UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D2007.3D2007.31e-25chrIII 8,148,979
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C18H9.2C18H9.2n/achrII 6,690,893contains similarity to Xenopus laevis PERQ amino acid-rich with GYF domain-containing protein 2s(Trinucleotide repeat-containing gene 15 protein).; SW:Q5U236
4srxa-14Y44A6B.1n/achrV 20,635,709C. elegans SRXA-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
5C03B1.2C03B1.2n/achrX 6,370,343
6F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
7K10F12.6K10F12.6n/achrIII 399,060
8C18E3.4C18E3.4n/achrI 4,202,730
9tag-4ZK337.4n/achrI 14,984,784tag-4 encodes a novel protein with low similarity to human putative splicing factor YT521
10srd-51F15A2.3n/achrX 13,483,631C. elegans SRD-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
12F11A5.7F11A5.7n/achrV 16,205,976contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
13scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
14C24G7.4C24G7.4n/achrI 4,096,469contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
15str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16srxa-7C31A11.6n/achrV 16,308,625C. elegans SRXA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03383 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein, class xa contains similarity to Interpro domain IPR005047 (Protein of unknown function DUF286, G protein-coupled receptor-like putative Caenorhabditis species)
17vps-33.1B0303.9n/achrIII 8,702,024C. elegans VPS-33.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00995 Sec1 family contains similarity to Interpro domain IPR001619 (Sec1-like protein)
18glt-4T22E5.2n/achrX 6,405,125glt-4 encodes an ortholog of glutamate/aspartate and neutral amino acid transporters.
19srbc-23C45H4.9n/achrV 2,154,343C. elegans SRBC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20F26F2.2F26F2.2n/achrV 20,559,052contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Global transcription activator that acts in complex with Snf2p, Snf5p, Snf6p, and Swi3p to assist gene-specific activators; involved in the regulation of expression of many genes, including ADH1, ADH2, GAL1, HO, INO1 and SUC2; SGD:YPL016W
21sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22ZC239.4ZC239.4n/achrII 3,214,931contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
23ZK1037.1ZK1037.1n/achrV 15,311,784contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24T06C12.14T06C12.14n/achrV 15,900,422contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
25srd-55K02A2.2n/achrII 7,409,558C. elegans SRD-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26F53F1.6F53F1.6n/achrV 13,416,842contains similarity to Aeropyrum pernix Elongation factor 1-beta (EF-1-beta) (aEF-1beta).; SW:EF1B_AERPE
27clec-213C50E3.3n/achrV 7,606,857C. elegans CLEC-213 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
28W06G6.7W06G6.7n/achrV 16,640,273contains similarity to Pfam domains PF00622 (SPRY domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) , PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF00643 (B-box zinc finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR001870 (B302, (SPRY)-like), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003649 (B-box, C-terminal), IPR003877 (SPla/RYanodine receptor SPRY), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
29Y37A1B.8Y37A1B.8n/achrIV 14,022,381contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
30D1053.2D1053.2n/achrX 11,728,445contains similarity to Pfam domain PF08123 Histone methylation protein DOT1 contains similarity to Interpro domain IPR013110 (Histone methylation DOT1)
31C50B6.1C50B6.1n/achrV 13,308,835contains similarity to Synechocystis sp Hypothetical protein slr1813.; TR:P73698
32sodh-2K12G11.4n/achrV 11,890,433C. elegans SODH-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
33srg-22Y25C1A.10n/achrII 3,092,472C. elegans SRG-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
34hil-1C30G7.1n/achrV 14,951,239C. elegans HIL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00538 linker histone H1 and H5 family contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR005819 (Histone H5), IPR005818 (Histone H1/H5), IPR003216 (Linker histone, N-terminal)
35C04B4.6C04B4.6n/achrX 12,275,348contains similarity to Corynebacterium efficiens Putative alanyl-tRNA synthetase.; TR:Q8FT23
36C40H5.7C40H5.7n/achrX 11,746,531contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
37clec-214C50E3.1n/achrV 7,611,567C. elegans CLEC-214 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like)
38F27C1.13F27C1.13n/achrI 5,445,369contains similarity to Pfam domain PF03607 Doublecortin contains similarity to Interpro domain IPR003533 (Doublecortin)
39W06B3.1W06B3.1n/achrX 12,015,209contains similarity to Pfam domain PF01467 Cytidylyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR004821 (Cytidyltransferase-related), IPR005248 (Probable nicotinate-nucleotide adenylyltransferase), IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004820 (Cytidylyltransferase)
40M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
41C08B11.3C08B11.3n/achrII 8,025,126contains similarity to Pfam domain PF01388 ARID/BRIGHT DNA binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR001606 (AT-rich interaction region)
42srv-6C52B9.5n/achrX 4,258,053C. elegans SRV-6 protein ;
43C18A11.6C18A11.6n/achrX 8,034,037
44uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
45Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
46Y56A3A.18Y56A3A.18n/achrIII 11,918,159Y56A3A.18 encodes an ortholog of S. cerevisiae BUD20 that may suppress tumorous growth in the germline; like PRO-1, -2, and -3, Y56A3A.18 is thought to be required for ribosome biogenesis, suggesting a link between biogenesis in the distal sheath and control of cell division in the germline.
47srh-203F20E11.10n/achrV 17,455,364C. elegans SRH-203 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48srh-291Y94A7B.3n/achrV 17,807,015C. elegans SRH-291 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)