UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1E02C12.12E02C12.125.000000000000001e-125chrV 9,380,457contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domain IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
2amt-2F49E11.3n/achrIV 13,044,619amt-2 encodes a transmembrane protein that is one of four C. elegans members of the ammonium transporter AMT/Rh family of proteins predicted to function in transport of ammonium ions across the plasma membrane.
3C16D9.6C16D9.6n/achrV 8,249,274contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9520-PA;; FLYBASE:CG9520
4srt-25C16D9.7n/achrV 8,257,371C. elegans SRT-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
5T05E11.2T05E11.2n/achrIV 11,115,881T05E11.2 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; T05E11.2 is worm-specific, with a with highly divergent sequence lacking obvious homologs; T05E11.2 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
6C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
7srh-142T08G3.3n/achrV 16,460,149C. elegans SRH-142 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8K03A11.4K03A11.4n/achrX 13,080,030contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
9srd-71C13B7.4n/achrV 2,424,746C. elegans SRD-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001614 (Myelin proteolipid protein PLP), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002016 (Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial)
10srh-192ZC132.7n/achrV 4,313,561C. elegans SRH-192 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11F16F9.1F16F9.1n/achrX 8,448,780contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
12F28F9.3F28F9.3n/achrIV 3,831,378
13dmd-4C27C12.6n/achrX 14,859,502C. elegans DMD-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00751 (DM DNA binding domain) , PF03474 (DMRTA motif) contains similarity to Interpro domains IPR005173 (DMRTA motif), IPR001275 (DM DNA-binding)
14F58B4.2F58B4.2n/achrV 10,918,030contains similarity to Pfam domain PF00173 Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001199 (Cytochrome b5)
15F48B9.1F48B9.1n/achrX 2,183,370contains similarity to Interpro domain IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
16nlp-22T24D8.3n/achrX 2,341,705C. elegans NLP-22 protein ;
17K03H9.1K03H9.1n/achrII 6,431,519
18F31B9.2F31B9.2n/achrX 15,919,200contains similarity to Mus musculus Radixin (ESP10).; SW:RADI_MOUSE
19K02D10.3K02D10.3n/achrIII 8,771,549
20W04G5.3W04G5.3n/achrI 11,629,776contains similarity to Arabidopsis thaliana Probable WRKY transcription factor 19 (WRKY DNA-binding protein 19).; SW:WR19_ARATH
21srg-13T23F11.5n/achrIII 4,673,171C. elegans SRG-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
22nhr-216T09D3.4n/achrV 5,356,451C. elegans NHR-216 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23C17B7.9C17B7.9n/achrV 3,331,512contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
24C30B5.5C30B5.5n/achrII 6,204,855contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR013806 (Kringle-like fold), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
25Y43F8B.10Y43F8B.10n/achrV 19,475,668
26H28G03.3H28G03.3n/achrX 5,221,191
27aat-7F54D12.3n/achrII 1,389,233aat-7 encodes a predicted amino acid transporter catalytic subunit; unlike catalytic subunits in other organisms, however, AAT-7 does not contain the highly conserved cysteine residue known to facilitate covalent interaction with a glycoprotein subunit, suggesting that AAT-7 does not require this residue for heterodimer formation or alternatively, does not require the glycoprotein subunit for function.
28H40L08.3H40L08.3n/achrX 15,073,031contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
29Y51A2B.5Y51A2B.5n/achrV 18,390,243contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
30nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31F15D3.8F15D3.8n/achrI 11,580,950contains similarity to Methanocaldococcus jannaschii Chromosome partition protein smc homolog.; SW:Q59037
32C01A2.6C01A2.6n/achrI 13,382,132contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q54BK4
33str-150T03E6.4n/achrV 16,584,195C. elegans STR-150 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35srbc-56F54B8.12n/achrV 15,831,110C. elegans SRBC-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36fbxa-188F47H4.8n/achrV 17,343,887This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37nhr-171C54F6.8n/achrV 7,512,900C. elegans NHR-171 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
38M03D4.6M03D4.6n/achrIV 6,144,282contains similarity to Pfam domain PF02171 Piwi domain contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
39K07H8.8K07H8.8n/achrIV 8,267,574contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
40F49D11.2F49D11.2n/achrI 10,922,443contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
41F10D7.4F10D7.4n/achrX 17,380,140
42srd-36R04D3.6n/achrX 13,294,014C. elegans SRD-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43F41E6.1F41E6.1n/achrV 8,624,595
44K04F1.11K04F1.11n/achrV 1,660,979contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
45C08H9.11C08H9.11n/achrII 9,858,792contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
46srb-19C54F6.11n/achrV 7,518,912C. elegans SRB-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
47tag-194W02D3.6n/achrI 6,730,509C. elegans TAG-194 protein; contains similarity to Pfam domain PF00153 Mitochondrial carrier protein contains similarity to Interpro domains IPR002067 (Mitochondrial carrier protein), IPR002030 (Mitochondrial brown fat uncoupling protein), IPR001993 (Mitochondrial substrate carrier), IPR002113 (Adenine nucleotide translocator 1)
48F08F3.1F08F3.1n/achrV 5,447,387
49ZK938.4ZK938.4n/achrII 9,835,995contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
50ZK112.5ZK112.5n/achrIII 7,738,805