UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1fbxb-80E04A4.29e-121chrIV 4,735,325C. elegans FBXB-80 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
2F08G2.4F08G2.4n/achrII 13,830,819contains similarity to Interpro domain IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein)
3F32H2.6F32H2.6n/achrI 8,999,077contains similarity to Pfam domain PF00109 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR000794 (Beta-ketoacyl synthase), IPR014030 (Beta-ketoacyl synthase, N-terminal), IPR016039 (Thiolase-like)
4F35B3.1F35B3.1n/achrX 17,016,472contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
5C33A12.4C33A12.4n/achrIV 9,510,301contains similarity to Homo sapiens Acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member E; ENSEMBL:ENSP00000324074
6T21D12.7T21D12.7n/achrIV 290,077contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
7F53A9.4F53A9.4n/achrX 8,705,694
8F46B3.14F46B3.14n/achrV 20,626,135contains similarity to Interpro domain IPR003645 (Follistatin-like, N-terminal)
9sdz-23F58G4.4n/achrV 8,100,032sdz-23 encodes a putatively secreted protein with a single EGF domain, with some similarity to LAG-2; sdz-23 begins to be expressed in the E blastomere of 8-cell embryos, and continues to be expressed solely in the E lineage througout embryogenesis; sdz-23 requires SKN-1 and WRM-1 for E lineage expression, and is a putative MED-1/2 target gene; sdz-23 is both activated by POP-1 (with SYS-1 as coactivator, in the E lineage) and repressed by POP-1 (in the MS lineage), while the dependence of sdz-23 on WRM-1 for E lineage expression is alleviated by loss of POP-1, indicating that WRM-1 switches POP-1 from repression to activation in the E lineage; sdz-23 requires SYS-1 for normal embryonic expression; SDZ-23 has no obvious function in mass RNAi assays.
10T22B7.4T22B7.4n/achrX 5,639,932contains similarity to Pfam domain PF07039 Protein of unknown function (DUF1325) contains similarity to Interpro domain IPR010750 (Protein of unknown function DUF1325)
11arl-3F19H8.3n/achrII 14,607,534arl-3 encodes a member of the ARL (ADP-ribosylation factor(ARF)-like) family of proteins which are very similar to ARF proteins but lack the ability to stimulate ADP ribosylation by cholera toxin; as loss of arl-3 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of ARL-3 is not yet known.
12Y42A5A.4Y42A5A.4n/achrV 11,106,364contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
13C17C3.3C17C3.3n/achrII 5,562,616contains similarity to Pfam domain PF02551 Acyl-CoA thioesterase contains similarity to Interpro domain IPR003703 (Acyl-CoA thioesterase)
14W03B1.8W03B1.8n/achrIV 4,344,287contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
15srj-13R13D7.3n/achrV 7,403,263C. elegans SRJ-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16Y43F8A.1Y43F8A.1n/achrV 19,370,930contains similarity to Rhizobium sp Probable conjugal transfer protein trbD.; SW:TRBD_RHISN
17W03D8.1W03D8.1n/achrI 2,789,083contains similarity to Cryptosporidium hominis Putative uncharacterized protein.; TR:Q5CFZ6
18T21C9.11T21C9.11n/achrV 10,594,469contains similarity to Homo sapiens Popeye domain containing protein 3; ENSEMBL:ENSP00000254765
19fbxb-71F40F4.10.000000001chrX 3,263,537This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
20ifta-2T28F3.6n/achrIV 17,301,376ifta-2 encodes a ciliary protein, orthologous to human RABL5, that is required for normally short life span and dauer formation; IFTA-2 is expressed in amphid, labial, and phasmid ciliated sensory neurons; intracellularly, IFTA-2 resides in the bases and axonemes of cilia, colocalizing with DAF-2 and AGE-1; IFTA-2 may be either a cargo or a cargo-docking component of intraflagellar transport (IFT) by the IFT-B complex; ciliary basal localization of IFTA-2 is abolished by a T42N mutation predicted to lock ITFA-2 into an inactive, GDP-bound conformation; ifta-2(tm1724) mutants have abnormally long lifespans and constitutive dauer formation, perhaps because IFTA-2 regulates DAF-2 signalling from ciliated sensory neurons; IFTA-2 is not required for cilium assembly or IFT, nor is it required for chemosensation or osmosensation; the ciliary localization of IFTA-2 is conserved in RABL5; via an X-box in its promoter, ifta-2 is a candidate for direct regulation by DAF-19.
