UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D1053.4D1053.44e-67chrX 11,722,796contains similarity to Naja kaouthia Cytotoxin 5 (Cytotoxin II).; SW:CX5_NAJKA
2C05A9.3C05A9.3n/achrX 10,830,625contains similarity to Pfam domain PF00023 Ankyrin repeat contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
3C46F2.1C46F2.1n/achrX 8,078,758
4M01E5.2M01E5.2n/achrI 13,278,606contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
5F29A7.5F29A7.5n/achrII 2,747,560
6K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
7C17A2.5C17A2.5n/achrII 3,834,625contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
8clec-121Y25C1A.4n/achrII 3,103,522C. elegans CLEC-121 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
9F09G8.5F09G8.5n/achrIII 8,256,200contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR010916 (TonB box, conserved site)
10str-185R08C7.7n/achrIV 4,428,740C. elegans STR-185 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
12srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13str-78Y40H7A.1n/achrIV 15,145,449C. elegans STR-78 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14srv-9F53F1.8n/achrV 13,422,059C. elegans SRV-9 protein ;
15scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
16sre-29F57G9.4n/achrII 12,400,560C. elegans SRE-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
17math-9C16C4.14n/achrII 1,890,347C. elegans MATH-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
18srt-65C03A7.10n/achrV 5,171,907C. elegans SRT-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
20K09A9.4K09A9.4n/achrX 15,593,283contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
21sptf-3Y40B1A.4n/achrI 13,362,400C. elegans SPTF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
22srh-245F31F4.9n/achrV 655,327C. elegans SRH-245 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23F59B2.13F59B2.13n/achrIII 9,025,413contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
24C44E4.5C44E4.5n/achrI 4,607,929contains similarity to Pfam domain PF04969 CS domain contains similarity to Interpro domains IPR008978 (HSP20-like chaperone), IPR017447 (CS), IPR007052 (CS domain)
25R05D7.1R05D7.1n/achrI 12,162,955contains similarity to Kluyveromyces lodderae Truncated cytochrome oxidase subunit 2 (Fragment).; TR:Q7YG01
26grsp-3C34D4.11n/achrIV 7,131,263C. elegans GRSP-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR005405 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3.4), IPR002952 (Eggshell protein), IPR003991 (Pertactin virulence factor, C-terminal), IPR000817 (Prion protein), IPR001951 (Histone H4)
27Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
28C30E1.4C30E1.4n/achrX 16,924,785contains similarity to Homo sapiens SID1 transmembrane family member 1 precursor; ENSEMBL:ENSP00000264852
29F47G4.8F47G4.8n/achrI 14,053,124
30F56H6.2F56H6.2n/achrI 12,288,243contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
31F58F6.3F58F6.3n/achrIV 1,375,965
32Y52B11A.10Y52B11A.10n/achrI 11,045,757contains similarity to Pfam domains PF02854 (MIF4G domain) , PF02847 (MA3 domain) contains similarity to Interpro domains IPR003890 (MIF4G-like, type 3), IPR016021 (MIF4-like, type 1/2/3), IPR003891 (Initiation factor eIF-4 gamma, MA3), IPR016024 (Armadillo-type fold)
33C28G1.4C28G1.4n/achrX 8,851,319contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
34srj-26ZK262.10n/achrV 18,422,252C. elegans SRJ-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
35srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
36F26F2.3F26F2.3n/achrV 20,561,363contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
37mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
38lips-1F45E6.4n/achrX 12,494,285C. elegans LIPS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
39F38A1.13F38A1.13n/achrIV 1,265,538
40sru-11Y45F10B.6n/achrIV 13,586,085C. elegans SRU-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
41gpa-11C16A11.1n/achrII 4,254,160gpa-11 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL and ASH amphid neurons.
42D1053.3D1053.3n/achrX 11,731,700contains similarity to Interpro domain IPR001208 (MCM)
43ZK546.5ZK546.5n/achrII 4,936,745contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
44R105.1R105.1n/achrIV 4,635,811contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
45F12A10.1F12A10.1n/achrII 5,497,839contains similarity to Oryza sativa subsp indica Putative uncharacterized protein.; TR:A2YC95
46W08F4.10W08F4.10n/achrII 590,892contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
47T05G5.5T05G5.5n/achrIII 9,750,414contains similarity to Pfam domain PF01121 Dephospho-CoA kinase contains similarity to Interpro domains IPR000764 (Uridine kinase), IPR001977 (Dephospho-CoA kinase)
48fbxa-168C31C9.4n/achrII 13,647,223This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
49C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
50C29F9.8C29F9.8n/achrIII 96,559