UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1sue-1F07A5.50chrI 7,365,960C. elegans SUE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
2H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
3K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
4lpr-2T12A7.5n/achrIV 11,783,102C. elegans LPR-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR012674 (Calycin), IPR011038 (Calycin-like), IPR002345 (Lipocalin)
5C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
6T27A10.2T27A10.2n/achrX 3,586,399
7tig-2F39G3.8n/achrV 4,728,435The tig-2 gene, like dbl-1, daf-7, and unc-129, encodes a TGF-beta-like protein.
8F36D4.4F36D4.4n/achrV 9,404,118contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
9hen-1C36B7.7n/achrX 7,116,551hen-1 encodes a secreted protein that contains a low-density lipoprotein (LDL) receptor motif A; HEN-1 activity is required for integration of sensory stimuli and behavioral plasticity; a hen-1::GFP reporter is expressed in pharyngeal muscles, the vulva, and weakly in a subset of neurons; antibodies to HEN-1 protein detect expression exclusively in the AIY and ASE neurons, where HEN-1 appears to localize to cell bodies and in a punctate pattern in nerve ring axons at sites of synapse formation; HEN-1 expression in AIY appears to be under the control of the TTX-3 LIM domain transcription factor.
10F09C6.1F09C6.1n/achrV 16,887,916contains similarity to Interpro domain IPR008999 (Actin-crosslinking proteins)
11ZC239.3ZC239.3n/achrII 3,216,335contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
12clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
13Y47D3B.3Y47D3B.3n/achrIII 11,400,137contains similarity to Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000263816
14T02D1.6T02D1.6n/achrIV 17,410,914contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
16clec-10C03H5.1n/achrII 403,400C. elegans CLEC-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
17nlp-11ZK1320.10n/achrII 9,690,787C. elegans NLP-11 protein ;
18C50C3.5C50C3.5n/achrIII 8,179,701contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
19W05E10.2W05E10.2n/achrV 11,688,773contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000288462
20F08F3.1F08F3.1n/achrV 5,447,387
21ZC84.4ZC84.4n/achrIII 9,211,781ZC84.4 encodes a G protein-coupled receptor with acidic amino acids in the -3 position of its PDZ binding motif; ZC84.4 protein binds PDZ domain 10 of the multi-PDZ domain protein, MPZ-1, in GST pulldown experiments; by analogy with SER-1, the PDZ binding motif of ZC84.4 may enhance its signalling.
22C38C3.6C38C3.6n/achrV 1,485,347contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
23srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
24C04E6.8C04E6.8n/achrV 5,883,601
25flp-17C52D10.11n/achrIV 17,191,022C. elegans FLP-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01581 FMRFamide related peptide family
26ZC15.1ZC15.1n/achrV 20,302,899contains similarity to Interpro domains IPR001878 (Zn-finger, CCHC type), IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
27K03A11.5K03A11.5n/achrX 13,066,078contains similarity to Enterobacteria phage RB49 Hypothetical protein.; TR:Q7Y3J5
28T02E9.1T02E9.1n/achrV 11,351,210contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
29glr-5ZC196.7n/achrV 8,718,671glr-5 encodes a kainate (non-NMDA)-type ionotropic glutamate receptor subunit; GLR-5 activity is required for normal brood sizes, especially at high temperatures; GLR-5 is expressed in neurons.
30asic-2T28F4.2n/achrI 7,481,759C. elegans ASIC-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive), IPR004726 (Degenerin)
31C30B5.5C30B5.5n/achrII 6,204,855contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013806 (Kringle-like fold), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32H28G03.3H28G03.3n/achrX 5,221,191
33npr-3C10C6.2n/achrIV 11,461,555C10C6.2 encodes a G-protein-coupled receptor for the FMRFamide-related peptides (FaRPs) encoded by flp-15; C10C6.2 is primarily coupled to Gi/Go proteins, since C10C6.2 signalling is blocked by pertussis toxin; because of its link to Gi/Go proteins, C10C6.2 is expected to be inhibitory
34W01B6.3W01B6.3n/achrIV 10,071,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35B0524.5B0524.5n/achrIII 1,892,549contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
36gab-1ZC482.1n/achrIII 12,775,682gab-1 encodes a gamma-aminobutyric acid (GABA) receptor beta-like subunit with both the neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding and transmembrane domains; gab-1 can form a GABA-responsive channel when co-expressed with alpha/gamma type subunits in a heterologous expression system; experiments with gab-1 indicate that GABA receptors are involved in the mechanism of resistance to the widely used broad-spectrum anthelmintic drug Ivermectin.
37C11E4.4C11E4.4n/achrX 9,594,806contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
38F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
39Y41C4A.6Y41C4A.6n/achrIII 11,697,361contains similarity to Methanococcus jannaschii Hypothetical protein MJ0951.; SW:Y951_METJA
40T23F4.2T23F4.2n/achrII 1,164,528
41M03E7.1M03E7.1n/achrV 5,624,123contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
42npr-9ZK455.3n/achrX 11,330,259C. elegans NPR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR001556 (Bombesin receptor), IPR009144 (Thyrotropin-releasing hormone receptor), IPR000586 (Somatostatin receptor), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43C32B5.11C32B5.11n/achrII 949,051
44Y42A5A.1Y42A5A.1n/achrV 11,093,039contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
45T14C1.1T14C1.1n/achrX 14,408,600T14C1.1 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that T14C1.1 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
46F23F1.3F23F1.3n/achrII 32,686
47F15G9.2F15G9.2n/achrX 9,713,365contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAW6
48F18A11.5F18A11.5n/achrII 13,010,794contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
49mec-9C50H2.3n/achrV 9,911,331mec-9 encodes a predicted extracellular protein containing six EGF-like repeats,five Kunitz-type protease inhibitor domains, and a glutamic acid-rich region possibly involved in protein-protein interactions; mec-9 encodes two proteins, only one of which, MEC-9L, appears to be required for normal mechanosensory response to gentle touch and proper functioning of the touch receptor neurons; mec-9 interacts genetically with mec-5, which encodes a unique C. elegans collagen secreted by the hypodermis; MEC-9L is expressed and secreted by the touch receptor neurons.
50T12B3.1T12B3.1n/achrIV 7,383,567contains similarity to Pfam domains PF00782 (Dual specificity phosphatase, catalytic domain) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity), IPR000923 (Blue (type 1) copper domain)