UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1EGAP4.1EGAP4.14e-62chrX 8,727,142
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3B0294.1B0294.1n/achrX 1,897,093
4F53C3.5F53C3.5n/achrII 3,900,316contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
5F58B4.3F58B4.3n/achrV 10,930,269contains similarity to Homo sapiens similar to bA88M19.1 (EGF-like-domain multiple 5 protein); ENSEMBL:ENSP00000223618
6F53C3.3F53C3.3n/achrII 3,903,698contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
7C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
8D1069.1D1069.1n/achrII 341,505contains similarity to Interpro domain IPR004032 (PMP-22/EMP/MP20)
9ttr-23T21C9.8n/achrV 10,589,462C. elegans TTR-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
10F10E9.1F10E9.1n/achrIII 8,323,702
11pqn-74W02A2.3n/achrIV 13,330,430pqn-74 encodes a protein with two chitin-binding peritrophin-A domains, separated by a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain; like CEJ-1 and CPG-2, PQN-74 might participate in eggshell synthesis and early embryonic development, and PQN-74's peritrophin-A domains might enable mechanical cross-linking of chitin.
12eak-4F53B2.3n/achrIV 12,524,964eak-4 encodes a novel protein that contains an N-myristoylation signal; eak-4 acts in parallel to akt-1 to regulate insulin-like signaling and dauer formation; EAK-4 is expressed primarily in the neuroendocrine XXXL/R cells, where it associates with the plasma membrane.
13srg-68ZC317.5n/achrV 5,464,597C. elegans SRG-68 protein ;
14R05A10.2R05A10.2n/achrIV 14,178,019contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Actin-binding protein that stabilizes actin filaments; Tpm1, the main tropomyosin, is required for the formation and stability of actin cables in vivo which direct polarized cell growth and the distribution of several organelles.; SGD:YNL079C
15T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
16C17H12.10C17H12.10n/achrIV 6,808,208
17F53C3.4F53C3.4n/achrII 3,902,067contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
18glc-3ZC317.3n/achrV 5,451,485The glc-3 gene encodes a fipronil and BIDN-sensitive, but picrotoxinin-insensitive, L-glutamate-gated chloride channel subunit.
19Y44A6D.2Y44A6D.2n/achrV 20,785,516contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
20C31H5.5C31H5.5n/achrI 9,048,863contains similarity to Mus musculus Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 2 (Eukaryoticstranslation initiation factor 2 beta subunit) (eIF-2-beta).; SW:IF2B_MOUSE
21C39B10.1C39B10.1n/achrX 10,461,995contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
22tsp-4F53B2.2n/achrIV 12,519,672C. elegans TSP-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
23cyp-34A7B0213.12n/achrV 3,962,772C. elegans CYP-34A7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
24F20C5.6F20C5.6n/achrIV 8,772,362contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2DLG0
25C53C11.2C53C11.2n/achrX 17,337,870
26gpc-1K02A4.2n/achrX 12,881,921The gpc-1 gene encodes a heterotrimeric guanine nucleotide-binding protein gamma subunit, expressed specifically in sensory neurons, that is involved in taste adaptation.
27egl-20W08D2.1n/achrIV 9,813,959egl-20 encodes a member of the WNT family of developmental signaling proteins that affects migration of QL and QR and their descendents; expressed in muscle and epidermal cells at the posterior of the worm.
28ins-30ZC334.2n/achrI 14,035,617ins-30 encodes an insulin-like peptide.
29eat-4ZK512.6n/achrIII 9,139,280eat-4 encodes an ortholog of the mammalian BNPI vesicular glutamate transporter that affects chemotaxis, feeding, foraging and thermotaxis; eat-4 is expressed in specific neurons, including M3L and M3R which are known to be glutamatergic.
30R13H4.7R13H4.7n/achrV 11,867,399contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
31sru-36R07B5.6n/achrV 9,842,407C. elegans SRU-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
32gst-2K08F4.6n/achrIV 10,140,892C. elegans GST-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
33sre-23ZK265.5n/achrI 8,257,642C. elegans SRE-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
34sru-44T08G3.8n/achrV 16,467,175C. elegans SRU-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
35glb-27W01C9.5n/achrII 8,548,030glb-27 encodes a globin whose expression is probably induced by anoxia in a HIF-1-dependent manner; glb-27 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-27 has no obvious function in mass RNAi assays.
36cpx-2K03A11.2n/achrX 13,067,761C. elegans CPX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF05835 Synaphin protein contains similarity to Interpro domain IPR008849 (Synaphin)
37R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
38numr-2F08F8.1n/achrIII 7,365,432C. elegans NUMR-2 protein ;
39nlp-15CC4.2n/achrI 12,991,841C. elegans NLP-15 protein ; contains similarity to Procambarus clarkii Orcokinin peptides type A precursor [Contains: Orcomyotropin-likespeptide; Orcokinin; Orcokinin-like peptide].; SW:Q9NL83
40F40F9.10F40F9.10n/achrV 9,712,554contains similarity to Pfam domain PF02475 Met-10+ like-protein contains similarity to Interpro domain IPR003402 (Protein of unknown function Met10)
41T09E11.5T09E11.5n/achrI 12,358,131contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42sdz-8C55A6.5n/achrV 11,515,643C. elegans SDZ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
43tsp-5Y45F10B.1n/achrIV 13,591,144C. elegans TSP-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
44F40G9.6F40G9.6n/achrIII 179,840
45C14A6.2C14A6.2n/achrV 18,151,568contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
47F44G4.6F44G4.6n/achrII 9,001,316contains similarity to Interpro domain IPR001209 (Ribosomal protein S14)
48F21C10.9F21C10.9n/achrV 9,097,952contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
49T10C6.2T10C6.2n/achrV 16,013,354contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50R07E3.7R07E3.7n/achrX 10,343,094contains similarity to Borrelia burgdorferi Outer surface protein C (Fragment).; TR:Q93Q85