UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D2089.2D2089.22e-108chrII 10,660,588contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
2C06H2.2C06H2.2n/achrV 11,126,240contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
3fhod-1C46H11.11n/achrI 5,063,543C. elegans FHOD-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02181 Formin Homology 2 Domain contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR015425 (Actin-binding FH2), IPR000694 (Proline-rich region), IPR014768 (GTPase-binding/formin homology 3), IPR003104 (Actin-binding FH2 and DRF autoregulatory), IPR005398 (Tubby, N-terminal), IPR016024 (Armadillo-type fold)
4K09F6.3K09F6.3n/achrII 2,258,704contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
5wht-5F19B6.4n/achrIV 12,338,972C. elegans WHT-5 protein; contains similarity to Pfam domains PF01061 (ABC-2 type transporter) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR013525 (ABC-2 type transporter)
6srh-284C47A10.3n/achrV 17,768,552C. elegans SRH-284 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7C33C12.4C33C12.4n/achrII 2,165,992
8R06B10.1R06B10.1n/achrIII 969,326contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
9R08C7.5R08C7.5n/achrIV 4,431,281contains similarity to Pfam domain PF03941 Inner centromere protein, ARK binding region contains similarity to Interpro domains IPR005819 (Histone H5), IPR005635 (Inner centromere protein, ARK binding region)
10ugt-51C03A7.11n/achrV 5,176,130C. elegans UGT-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
11wrt-3F38E11.7n/achrIV 9,476,571wrt-3 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a Wart domain, and a region of low-complexity sequence; WRT-3 is expressed in the trinucleate pharyngeal gland cell g1 beginning at the three-fold stage of embryogenesis, in seam cells and hypodermis, and in single muscle cells and the distal tip cells of late stage larvae and adults; the Wart domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; WRT-3 is required for normal growth to full size and locomotion; both of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
12Y39A1A.14Y39A1A.14n/achrIII 10,649,949contains similarity to Pfam domain PF03587 Nep1 ribosome biogenesis protein contains similarity to Interpro domain IPR005304 (Suppressor Mra1)
13F12A10.4F12A10.4n/achrII 5,489,365F12A10.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F12A10.4 has no clear orthologs in other organisms.
14W01C9.4W01C9.4n/achrII 8,546,188contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
15ech-1C29F3.1n/achrV 15,359,193ech-1 encodes an enoyl-CoA hydratase; loss of ech-1 activity via RNAi results in reduced body fat, consistent with ECH-1's predicted role in fatty acid metabolism; expression of ech-1 mRNA is positively regulated by the NHR-49 nuclear receptor.
16abcx-1C56E6.1n/achrII 6,536,117C. elegans ABCX-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07539 Down-regulated in metastasis contains similarity to Interpro domains IPR011430 (Down-regulated in metastasis), IPR016024 (Armadillo-type fold)
17T08D10.3T08D10.3n/achrX 11,956,831contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA1681; ENSEMBL:ENSP00000316543
18C15B12.1C15B12.1n/achrX 6,477,878contains similarity to Pfam domain PF01266 FAD dependent oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR006076 (FAD dependent oxidoreductase), IPR000447 (FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
19T08B2.11T08B2.11n/achrI 6,222,182contains similarity to Homo sapiens Transcription initiation factor TFIID subunit 3; ENSEMBL:ENSP00000340271
20ZK484.7ZK484.7n/achrI 6,095,825contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
21C56C10.11C56C10.11n/achrII 6,599,683
22Y37D8A.10Y37D8A.10n/achrIII 12,875,275contains similarity to Pfam domain PF06703 Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit (SPC25) contains similarity to Interpro domain IPR009582 (Microsomal signal peptidase 25 kDa subunit)
23srx-78C01G10.3n/achrV 15,096,226C. elegans SRX-78 protein
24C50F4.2C50F4.2n/achrV 9,533,151C50F4.2 encodes a putative 6-phosphofructokinase, paralogous to Y71H10A.1; C50F4.2 is required for fertility, full body size, and normally rapid growth in mass RNAi assays; C50F4.2 transcripts are enriched during spermatogenesis.
