UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F07C3.3F07C3.30chrV 9,230,874contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
2adm-2C04A11.4n/achrX 13,691,794adm-2 encodes a protein containing a snake venom disintegrin-domain and a metalloprotease-like domain (i.e., a protein of the ADAM family); like ADM-1, ADM-2 is homologous to a mammalian sperm glycoprotein (PH-30/fertilin) implicated in sperm-egg fusion, and ADM-2 might thus be a fusogenic protein mediating the merging of plasma membranes during development.
3abt-2F12B6.1n/achrI 2,264,395abt-2 encodes a predicted ATP-binding cassette (ABC) transporter that is a member of the ABCA subfamily of transport proteins; ABT-2 is predicted to function as a transmembrane protein that couples energy to transport of various molecules across membranes, but as loss of abt-2 activity via RNAi results in no obvious defects, the precise role of abt-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
4W04E12.5W04E12.5n/achrV 19,742,714contains similarity to Interpro domain IPR000750 (Proenkephalin B)
5F07F6.2F07F6.2n/achrII 5,430,880contains similarity to Homo sapiens 13 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000380244
6clec-191F38C2.6n/achrIV 16,280,134C. elegans CLEC-191 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
7Y7A5A.8Y7A5A.8n/achrX 15,823,201contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IL30
8R13.4R13.4n/achrIV 10,819,150contains similarity to Pfam domain PF02891 MIZ/SP-RING zinc finger contains similarity to Interpro domain IPR004181 (Zinc finger, MIZ-type)
9W03F8.2W03F8.2n/achrIV 5,191,305contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
10F49B2.6F49B2.6n/achrI 14,335,445contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
11C44B7.4C44B7.4n/achrII 6,869,836contains similarity to Rattus norvegicus Protein FAM26F.; SW:Q561R8
12grl-2T16G1.8n/achrV 12,945,836grl-2 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central proline-rich low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-2 is expressed in neurons, amphid socket cells, and other cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
13C03B1.6C03B1.6n/achrX 6,350,637
14T05A1.3T05A1.3n/achrIV 9,563,673contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
15T28D9.11T28D9.11n/achrII 6,491,500
16hum-7F56A6.2n/achrI 596,704hum-7 encodes a class IX unconventional myosin heavy chain that contains a myosin motor domain in the head region and zinc-finger and rhoGAP (rho GTPase activating protein) domains in the tail region; HUM-7 is required during embryogenesis for cytokinesis and normal cytoplasmic rearrangements, and by homology, may function in organization of the actin cytoskeleton; the precise expression and localization patterns of HUM-7 are not yet known.
17C43G2.4C43G2.4n/achrIV 6,562,982contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
18jph-1T22C1.7n/achrI 7,948,882jph-1 encodes a junctophilin, a protein that belongs to a transmembrane family of proteins implicated in the formation of the junctional membrane complex that forms between the plasma membrane and the endoplasmic reticulum in excitable cells; this complex facilitates cross-talk between the cell surface and intracellular ionic channels; RNA interference of jph-1 results in a locomotion defect suggesting impaired body-wall muscle function; a jph-1 promoter-gfp fusion reporter is expressed in all muscle cells and certain neurons of the nerve ring.
19clec-64F35C5.7n/achrII 12,899,255C. elegans CLEC-64 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
20cst-2C24A8.4n/achrX 4,334,568C. elegans CST-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
21Y47H9B.2Y47H9B.2n/achrI 11,745,783contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domain IPR005514 (Protein of unknown function DUF316)
22rpl-42C09H10.1n/achrII 11,093,225C. elegans RPL-42 protein ;
23C06C3.9C06C3.9n/achrII 9,377,271
24K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
25ceh-12F33D11.4n/achrI 5,841,090ceh-12 encodes a homeobox protein orthologous to human HLXB9 (OMIM:142994, mutated in Currarino syndrome) that is required for normal synaptic inputs to motor neurons VA2-VA10 (sisters to VB3-VB11); ceh-12 is expressed in VB motor neurons, but repressed in their VA siblings by UNC-4 and UNC-37; unc-4 or unc-37 mutants show ectopic CEH-12 expression in VA neurons, which is both necessary and sufficient to induce VA neurons to form gap junctions with normally VB-specific interneurons; ceh-12 mutations have no grossly obvious phenotype, and have no effect on del-1 or acr-5 repression in VB neurons, but do suppress the backward movement defect of unc-4 mutants, and do derepress vab-7 (normally restricted to DB and VC motor neurons); CEH-12, like other HLXB9 orthologs, has an N-terminal eh1 domain that may interact with UNC-37/Groucho, and that may indicate CEH-12 to be a transcriptional repressor.
