UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D2023.6D2023.60chrV 11,828,318D2023.6 is orthologous to a set of uncharacterized putative protein kinases from eukaryotes and from prokaryotes (e.g., UbiB from E. coli), and paralogous to COQ-8 from C. elegans and ABC1 (COQ8) from S. cerevisiae; like COQ-8, D2023.6 may be involved in ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3F48C1.4F48C1.4n/achrI 5,313,536
4T26C5.4T26C5.4n/achrII 9,249,704contains similarity to Encephalitozoon cuniculi SER/THR protein phosphatase 2-A (EC 3.1.3.16) (Serine/threoninesprotein phosphatase).; TR:Q8SS50
5nas-8C34D4.9n/achrIV 7,117,415nas-8 encodes an astacin-like metalloprotease.
6srsx-8F52F10.5n/achrV 1,552,074C. elegans SRSX-8 protein ;
7C05A9.3C05A9.3n/achrX 10,830,625contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
8Y52B11A.10Y52B11A.10n/achrI 11,045,757contains similarity to Pfam domains PF02854 (MIF4G domain) , PF02847 (MA3 domain) contains similarity to Interpro domains IPR003890 (MIF4G-like, type 3), IPR016021 (MIF4-like, type 1/2/3), IPR003891 (Initiation factor eIF-4 gamma, MA3), IPR016024 (Armadillo-type fold)
9lips-1F45E6.4n/achrX 12,494,285C. elegans LIPS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
10str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11Y57G11A.3Y57G11A.3n/achrIV 14,502,754contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
12Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
13glb-10C29F5.7n/achrII 6,308,800glb-10 encodes a globin; glb-10 is expressed in pharynx, intestine, vulval muscle, and many neurons, with at least some subcellular localization to synapses; however, glb-10 has no obvious function in mass RNAi assays.
14F53H2.3F53H2.3n/achrV 20,399,182contains similarity to Interpro domain IPR006034 (Asparaginase/glutaminase)
15M02F4.1M02F4.1n/achrX 3,028,999contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Splicing factor, arginine/serine-rich 12; ENSEMBL:ENSP00000284041
16str-166T08B6.6n/achrIV 4,885,569C. elegans STR-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
18mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
19srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20sra-29F18C5.8n/achrII 6,575,011C. elegans SRA-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
21M153.3M153.3n/achrX 12,143,295contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
22R03H4.1R03H4.1n/achrV 9,018,100contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
23scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
24F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
25srw-73T03E6.6n/achrV 16,587,756C. elegans SRW-73 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
26sri-57F22E5.16n/achrII 2,671,336C. elegans SRI-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27Y26D4A.3Y26D4A.3n/achrI 13,072,492contains similarity to Pfam domain PF00059 (Lectin C-type domain short and long forms)
28T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
29Y49F6C.2Y49F6C.2n/achrII 3,379,231
30sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
31F42A6.1F42A6.1n/achrIV 3,356,300
32T06E6.10T06E6.10n/achrV 15,418,719contains similarity to Pfam domain PF01826 Trypsin Inhibitor like cysteine rich domain contains similarity to Interpro domains IPR002919 (Protease inhibitor I8, cysteine-rich trypsin inhibitor-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
33C44E4.5C44E4.5n/achrI 4,607,929contains similarity to Pfam domain PF04969 CS domain contains similarity to Interpro domains IPR008978 (HSP20-like chaperone), IPR017447 (CS), IPR007052 (CS domain)
34F02E9.1F02E9.1n/achrI 8,407,250F02E9.1 encodes a divergent ortholog of S. cerevisiae VMA22; like VMA22, F02E9.1 may be required for vacuolar proton-translocating ATPase (V-ATPase) assembly in the endoplasmic reticulum.
35tag-179T24D1.4n/achrI 9,961,143C. elegans TAG-179 protein; contains similarity to Pfam domain PF04922 DIE2/ALG10 family contains similarity to Interpro domains IPR016900 (Alpha-1, 2 glucosyltransferase Alg10), IPR007006 (DIE2/ALG10)
36trxr-1C06G3.7n/achrIV 7,014,256C06G3.7 encodes an homolog of the mammalian thioredoxin reductase isozymes TR1 and TR2; like its mammalian homologs, C06G3.7 has a TGA-encoded C-terminal penultimate selenocysteine (Sec) residue; labelling of C. elegans with selenium-75 demonstrates that TR-Se is the major naturally occurring selenoprotein in C. elegans, and computational analysis indicates that it is probably the only selenoprotein encoded by the genome; the 3'-untranslated region of this gene contains a selenocysteine insertion sequence that is functional in mammalian cell culture; by phylogenetic profiling, C06G3.7 protein is predicted to be mitochondrial.
37Y45G12C.6Y45G12C.6n/achrV 2,541,544contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
40F15D4.6F15D4.6n/achrII 13,249,439contains similarity to Bacillus halodurans Acetolactate synthase large subunit.; TR:Q9K8E5
41F59A2.2F59A2.2n/achrIII 3,408,380contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EN31
42str-190C18B10.7n/achrV 7,477,853C. elegans STR-190 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
43R12B2.3R12B2.3n/achrIII 5,806,220
44K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
45T25G3.4T25G3.4n/achrI 7,566,145T25G3.4 encodes a putative mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase, paralogous to Y50E8A.6 and orthologous to human GPD2 (OMIM:138430, mutated in type II diabetes mellitus); T25G3.4 transcripts are not obviously enriched during oogenesis, but T25G3.4 is predicted to be coexpressed in an operon with chs-1 and T25G3.3; such coexpression, if real, may simply reflect all three genes being required for oogenesis, rather than some more detailed functional connection; T25G3.4 has no obvious function in mass RNAi assays.
46R105.1R105.1n/achrIV 4,635,811contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
47C17A2.5C17A2.5n/achrII 3,834,625contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
48srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
50F09G8.5F09G8.5n/achrIII 8,256,200contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR010916 (TonB box, conserved site)