UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1E02H9.9E02H9.96e-61chrIII 2,467,742
2C35E7.7C35E7.7n/achrI 10,814,340
3F47C12.8F47C12.8n/achrIV 3,997,448contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
4srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5tag-272C34B2.1n/achrI 10,689,540C. elegans TAG-272 protein ;
6F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
7sfa-1Y116A8C.32n/achrIV 17,107,555Y116A8C.32 encodes an ortholog of splicing factor SF1, which enables 3' splice site recognition by binding U2AF65 and the intron branch site during splicing complex formation; Y116A8C.32 shares several domains with mammalian SF1 proteins (a U2AF65 binding domain, a hnRNP K homology domain, two RNA-binding zinc knuckles, and a proline-rich C-terminal domain), while also sharing a hydrophilic N-terminal domain (enriched for serine, arginine, lysine, and aspartate) with Drosophila but not mammalian SF1; Y116A8C.32's N-terminal domain resembles RS domains in other splicing proteins; Y116A8C.32 is required for embryonic viability, normally rapid growth, and proper body morphology.
8cwp-2C37H5.11n/achrV 4,842,261cwp-2 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
9ubc-24F49E12.4n/achrII 8,406,159ubc-24 encodes a predicted conjugating enzyme (UBCs/E2s) of the ubiquitin-conjugation system.
10F47C12.6F47C12.6n/achrIV 3,991,939contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
11R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
12T10D4.7T10D4.7n/achrII 3,118,051contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
13sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14nhr-225T27B7.2n/achrV 2,289,169C. elegans NHR-225 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15clec-158R13F6.8n/achrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
16F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
17clec-108Y26D4A.6n/achrI 13,081,794C. elegans CLEC-108 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
18AC7.3AC7.3n/achrIV 5,112,248
19F35C5.4F35C5.4n/achrII 12,891,236contains similarity to Homo sapiens Mucin-2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000351956
20D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
21clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
22Y43F8C.15Y43F8C.15n/achrV 19,705,582
23C25F9.8C25F9.8n/achrV 19,395,796contains similarity to Nicotiana glutinosa Ribonuclease NW.; TR:Q7XZV5
24srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25clec-130W10G11.14n/achrII 3,574,098C. elegans CLEC-130 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26ani-1Y49E10.19n/achrIII 12,449,658ani-1 encodes one of three C. elegans anillins; ANI-1 activity is required in the early embryo for cortical contractile events, including polar body extrusion, membrane ruffling, and pseudocleavage; at later stages of development, ANI-1 also plays a role in cuticle formation, coordinated locomotion, vulval development, and male tail formation; in regulating cortical events, ANI-1 appears to function by positively regulating septin (UNC-59 and UNC-61) localization to the contractile ring as well as formation of septin- and NMY-2-containing cortical patches; in telophase embryos, ANI-1 localizes to the cell cortex and cleavage furrow.
27F55C12.6F55C12.6n/achrII 5,875,271contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
28Y4C6B.3Y4C6B.3n/achrIV 5,335,043contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
29C46H11.6C46H11.6n/achrI 5,022,021contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
30snf-7ZK1010.9n/achrIII 13,008,187C. elegans SNF-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00209 Sodium:neurotransmitter symporter family contains similarity to Interpro domain IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter)
31D2062.5D2062.5n/achrII 2,623,045
32T05C12.9T05C12.9n/achrII 8,192,426contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF02149 (Kinase associated domain 1) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001772 (Kinase-associated KA1), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
33F32B6.10F32B6.10n/achrIV 9,888,531contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
34cwp-1C37H5.10n/achrV 4,840,930cwp-1 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
35B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
36W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
38R13G10.4R13G10.4n/achrIII 3,827,770R13G10.4 encodes a predicted transmembrane protein orthologous to human ACDP1-ACDP4 and S. cerevisiae MAM3, and paralogous to C01H6.6, C33D12.2, C52D10.12, M02F4.3, and R04E5.2; by orthology with MAM3, R13G10.4 may participate in metal homoeostasis; R13G10.4, MAM3, and ACDP1-ACDP4 belong to a family of proteins (sharing an ACD domain) from bacteria, yeast, plants, and metazoa; murine Acdp1 is a plasma membrane protein; bacterial proteins containing the ACD domain include CorC from Salmonella typhimurium, which is involved in magnesium and cobalt efflux; R13G10.4 is required for normal development in mass RNAi assays.
39Y116A8C.38Y116A8C.38n/achrIV 17,132,537contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
40ZK1010.5ZK1010.5n/achrIII 12,985,882contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
41F25C8.1F25C8.1n/achrV 20,903,971contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
42fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
43clec-261ZC15.6n/achrV 20,287,601C. elegans CLEC-261 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000817 (Prion protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
44clec-217F26D11.9n/achrV 7,958,038C. elegans CLEC-217 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
45Y66A7A.4Y66A7A.4n/achrIII 11,614,038
46C05B5.1C05B5.1n/achrIII 9,987,900contains similarity to Clostridium acetobutylicum Membrane associated chemotaxis sensory transducer protein (MSPsdomain and HAMP domain).; TR:Q97JD4
47C32B5.15C32B5.15n/achrII 971,803This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
48ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
49Y23H5A.4Y23H5A.4n/achrI 2,618,955contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
50clec-193Y116A8A.3n/achrIV 16,805,692C. elegans CLEC-193 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)