26C44B11.1C44B11.1n/achrIII 3,156,820contains similarity to Pfam domain PF06905 Fas apoptotic inhibitory molecule (FAIM1) contains similarity to Interpro domain IPR010695 (Fas apoptotic inhibitory molecule)
27srx-90H12C20.5n/achrV 11,581,770C. elegans SRX-90 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28lgc-25R03E1.3n/achrX 14,160,175C. elegans LGC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
29F40F9.8F40F9.8n/achrV 9,734,765contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
30DC2.5DC2.5n/achrV 211,433contains similarity to Pfam domain PF00439 Bromodomain contains similarity to Interpro domain IPR001487 (Bromodomain)
31F54D12.2F54D12.2n/achrII 1,399,803contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
32B0207.11B0207.11n/achrI 5,963,581B0207.11 encodes a nematode-specific protein probably required for a normally high ovulation rate; B0207.11 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative N-terminal coiled-coil domain and an SH2 motif, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (F42G4.6, F44F4.10, T08G11.2, and Y81G3A.1); B0207.11(tm322) hermaphrodites show abnormal egg-laying, retaining significantly fewer eggs than wild-type (perhaps due to a lowered ovulation rate) while retaining late-stage embryos; B0207.11 has no obvious phenotype in mass RNAi experiments, possibly because of genetic redundancy with its paralogs.
33ZK1290.10ZK1290.10n/achrII 7,552,859contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
34dhs-4T05F1.10n/achrI 9,648,395dhs-4 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
35Y7A5A.6Y7A5A.6n/achrX 15,798,435contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Putative transcriptional regulatory protein, phd finger.; TR:Q9HDV4
36K11C4.2K11C4.2n/achrV 6,895,906contains similarity to Pfam domain PF03006 Haemolysin-III related contains similarity to Interpro domain IPR004254 (Hly-III related proteins)
37gst-20Y48E1B.10n/achrII 13,608,893C. elegans GST-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF02798 Glutathione S-transferase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
38BE10.1BE10.1n/achrIII 12,788,458contains similarity to Homo sapiens PRO2015; TR:Q9P185
39C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
40str-86F59E11.14n/achrV 8,983,013C. elegans STR-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41F39E9.1F39E9.1n/achrII 3,318,116contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
42F35B3.7F35B3.7n/achrX 17,038,997contains similarity to Homo sapiens Leucine zipper putative tumor suppressor 2; ENSEMBL:ENSP00000359240
43W05B5.1W05B5.1n/achrI 13,043,893contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Homolog of human WASP, proline-rich protein; SGD:YOR181W
44F54H12.5F54H12.5n/achrIII 7,971,111This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
45nfyb-1W10D9.4n/achrII 464,524C. elegans NFYB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00808 Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone contains similarity to Interpro domains IPR009072 (Histone-fold), IPR003957 (Transcription factor, CBFA/NFYB, DNA topoisomerase), IPR003958 (Transcription factor CBF/NF-Y/archaeal histone)
46F56D5.2F56D5.2n/achrIV 9,397,813contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein yxcE.; SW:YXCE_BACSU
47unc-9R12H7.1n/achrX 13,214,484unc-9 encodes an innexin, an integral transmembrane channel protein that is a structural component of invertebrate gap junctions; UNC-9 is required for normal forward locomotion and egg-laying and also plays a role in the response to antihelminthics and volatile anesthetics; UNC-9 may form a functional pair with UNC-7, another C. elegans innexin, as mutations in unc-7 result in defects nearly identical to those in unc-9 mutant animals.
48C38D4.7C38D4.7n/achrIII 4,810,559contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
49F28H6.2F28H6.2n/achrX 14,142,630contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
50T02G6.2T02G6.2n/achrI 11,801,906contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9C9Y9