UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D1007.8D1007.85e-119chrI 4,604,894contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold)
2R07E5.15R07E5.15n/achrIII 4,401,952
3K09A9.4K09A9.4n/achrX 15,593,283contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
4srd-50F15A2.4n/achrX 13,480,135C. elegans SRD-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5F20B4.2F20B4.2n/achrX 17,704,274
6T01D3.2T01D3.2n/achrV 13,706,650contains similarity to Pfam domain PF00989 PAS fold contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR013767 (PAS fold), IPR000014 (PAS), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding), IPR001067 (Nuclear translocator)
7W04G5.5W04G5.5n/achrI 11,635,717contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
8fbxa-100F14H3.7n/achrV 16,060,910This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
9ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
10ZK669.2ZK669.2n/achrII 7,937,580contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
11F12A10.1F12A10.1n/achrII 5,497,839contains similarity to Oryza sativa subsp indica Putative uncharacterized protein.; TR:A2YC95
12srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13W08F4.10W08F4.10n/achrII 590,892contains similarity to Interpro domain IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site)
14clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15Y45G12C.6Y45G12C.6n/achrV 2,541,544contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16ces-1F43G9.11n/achrI 8,634,989ces-1 encodes a C2H2-type zinc finger transcription factor that is a member of the Snail family of proteins that includes Drosophila Scratch, Snail, and Slug, and human SNAIL and SLUG; although the normal function of CES-1 is not fully understood, gain-of-function mutations indicate that CES-1 can function as a transcriptional repressor that blocks programmed cell death in specific neurons by inhibiting expression of the cell-death activator EGL-1; in regulating EGL-1 expression, CES-1 appears to antagonize the transcriptional activity of the bHLH proteins, HLH-2 and HLH-3; despite its cell-type specific role in apoptosis, CES-1 expression is reportedly detected in many embryonic nuclei from the 100-cell stage of embryogenesis through the beginning of morphogenesis, with some CES-1 expression remaining at later embryonic stages; genetic studies indicate that CES-1 is negatively regulated by the bZIP transcription factor CES-2, which can bind CES-1 upstream sequences in vitro and thus may directly regulate CES-1 transcription in vivo
17sre-29F57G9.4n/achrII 12,400,560C. elegans SRE-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
18F31F4.1F31F4.1n/achrV 685,113contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
19rib-2K01G5.6n/achrIII 10,744,609The rib-2 gene encodes an ortholog of human EXT2, which when mutated leads to hereditary multiple exostoses, type II (OMIM:133701).
20srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
21C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
22ccb-2W10C8.1n/achrI 2,848,257C. elegans CCB-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00774 (Dihydropyridine sensitive L-type calcium channel (Beta subunit)) (2), PF00018 (SH3 domain) contains similarity to Interpro domains IPR000584 (Voltage-dependent calcium channel, L-type, beta subunit), IPR001452 (Src homology-3)
23sru-16Y45F10B.4n/achrIV 13,581,181C. elegans SRU-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
24B0035.16B0035.16n/achrIV 11,295,988contains similarity to Pfam domain PF03054 tRNA methyl transferase contains similarity to Interpro domains IPR014729 (Rossmann-like alpha/beta/alpha sandwich fold), IPR004506 (tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase)
25srh-72ZC204.5n/achrII 1,639,907C. elegans SRH-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26srd-17Y2H9A.2n/achrV 13,431,663C. elegans SRD-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27C52D10.3C52D10.3n/achrIV 17,179,526contains similarity to Pelobacter propionicus DSM 2379 Hypothetical protein precursor.; TR:Q3FZT0
28R148.2R148.2n/achrIII 3,184,321
29ZK546.5ZK546.5n/achrII 4,936,745contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
30C29F9.8C29F9.8n/achrIII 96,559
31B0207.6B0207.6n/achrI 5,936,242contains similarity to Pfam domain PF03029 Conserved hypothetical ATP binding protein contains similarity to Interpro domain IPR004130 (Protein of unknown function, ATP binding)
32tsp-7T23D8.2n/achrI 9,971,579C. elegans TSP-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
33K06H6.4K06H6.4n/achrV 580,280contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
34ddl-2Y48E1B.1n/achrII 13,545,140C. elegans DDL-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
35R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
36unc-40T19B4.7n/achrI 5,685,676The unc-40 gene encodes a netrin receptor that is required to guide dorsal-ventral cell and axon migrations, and is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
37atg-16.1F02E8.5n/achrX 4,461,104atg-16.1 encodes a divergent ortholog of the autophagic budding yeast protein Atg16p, and of human ATG16L1 (OMIM:610767, associated with Crohn disease) and ATG16L2; ATG-16.1 is paralogous to ATG-16.2; ATG-16.1 is expressed in larval and adult intestine, renal gland cells, stomato-intestinal muscle, anal depressor muscle, and head mesodermal cell; ATG-16.1 has no obvious function in mass RNAi assays.
38F34D6.2F34D6.2n/achrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
39taf-9T12D8.7n/achrIII 13,624,992C. elegans TAF-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02291 Transcription initiation factor IID, 31kD subunit contains similarity to Interpro domains IPR003162 (Transcription factor TAFII-31), IPR009072 (Histone-fold)
40F38A1.13F38A1.13n/achrIV 1,265,538
41B0334.6B0334.6n/achrII 11,512,193contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42K04G11.1K04G11.1n/achrX 14,335,998contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
43tmbi-4B0563.4n/achrX 9,155,606C. elegans TMBI-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01027 Uncharacterised protein family UPF0005 contains similarity to Interpro domain IPR006214 (Protein of unknown function UPF0005)
44M01E5.2M01E5.2n/achrI 13,278,606contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
45srw-94H06H21.1n/achrIV 4,815,890C. elegans SRW-94 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
46C04G6.4C04G6.4n/achrII 5,082,452contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
47F39H12.2F39H12.2n/achrX 832,122contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
48C28G1.4C28G1.4n/achrX 8,851,319contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
49F25H2.3F25H2.3n/achrI 10,548,642contains similarity to Interpro domain IPR002110 (Ankyrin)
50D1053.4D1053.4n/achrX 11,722,796contains similarity to Naja kaouthia Cytotoxin 5 (Cytotoxin II).; SW:CX5_NAJKA