21F22F7.3F22F7.3n/achrV 2,113,100contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22C12D12.3C12D12.3n/achrX 3,490,216
23gst-8F11G11.1n/achrII 4,884,139gst-8 encodes a predicted glutathione S-transferase.
24nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
25F18A12.1F18A12.1n/achrII 3,418,742F18A12.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.1 has no clear orthologs in other organisms.
26F28B1.2F28B1.2n/achrV 17,047,282contains similarity to Arabidopsis thaliana T12C22.10 protein.; TR:Q9LPE8
27W04A4.3W04A4.3n/achrI 13,680,877contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
28math-48ZK250.6n/achrII 1,945,985C. elegans MATH-48 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00917 (MATH domain) (4)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR012885 (F-box associated type 2)
29fbxa-73T20H9.4n/achrIII 2,254,103C. elegans FBXA-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
30Y45F3A.4Y45F3A.4n/achrIII 10,573,829contains similarity to Interpro domain IPR008967 ()
31R02F2.2R02F2.2n/achrIII 5,493,250contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001331 (Guanine-nucleotide dissociation stimulator, CDC24, conserved site)
32T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
33C17A2.4C17A2.4n/achrII 3,840,560contains similarity to Cebus apella Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1 (EC 2.4.1.69) (GDP-L-sfucose:beta-D-galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1)s(Alpha(1,2)FT 1) (Fucosyltransferase 1).; SW:Q866E8
34T26E4.3T26E4.3n/achrV 15,783,606contains similarity to Pfam domain PF01531 (Glycosyl transferase family 11)
35nas-24F20G2.4n/achrV 13,770,454nas-24 encodes an astacin-like metalloprotease.
36clec-109F17B5.3n/achrI 13,197,634C. elegans CLEC-109 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37M28.4M28.4n/achrII 10,645,246contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein 2; ENSEMBL:ENSP00000324020
38str-13C24B9.8n/achrV 2,726,550C. elegans STR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39srh-300Y94A7B.6n/achrV 17,822,964C. elegans SRH-300 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40C14E2.4C14E2.4n/achrX 1,819,435contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
41F41D3.8F41D3.8n/achrI 12,267,803contains similarity to Pfam domain PF01697 (Domain of unknown function)
42F53F10.1F53F10.1n/achrI 3,835,946contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 102A; ENSEMBL:ENSP00000258214
43pdl-1C27H5.1n/achrII 7,184,432C. elegans PDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05351 GMP-PDE, delta subunit contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR017287 (Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3', 5'-cyclic phosphodiesterase, delta subunit), IPR008015 (GMP phosphodiesterase, delta subunit)
44T21C12.3T21C12.3n/achrIII 10,538,504contains similarity to Leptospira interrogans Hypothetical protein.; TR:Q8EZD2
45ZC373.2ZC373.2n/achrX 10,058,054contains similarity to Synechococcus elongatus Tll2335 protein.; TR:Q8DGI2
46R07C3.14R07C3.14n/achrII 929,840
47T23C6.4T23C6.4n/achrX 17,148,667contains similarity to Lactobacillus plantarum Translation initiation factor IF-2.; SW:Q88VK7
48srh-79C04F2.1n/achrV 7,498,378C. elegans SRH-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49clec-139F35D11.10n/achrII 4,620,939C. elegans CLEC-139 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
50F35F10.12F35F10.12n/achrV 3,314,352contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000698 (Arrestin), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)