UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F01F1.11F01F1.110chrIII 5,870,989
2tag-319C30B5.1n/achrII 6,200,135C. elegans TAG-319 protein ;
3F10E9.5F10E9.5n/achrIII 8,307,934contains similarity to Homo sapiens 29 kDa protein; ENSEMBL:ENSP00000381398
4C10A4.4C10A4.4n/achrX 7,402,753
5Y5F2A.4Y5F2A.4n/achrIV 11,077,311contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
6lrr-1F33G12.4n/achrII 5,035,345F33G12.4 encodes a leucine rich repeat-containing protein; loss of F33G12.4 activity via large-scale RNAi indicates that F33G12.4 is essential for embryonic and larval development.
7meg-2K02B9.2n/achrX 13,924,518meg-2 encodes a novel protein that localizes exclusively to P granules; originally identified by microarray analyses of germline-enriched transcripts, loss of meg-2 activity by itself results in no obvious abnormalities, but loss of meg-2 activity in meg-1 mutant animals indicates that meg-1 and meg-2 likely have redundant functions in germline development; meg-2 may also function redundantly with mes-1; meg-2 expression in the proximal germline is positively regulated by MPK-1, the C. elegans MAP kinase ortholog; a GFP::MEG-2 fusion protein localizes exclusively to P granules in the embryonic germ cell lineage.
8F31B9.3F31B9.3n/achrX 15,924,034contains similarity to Homo sapiens Similar to polymerase (RNA) III; ENSEMBL:ENSP00000334758
9W03C9.2W03C9.2n/achrII 11,963,758contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Transcription elongation factor S-II (TFIIS).; SW:TFS2_SCHPO
10T09B4.1T09B4.1n/achrI 6,186,762contains similarity to Pfam domain PF04188 Mannosyltransferase (PIG-V)) contains similarity to Interpro domain IPR007315 (Mannosyltransferase, PIG-V)
11C02B10.2C02B10.2n/achrIV 5,090,651contains similarity to Homo sapiens SNARE-associated protein Snapin; ENSEMBL:ENSP00000357674
12C42C1.8C42C1.8n/achrIV 12,292,136contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13F11C1.2F11C1.2n/achrX 12,986,446contains similarity to Lactococcus lactis Rgg protein, putative.; TR:O87251
14C29G2.1C29G2.1n/achrV 2,591,466
15F27B3.5F27B3.5n/achrIII 6,560,937contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
16R10E4.6R10E4.6n/achrIII 4,294,138
17C17F4.5C17F4.5n/achrII 3,247,215This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
18ekl-5Y26E6A.1n/achrX 13,915,941C. elegans EKL-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001579 (Glycoside hydrolase, chitinase active site), IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
19C48B6.3C48B6.3n/achrI 6,915,508contains similarity to Homo sapiens UPF0472 protein C16orf72; ENSEMBL:ENSP00000331720
20C17H11.4C17H11.4n/achrX 8,181,277contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is ari-1-PC;; FLYBASE:CG5659
21F26A1.1F26A1.1n/achrIII 4,851,165
22T01G5.7T01G5.7n/achrV 15,112,773contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
23F43D2.1F43D2.1n/achrV 14,613,051contains similarity to Pfam domain PF00134 Cyclin, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR006670 (Cyclin), IPR011028 (Cyclin-like), IPR013763 (Cyclin-related), IPR006671 (Cyclin, N-terminal), IPR015429 (Transcription regulator cyclin)
24T20D3.8T20D3.8n/achrIV 9,342,540contains similarity to Pfam domain PF06432 Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR009450 (Phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase)
25ftr-1Y113G7B.4n/achrV 20,192,960This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
26R11H6.4R11H6.4n/achrV 14,610,325contains similarity to Homo sapiens Steerin3 protein; ENSEMBL:ENSP00000228327
27fbxa-181F35E12.3n/achrV 13,726,386This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28rfc-3C39E9.13n/achrIV 13,096,350C. elegans RFC-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR008921 (DNA polymerase III clamp loader subunit, C-terminal), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
29sdz-36ZK1251.7n/achrIV 9,691,129C. elegans SDZ-36 protein
30F19B10.2F19B10.2n/achrII 3,676,170
31F16H11.3F16H11.3n/achrX 4,648,333contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domains IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
32ZC477.5ZC477.5n/achrIV 7,102,332
33T04D3.1T04D3.1n/achrI 13,303,528contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
34M02B7.4M02B7.4n/achrIV 3,802,482contains similarity to Pfam domain PF08660 Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like contains similarity to Interpro domain IPR013969 (Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like)
35C54G4.9C54G4.9n/achrI 8,025,714contains similarity to Pyrococcus furiosus Hypothetical protein PF0537.; TR:Q8U3D2
36C01G5.5C01G5.5n/achrIV 6,525,508contains similarity to Pfam domain PF00248 Aldo/keto reductase family contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
37F28F8.5F28F8.5n/achrV 15,574,751contains similarity to Methanosarcina mazei Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E (EC 6.3.5.-) (Glu-ADTssubunit E).; SW:GATE_METMA
38C36C9.1C36C9.1n/achrX 1,684,665contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
39F40G9.7F40G9.7n/achrIII 165,986
40C33H5.6C33H5.6n/achrIV 7,776,604contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
41rab-21T01B7.3n/achrII 8,714,514rab-21 encodes a Rab GTPase most closely related to the Drosophila and vertebrate Rab21 GTPases and Saccharomyces cerevisiae VPS21; by homology, RAB-21 is predicted to be involved in membrane trafficking/vesicle transport; loss of rab-21 activity via RNAi results in 7-8% embryonic lethality.
42R11H6.5R11H6.5n/achrV 14,611,457contains similarity to Pfam domain PF07528 DZF contains similarity to Interpro domains IPR006561 (DZF), IPR006116 (2-5-oligoadenylate synthetase, ubiquitin-like region)
43F54F7.6F54F7.6n/achrX 11,866,107contains similarity to Homo sapiens Golgi autoantigen, golgin subfamily B member 1; ENSEMBL:ENSP00000315938
44C32B5.10C32B5.10n/achrII 947,356
45bath-19F59H6.1n/achrII 2,037,587C. elegans BATH-19 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (3), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
46tag-146C27A12.3n/achrI 6,039,839C. elegans TAG-146 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
47cyn-12C34D4.12n/achrIV 7,132,656cyn-12 encodes a member of the cyclophilin family that is related to human PPIL1 (CGI-124); based upon its sequence similarity, CYN-12 is predicted to be a cytoplasmic protein potentially involved in a wide range of signal transduction pathways.
48T24H7.4T24H7.4n/achrII 6,245,914
49F23H12.7F23H12.7n/achrV 12,372,277contains similarity to Interpro domain IPR001463 (Sodium:alanine symporter)
50fkh-4C29F7.5n/achrX 13,429,320fkh-4 encodes a member of the forkhead domain transcription factor family.