25tag-335C42C1.5n/achrIV 12,277,039C. elegans TAG-335 protein; contains similarity to Pfam domains PF00132 (Bacterial transferase hexapeptide (three repeats)) (4), PF00483 (Nucleotidyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR001451 (Bacterial transferase hexapeptide repeat), IPR005835 (Nucleotidyl transferase), IPR011004 (Trimeric LpxA-like)
26ZK1320.5ZK1320.5n/achrII 9,664,562contains similarity to Interpro domain IPR008107 (Mycoplasma P48 major surface lipoprotein)
27ZC116.3ZC116.3n/achrV 12,620,623ZC116.3 is orthologous to the human gene CUBILIN (CUBN; OMIM:602997), which when mutated leads to hereditary megaloblastic anaemia 1 (OMIM:261100).
28W03A5.5W03A5.5n/achrIII 5,439,347
29srbc-44ZC455.9n/achrV 12,787,889C. elegans SRBC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
30F55F8.7F55F8.7n/achrI 5,660,175contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
31T15B7.6T15B7.6n/achrV 6,826,715
32C09G1.4C09G1.4n/achrX 15,992,503contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
33srh-78DC2.2n/achrV 218,314C. elegans SRH-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F55H12.2F55H12.2n/achrI 8,868,112contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Tyrosine specific protein phosphatase)
35ZK899.5ZK899.5n/achrX 9,460,355contains similarity to Interpro domain IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
36tag-192T04D1.4n/achrI 4,692,225C. elegans TAG-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF07533 (Associated with TFs and helicases) , PF00385 ('chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR000330 (SNF2-related), IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016197 (Chromo domain-like), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR006576 (BRK), IPR009057 (Homeodomain-like), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
37B0280.11B0280.11n/achrIII 7,137,323contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
38F42E8.1F42E8.1n/achrV 13,063,254contains similarity to Campylobacter jejuni DNA polymerase III alpha subunit (EC 2.7.7.7).; SW:DP3A_CAMJE
39col-69K01A2.7n/achrII 304,726C. elegans COL-69 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
40T22C1.8T22C1.8n/achrI 7,957,209contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
41M03B6.2M03B6.2n/achrX 13,855,038contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
42ugt-52F56B3.7n/achrIV 781,452C. elegans UGT-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43Y45F10A.3Y45F10A.3n/achrIV 13,511,278contains similarity to Mus musculus Probable arylformamidase (EC 3.5.1.9) (Kynurenine formamidase) (KF).; SW:Q8K4H1
44fbf-2F21H12.5n/achrII 6,090,134fbf-2 encodes an RNA-binding protein that is one of 11 C. elegans members of the PUF family (Pumilio and FBF) of translational regulators; FBF-2 is nearly identical to FBF-1 with which it is largely redundant in regulating two aspects of germline development: 1)maintenance of stem cell proliferation, and 2)the hermaphroditic switch between spermatogenesis and oogenesis; in maintaining germline stem cells, the FBF proteins, acting through NOS-3, negatively regulate the activity of gld-1 mRNA, which encodes a translational repressor required for meiotic entry; in regulating the sperm-to-oocyte switch, the FBFs act downstream of GLD-3 to negatively regulate the activity of fem-3 mRNA, which encodes a novel protein required for germline sex determination; consistent with their role in germline development, FBF-1 and FBF-2 are expressed in the germline cytoplasm, becoming enriched in the mitotic region during the L4 larval and adult stages.
45T28D9.11T28D9.11n/achrII 6,491,500
46K11C4.2K11C4.2n/achrV 6,895,906contains similarity to Pfam domain PF03006 Haemolysin-III related contains similarity to Interpro domain IPR004254 (Hly-III related proteins)
47F13C5.5F13C5.5n/achrX 606,710
48sra-22F28C12.7n/achrI 12,702,151C. elegans SRA-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
49lam-1W03F8.5n/achrIV 5,176,291lam-1 encodes a laminin beta that affects degenerin-induced cell death and is required redundantly with lam-2 for morphogenesis.
50pmp-2C44B7.9n/achrII 6,885,843C. elegans PMP-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF06472 (ABC transporter transmembrane region 2) , PF00005 (ABC transporter) contains similarity to Interpro domains IPR003439 (ABC transporter-like), IPR011527 (ABC transporter, transmembrane region, type 1), IPR010509 (ABC transporter, N-terminal), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR005283 (Peroxysomal long chain fatty acyl transporter)