39C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
40srd-36R04D3.6n/achrX 13,294,014C. elegans SRD-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srt-36F47D2.5n/achrV 4,267,330C. elegans SRT-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
42sri-14M01G12.1n/achrI 12,135,356C. elegans SRI-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43C17A2.3C17A2.3n/achrII 3,844,552contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2975-PA;; FLYBASE:CG2975
44srh-275C03G6.7n/achrV 7,353,665C. elegans SRH-275 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45R08E5.4R08E5.4n/achrV 3,769,592
46C49A1.1C49A1.1n/achrI 14,214,978contains similarity to Homo sapiens Plasminogen-related protein B precursor; ENSEMBL:ENSP00000245705
47F16F9.1F16F9.1n/achrX 8,448,780contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
48old-1C08H9.5n/achrII 9,867,626old-1 encodes a receptor protein tyrosine kinase; old-1 activity is required for stress resistance and regulation of adult lifespan: old-1 mRNA expression is upregulated in response to stress and in daf-2 and age-1 mutant backgrounds; likewise, overexpression of old-1 in wild-type animals extends lifespan and increases resistance to heat and UV irradiation; an OLD-1::GFP fusion protein is expressed in the anterior region of worms, in neuronal, hypodermal, and pharyngeal tissues, as well as in the proximal region of the male gonad; expression is visible in young adults and appears to increase as animals age and in response to heat, starvation, or UV irradiation.
49sra-20F28C12.4n/achrI 12,697,375C. elegans SRA-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
50T24D5.1T24D5.1n/achrX 12,575,561contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV156 hypothetical protein.; TR:Q9YVT6