UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srh-77DC2.66e-92chrV 224,988C. elegans SRH-77 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2C28G1.4C28G1.4n/achrX 8,851,319contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
3srh-97F49H6.44.0000000000000004e-23chrV 17,018,412C. elegans SRH-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
5C50F2.2C50F2.2n/achrI 3,885,072contains similarity to Interpro domain IPR002951 (Atrophin)
6Y52B11A.10Y52B11A.10n/achrI 11,045,757contains similarity to Pfam domains PF02854 (MIF4G domain) , PF02847 (MA3 domain) contains similarity to Interpro domains IPR003890 (MIF4G-like, type 3), IPR016021 (MIF4-like, type 1/2/3), IPR003891 (Initiation factor eIF-4 gamma, MA3), IPR016024 (Armadillo-type fold)
7sru-16Y45F10B.4n/achrIV 13,581,181C. elegans SRU-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
8F09E10.6F09E10.6n/achrX 1,496,339
9sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
10immp-1C24H11.6n/achrIII 11,775,731C. elegans IMMP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00717 Peptidase S24-like contains similarity to Interpro domains IPR001733 (Peptidase S26B, eukaryotic signal peptidase), IPR015927 (Peptidase S24, S26A, S26B and S26C), IPR014037 (Peptidase S26A), IPR011056 (Peptidase S24, S26A and S26B, C-terminal), IPR000223 (Peptidase S26A, signal peptidase I)
11srw-94H06H21.1n/achrIV 4,815,890C. elegans SRW-94 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
12W08F4.10W08F4.10n/achrII 590,892contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
13R53.2R53.2n/achrII 9,964,971contains similarity to Pfam domain PF02223 Thymidylate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000062 (Thymidylate kinase)
14apx-1K08D9.3n/achrV 3,216,670apx-1 encodes one of ten C. elegans DSL (Delta, Serrate, LAG-2) proteins, integral transmembrane and secreted proteins that function as signaling ligands for the Notch family receptors GLP-1 and LIN-12; in the 4-cell embryo, maternally supplied APX-1 functions as a GLP-1 ligand for an inductive interaction that specifies the fate of the ABp blastomere; later in embryogenesis, APX-1 is required for formation of the LIN-12-dependent, invariant asymmetrical twist that occurs as part of normal gut morphogenesis; during larval development, APX-1 is required redundantly with DSL-1 and LAG-2 for the LIN-12-mediated lateral signal that spatially patterns the primary and secondary vulval cell lineages; in the early embryo, APX-1 is first detected at the anterior edge of the P1 blastomere, with later expression visible in P2 at sites of contact with ABp, and in the cytoplasm of the EMS and P3 blastomeres; expression in the vulval precursor cells (VPCs) is detected in the primary VPC, P6.p, and its descendants; embryonic APX-1 expression is dependent upon PIE-1 activity, while later vulval expression is mediated by the Ras signaling pathway and the SUR-2 transcriptional cofactor.
15F31F4.1F31F4.1n/achrV 685,113contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
16C05E4.7C05E4.7n/achrV 742,319
17athp-1C44B9.4n/achrIII 10,887,899C. elegans ATHP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF02178 (AT hook motif) (2), PF00628 (PHD-finger) contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000294 (Vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic region), IPR000253 (Forkhead-associated), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
18F49C12.2F49C12.2n/achrIV 9,298,599contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
19C29F9.8C29F9.8n/achrIII 96,559
20F40G9.1F40G9.1n/achrIII 196,177contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
21F47B10.9F47B10.9n/achrX 10,913,178contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013089 (Kelch related)
22B0511.5B0511.5n/achrI 10,630,197contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
23fbxa-45F09C6.6n/achrV 16,898,926This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
24T14G10.8T14G10.8n/achrIV 10,146,609contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P08235 Mineralocorticoid receptor; ENSEMBL:ENSP00000281330
25ZK546.5ZK546.5n/achrII 4,936,745contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
26clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27srg-59C24B9.7n/achrV 2,724,113C. elegans SRG-59 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
28C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0
29nhr-179F16B4.11n/achrV 1,616,853C. elegans NHR-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30Y49F6C.8Y49F6C.8n/achrII 3,369,682
31W04G3.7W04G3.7n/achrX 11,084,822contains similarity to Interpro domain IPR001211 (Phospholipase A2)
32F47E1.3F47E1.3n/achrX 9,049,405contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
33R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
34C02H6.1C02H6.1n/achrV 7,389,111contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
35B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
36srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37Y39E4B.7Y39E4B.7n/achrIII 13,113,204contains similarity to Pfam domain PF01529 (DHHC zinc finger domain)
38srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39F08B4.3F08B4.3n/achrIV 8,666,337contains similarity to Interpro domain IPR000719 (Protein kinase, core)
40srh-233Y113G7A.10.00000000000001chrV 20,046,361C. elegans SRH-233 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41M01E5.2M01E5.2n/achrI 13,278,606contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
42R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
43gcy-27C06A12.4n/achrIV 17,436,419C. elegans GCY-27 protein; contains similarity to Pfam domains PF00211 (Adenylate and Guanylate cyclase catalytic domain) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001054 (Adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
44K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
45M153.3M153.3n/achrX 12,143,295contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
46nhr-178F16B4.9n/achrV 1,605,896C. elegans NHR-178 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47sra-29F18C5.8n/achrII 6,575,011C. elegans SRA-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
49E04F6.10E04F6.10n/achrII 7,215,446
50F22F7.2F22F7.2n/achrV 2,125,082contains similarity to Pfam domain PF03435 Saccharopine dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR005097 (Saccharopine dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding)