UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1cut-4E04D5.30chrII 10,437,905C. elegans CUT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
2F07C6.2F07C6.2n/achrIV 12,791,374contains similarity to Amblyomma hebraeum 9.8 kDa basic protein.; TR:Q9GPM1
3R07E4.3R07E4.3n/achrX 5,953,576contains similarity to Pfam domain PF02939 UcrQ family contains similarity to Interpro domain IPR004205 (UcrQ)
4B0495.2B0495.2n/achrII 7,700,550contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR008351 (JNK MAP kinase), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core)
5F32H5.1F32H5.1n/achrV 13,357,051contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
6srxa-2F56D5.10n/achrIV 9,423,882C. elegans SRXA-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
7srz-64Y57G7A.7n/achrII 1,291,002C. elegans SRZ-64 protein ;
8F02D8.4F02D8.4n/achrV 14,986,177contains similarity to Pfam domain PF00246 Zinc carboxypeptidase contains similarity to Interpro domains IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A), IPR009020 (Proteinase inhibitor, propeptide)
9zig-6T03G11.8n/achrX 5,187,948zig-6 encodes a predicted secreted protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; loss of zig-6 activity in large-scale RNAi screens results in a Clear phenotype; a zig-6::gfp reporter fusion is expressed in anterior and posterior body wall muscle.
10nhr-210R11G11.12n/achrV 518,366C. elegans NHR-210 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11ZC84.6ZC84.6n/achrIII 9,196,038contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
12dnj-21T19B4.4n/achrI 5,677,239This gene encodes a protein containing a DnaJ ('J') domain.
13hmit-1.1Y51A2D.4n/achrV 18,520,286hmit-1.1 encodes one of three C. elegans proton (H+)-dependent myo-inositol transporters; loss of hmit-1.1 activity via large-scale RNAi result in no obvious abnormalities but by homology, HMIT-1.1 is predicted to function as a plasma membrane protein required for the regulated uptake of myo-inositol and thus potentially for regulation of cell signaling and intracellular osmolarity.
14D1054.1D1054.1n/achrV 10,769,166contains similarity to Pfam domain PF01734 Patatin-like phospholipase contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin)
15math-24C46F9.3n/achrII 1,901,084The C46F9.3 gene encodes a protein with a meprin-associated Traf homology (MATH) domain that may be involved in apoptosis.
16fbxa-54T12B5.2n/achrIII 957,051This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
17nspb-3F38A5.5n/achrIV 6,594,788C. elegans NSPB-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF07312 Protein of unknown function (DUF1459) contains similarity to Interpro domain IPR009924 (Protein of unknown function DUF1459)
18D1022.4D1022.4n/achrII 7,456,724contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
19nas-38F57C12.1n/achrX 560,901C. elegans NAS-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
20amx-3F25C8.2n/achrV 20,896,026C. elegans AMX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR001613 (Flavin-containing amine oxidase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
21F35B3.4F35B3.4n/achrX 17,020,129contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
22K06A5.1K06A5.1n/achrI 6,475,395contains similarity to Xenopus laevis MGC52985 protein.; TR:Q7ZWX1
23F10E7.3F10E7.3n/achrII 7,124,926
24H12D21.10H12D21.10n/achrV 14,905,809contains similarity to Pfam domain PF04577 Protein of unknown function (DUF563) contains similarity to Interpro domain IPR007657 (Protein of unknown function DUF563)
25ZC204.12ZC204.12n/achrII 1,656,785contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
26C50B6.7C50B6.7n/achrV 13,323,656contains similarity to Pfam domains PF02806 (Alpha amylase, C-terminal all-beta domain) , PF00128 (Alpha amylase, catalytic domain) contains similarity to Interpro domains IPR006046 (Glycoside hydrolase family 13), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR006048 (Alpha-amylase, C-terminal all beta), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core), IPR006047 (Glycosyl hydrolase, family 13, catalytic region), IPR006589 (Glycosyl hydrolase, family 13, subfamily, catalytic region), IPR013780 (Glycosyl hydrolase, family 13, all-beta)
27B0391.10B0391.10n/achrV 15,589,316contains similarity to Mus musculus Serine/threonine protein phosphatase 2B catalytic subunit, gammasisoform (EC 3.1.3.16) (Calmodulin-dependent calcineurin A subunit,sgamma isoform) (Calcineurin, testis-specific catalytic subunit)s(CAM-PRP catalytic subunit).; SW:P2BC_MOUSE
28F55A12.5F55A12.5n/achrI 5,347,791contains similarity to Gallus gallus Nucleolin (Protein C23).; SW:P15771
29F45C12.16F45C12.16n/achrII 1,737,908contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
30K01D12.5K01D12.5n/achrV 12,398,255contains similarity to Interpro domain IPR003980 (Histamine H3 receptor)
31C06G8.1C06G8.1n/achrIV 10,779,821contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domains IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel)
32C05D12.2C05D12.2n/achrII 11,420,763contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR006582 (Region of unknown fuction MD, Caenorhabditis elegans)
33abu-2F19G12.7n/achrX 1,409,740abu-2 encodes a transmembrane protein with a predicted signal sequence, a glutamine/asparagine-rich domain and multiple cysteine-rich repeats (DUF139); abu-2 expression is induced by blockage of the unfolded-protein response in the endoplasmic reticulum, and ABU-2 may help protect the organism from damage by improperly folded nascent protein.
