UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F02C9.1F02C9.11.9999999999999998e-30chrV 3,138,918
2W04E12.4W04E12.4n/achrV 19,740,082contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Kelch-repeat protein, similar to Kel1 and Kel2; SGD:YPL263C
3F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
4sulp-6W01B11.2n/achrI 3,290,255sulp-6 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-6 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-6::GFP transcriptional fusion is expressed in the posterior intestine.
5K05F1.1K05F1.1n/achrII 5,802,499contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
6ZK849.5ZK849.5n/achrI 14,202,318contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
7ZK354.9ZK354.9n/achrIV 5,307,602contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
8F17E9.3F17E9.3n/achrIV 8,355,135
9F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
10H38K22.4H38K22.4n/achrIII 4,323,189contains similarity to Interpro domain IPR010070 ()
11T05C12.9T05C12.9n/achrII 8,192,426contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF02149 (Kinase associated domain 1) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001772 (Kinase-associated KA1), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
12tag-329C50F4.3n/achrV 9,535,638C. elegans TAG-329 protein; contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
13nas-24F20G2.4n/achrV 13,770,454nas-24 encodes an astacin-like metalloprotease.
14F28A10.3F28A10.3n/achrII 840,846
15T09A12.1T09A12.1n/achrIV 8,245,495contains similarity to Xenopus laevis DNA topoisomerase 1 (EC 5.99.1.2) (DNA topoisomerase I).; SW:P41512
16F21H7.2F21H7.2n/achrV 16,228,334contains similarity to Homo sapiens Neurofilament heavy polypeptide; ENSEMBL:ENSP00000311997
17clec-124C17F4.1n/achrII 3,250,580C. elegans CLEC-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
18T15H9.5T15H9.5n/achrII 9,610,953contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q55FI4
19F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
20Y69H2.11Y69H2.11n/achrV 18,644,329contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
21F59A3.8F59A3.8n/achrI 5,523,890contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
22srw-72F20E11.6n/achrV 17,467,788C. elegans SRW-72 protein ;
23M195.4M195.4n/achrII 8,376,915contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
24W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
25F37A8.2F37A8.2n/achrIII 3,930,465contains similarity to Homo sapiens Protein transport protein Sec24B; ENSEMBL:ENSP00000265175
26R09E10.3R09E10.3n/achrIV 10,312,202contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
27ferl-1T05E8.1n/achrI 5,457,629C. elegans FERL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) , PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
28R02F2.6R02F2.6n/achrIII 5,478,761
29R09E10.2R09E10.2n/achrIV 10,317,896contains similarity to Pfam domain PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase)
30D2062.5D2062.5n/achrII 2,623,045
31ani-1Y49E10.19n/achrIII 12,449,658ani-1 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-1 activity is required in the early embryo for cortical contractile events, including polar body extrusion, membrane ruffling, and pseudocleavage; at later stages of development, ANI-1 also plays a role in cuticle formation, coordinated locomotion, vulval development, and male tail formation; in regulating cortical events, ANI-1 appears to function by positively regulating septin (UNC-59 and UNC-61) localization to the contractile ring as well as formation of septin- and NMY-2-containing cortical patches; in telophase embryos, ANI-1 localizes to the cell cortex and cleavage furrow.
32K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
33F20D6.1F20D6.1n/achrV 8,191,303contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
34Y62H9A.8Y62H9A.8n/achrX 11,891,763contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IEC0
35ZK688.4ZK688.4n/achrIII 7,895,076
36W03D8.2W03D8.2n/achrI 2,799,577contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
37F07G11.7F07G11.7n/achrV 7,303,485contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
38numr-1F08F8.5n/achrIII 7,362,966C. elegans NUMR-1 protein ;
39W03D8.1W03D8.1n/achrI 2,789,083contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CFZ6
40Y70G10A.2Y70G10A.2n/achrIII 10,229,611contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
41F35C5.1F35C5.1n/achrII 12,881,287contains similarity to Saccharomyces cerevisiae B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A); SGD:YOR014W
42D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
43F23C8.7F23C8.7n/achrI 2,423,740contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
44tag-212T14D7.3n/achrII 8,859,305C. elegans TAG-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF00957 Synaptobrevin contains similarity to Interpro domain IPR001388 (Synaptobrevin)
45W04A4.3W04A4.3n/achrI 13,680,877contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
46F23D12.3F23D12.3n/achrX 14,442,916
47W03F9.3W03F9.3n/achrV 132,775
48F21F8.5F21F8.5n/achrV 8,265,454
49C55B7.10C55B7.10n/achrI 6,502,907contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
50skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.