UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sri-71D2062.34e-177chrII 2,628,473C. elegans SRI-71 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
2R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
3srh-28ZC404.5n/achrV 6,774,975C. elegans SRH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4R12E2.6R12E2.6n/achrI 4,151,478contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
5F28B1.4F28B1.4n/achrV 17,056,226contains similarity to Archaeoglobus fulgidus Ferredoxin (FDX-2).; TR:O30071
6Y44A6D.6Y44A6D.6n/achrV 20,807,147contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
7F49D11.7F49D11.7n/achrI 10,923,733
8C16D9.4C16D9.4n/achrV 8,241,945contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domains IPR008068 (Cytochrome P450, E-class, group I, CYP2B-like), IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
9dpy-28Y39A1B.3n/achrIII 10,770,127dpy-28 encodes a non-SMC condensin subunit homolog, similar to XCAP-D2 in Xenopus, Cnd1 in S. pombe, and Ycs4p in S. cerevisiae, that is required for negative, chromosome-wide regulation of X-chromosomal genes in XX but not XO animals (dosage compensation), and for some undetermined aspect of body morphogenesis; DPY-28 is part of a multiprotein 'dosage compensation' complex with DPY-26, DPY-27 and MIX-1.
10srt-12E03D2.4n/achrV 4,241,727C. elegans SRT-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11T01C8.2T01C8.2n/achrX 16,786,949
12T05H4.3T05H4.3n/achrV 6,444,929contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal)
13C03B1.3C03B1.3n/achrX 6,366,380
14K01C8.2K01C8.2n/achrII 8,268,517contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
15C49A1.5C49A1.5n/achrI 14,239,274contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
16str-60T06C12.1n/achrV 15,898,679C. elegans STR-60 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17K02F6.7K02F6.7n/achrII 2,527,240
18sre-21C47A10.4n/achrV 17,771,397C47A10.4 is orthologous to the human gene ALBINISM, OCULAR, TYPE I (OA1; OMIM:300500), which when mutated leads to Nettleship-Falls type ocular albinism.
19C06E2.2C06E2.2n/achrX 8,879,967
20unc-108F53F10.4n/achrI 3,825,732unc-108 encodes a small GTPase homologous to the Rab GTPases that function in endocytosis, membrane fusion, and vesicular trafficking events.
21K03H4.1K03H4.1n/achrV 13,151,458contains similarity to Helicobacter pylori Transposase OrfB.; TR:Q93C83
22F40H6.5F40H6.5n/achrIII 6,052,328contains similarity to Pfam domains PF02795 (Domain of unknown function (DUF225)) , PF00337 (Galactoside-binding lectin) (3)contains similarity to Interpro domains IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR004024 (Protein of unknown function DUF225), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
23T09A5.4T09A5.4n/achrII 7,847,007Weak similarity with the E. coli methionyl-tRNA formyltransferase (Swiss Prot. accession number P23882)
24F36F12.1F36F12.1n/achrV 2,101,648contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
25agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
26scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
27C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
28bcc-1M7.3n/achrIV 11,089,293bcc-1 encodes a homolog of Drosophila and vertebrate Bicaudal C (BICC) that contains KH RNA-binding domains, a serine-rich region, and a SAM (sterile alpha motif) domain; by homology, BCC-1 is predicted to function as a cytoplasmic RNA-binding protein that is required for translational regulation and/or mRNA stability during embryonic or germline development; however, as loss of bcc-1 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of BCC-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
29ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
30srt-47Y41E3.12n/achrIV 15,051,352C. elegans SRT-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
31clec-263F26F2.6n/achrV 20,571,518C. elegans CLEC-263 protein; contains similarity to Pfam domains PF08277 (PAN-like domain) (2), PF00024 (PAN domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
32C09B9.7C09B9.7n/achrIV 5,058,402contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
33C23H4.2C23H4.2n/achrX 12,221,143contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
34srx-17F55B12.8n/achrV 13,841,443C. elegans SRX-17 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
35M02B7.5M02B7.5n/achrIV 3,813,489contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF01369 (Sec7 domain) contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000904 (SEC7-like)
36T08G3.7T08G3.7n/achrV 16,464,369contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
37str-57T06C12.2n/achrV 15,871,734C. elegans STR-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38K02D10.5K02D10.5n/achrIII 8,777,270contains similarity to Pfam domain PF05739 SNARE domain contains similarity to Interpro domain IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
39R09A1.3R09A1.3n/achrV 1,025,455
40srh-25C54D10.60.000003chrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41srh-216T20B3.50.0000000005chrV 16,826,380C. elegans SRH-216 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
43ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
44nex-4C37H5.1n/achrV 4,856,278nex-4 encodes a predicted annexin.
45F10C2.3F10C2.3n/achrV 12,022,395contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
46ZK488.5ZK488.5n/achrV 594,476contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
47C51E3.6C51E3.6n/achrV 10,165,329contains similarity to Pfam domain PF00860 Permease family contains similarity to Interpro domain IPR006043 (Xanthine/uracil/vitamin C permease)
48C15A7.2C15A7.2n/achrX 12,072,281contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 145.; SW:Q5U239
49sra-3AH6.7n/achrII 9,539,969C. elegans SRA-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
50set-30ZC8.3n/achrX 5,001,358set-30 encodes a divergent ortholog of human SMYD1 (OMIM:606846), SMYD2 (OMIM:610663), and SYMD3 (OMIM:608783); SET-30 is paralogous to SET-10, SET-14, and SET-18; neither set-30(gk314) nor set-30(RNAi) have any obvious phenotypes.