34W01A8.6W01A8.6n/achrI 7,072,690contains similarity to Pfam domain PF00246 Zinc carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A)
35C06E8.5C06E8.5n/achrIII 7,003,767contains similarity to Pfam domain PF02886 LBP / BPI / CETP family, C-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
36pes-8F18G5.2n/achrX 9,254,218pes-8 encodes a novel protein that contains a proline-rich region and a predicted transmembrane domain, but no otherwise recognizably conserved domains; pes-8 was identified in promoter trapping screens and based on large-scale RNA-mediated interference (RNAi) screens, appears to be required for egg laying, germline development, locomotion, and regulation of adult lifespan; a pes-8 reporter is expressed at the cell surfaces of the spermathecal valve cell, the uterine wall, the vulva, and the rectal epithelium; strong expression is also detected in the uterus during its development; PES-8 may be required for normal morphology of the openings of the spermathecal valve, the vulva, and the rectum, a hypothesis consistent with its expression pattern and RNAi phenotype.
37rad-54W06D4.6n/achrI 9,067,667rad-54 is orthologous to the human gene RAD54 (RAD54L; OMIM:603615), which when mutated leads to disease.
38grd-6T18H9.1n/achrV 9,223,090grd-6 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity proline-rich domain, and a C-terminal Ground domain; GRD-6 is expressed in hypodermis and in various neurons, in both head and tail, and the PVT interneuron; the Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-6 has no obvious function in RNAi assays.
39C34C12.7C34C12.7n/achrIII 3,485,435
40cpin-1F38E11.3n/achrIV 9,452,280cpin-1 is orthologous to a mammalian protein variously identified as guanine aminohydrolase (or guanine deaminase, or guanase), cypin, or p51-nedasin.
41M01B2.8M01B2.8n/achrV 15,260,488contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
42F53F4.12F53F4.12n/achrV 13,626,710contains similarity to Plasmodium falciparum Histidine-rich protein.; SW:HRP3_PLAFS
43K11G9.2K11G9.2n/achrV 6,675,280contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
44F49E12.10F49E12.10n/achrII 8,391,583contains similarity to Pfam domain PF01598 contains similarity to Interpro domain IPR006088 (Sterol desaturase)
45gst-42D1053.1n/achrX 11,727,007gst-42 is orthologous to the human gene GLUTATHIONE TRANSFERASE ZETA-1 (also known as MALEYLACETOACETATE ISOMERASE; GSTZ1; OMIM:603758), which when mutated is thought to lead to a variety of type I tyrosinemia.
46ugt-49AC3.2n/achrV 10,373,259C. elegans UGT-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
47hlh-15C43H6.8n/achrX 2,413,123C. elegans HLH-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
48mlt-7ZK430.8n/achrII 4,398,894C. elegans MLT-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF01549 (ShK domain-like) , PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
49srh-231C03G6.11n/achrV 7,351,540C. elegans SRH-231 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
50T01G1.3T01G1.3n/achrIV 11,368,676contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002110 (Ankyrin), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)