UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1D1007.4D1007.43e-82chrI 4,580,304contains similarity to Homo sapiens Gem-associated protein 6; ENSEMBL:ENSP00000281950
2sdz-36ZK1251.7n/achrIV 9,691,129C. elegans SDZ-36 protein
3ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
4T24E12.2T24E12.2n/achrII 3,783,547
5F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
6C29G2.1C29G2.1n/achrV 2,591,466
7F38H4.10F38H4.10n/achrIV 11,861,497contains similarity to Pfam domain PF03637 Mob1/phocein family contains similarity to Interpro domain IPR005301 (Mob1/phocein)
8Y57G11C.25Y57G11C.25n/achrIV 14,919,983Y57G11C.25 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of Y57G11C.25 is predicted to function as an RNA-binding protein.
9sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10R10E4.6R10E4.6n/achrIII 4,294,138
11bath-19F59H6.1n/achrII 2,037,587C. elegans BATH-19 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (3), PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
12D1054.3D1054.3n/achrV 10,772,116contains similarity to Pfam domains PF04969 (CS domain) , PF05002 (SGS domain) contains similarity to Interpro domains IPR007699 (SGS), IPR008978 (HSP20-like chaperone), IPR017447 (CS), IPR007052 (CS domain)
13C49F5.3C49F5.3n/achrX 11,983,268contains similarity to Phytophthora infestans SECY-independent transporter protein.; TR:Q9T238
14mdt-10T09A5.6n/achrII 7,854,378C. elegans MDT-10 protein ; contains similarity to Homo sapiens Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10; ENSEMBL:ENSP00000255764
15srh-215T20B3.3n/achrV 16,831,260C. elegans SRH-215 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001356 (Homeobox)
16ZC53.1ZC53.1n/achrX 1,912,323
17B0281.4B0281.4n/achrII 2,298,366contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
18F42A6.5F42A6.5n/achrIV 3,331,304contains similarity to Interpro domain IPR001357 (BRCT)
19C33H5.6C33H5.6n/achrIV 7,776,604contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
20C43F9.7C43F9.7n/achrIV 10,593,293contains similarity to Xanthomonas campestris Hypothetical protein XCC1495.; TR:Q8PAI8
21cyn-12C34D4.12n/achrIV 7,132,656cyn-12 encodes a member of the cyclophilin family that is related to human PPIL1 (CGI-124); based upon its sequence similarity, CYN-12 is predicted to be a cytoplasmic protein potentially involved in a wide range of signal transduction pathways.
22M01G12.5M01G12.5n/achrI 12,130,715contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
23srw-22T10H4.3n/achrV 15,269,194C. elegans SRW-22 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
24ekl-5Y26E6A.1n/achrX 13,915,941C. elegans EKL-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001579 (Glycoside hydrolase, chitinase active site), IPR006642 (Zinc finger, Rad18-type putative)
25F36D1.5F36D1.5n/achrI 11,266,244contains similarity to Homo sapiens Melastatin 1; TR:O75560
26C05E7.2C05E7.2n/achrX 12,939,625
27F53F8.5F53F8.5n/achrV 20,697,686contains similarity to Pfam domain PF00536 SAM domain (Sterile alpha motif) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR013761 (Sterile alpha motif-type), IPR001660 (Sterile alpha motif SAM)
28fbxa-181F35E12.3n/achrV 13,726,386This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
29F54D10.9F54D10.9n/achrII 3,830,742contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
30srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31F55A3.5F55A3.5n/achrI 10,782,421contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
32twk-44Y71H9A.1n/achrX 11,625,639C. elegans TWK-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B), IPR013099 (Ion transport 2)
33JC8.4JC8.4n/achrIV 13,243,908contains similarity to Pfam domain PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region contains similarity to Interpro domains IPR016192 (APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding), IPR002125 (CMP/dCMP deaminase, zinc-binding), IPR016193 (Cytidine deaminase-like)
34Y5F2A.4Y5F2A.4n/achrIV 11,077,311contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
35F23H12.7F23H12.7n/achrV 12,372,277contains similarity to Interpro domain IPR001463 (Sodium:alanine symporter)
36sra-25T26E3.9n/achrI 12,687,150C. elegans SRA-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
37F31B9.3F31B9.3n/achrX 15,924,034contains similarity to Homo sapiens Similar to polymerase (RNA) III; ENSEMBL:ENSP00000334758
38srx-1F59E11.1n/achrV 9,004,313C. elegans SRX-1 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
39T22C1.5T22C1.5n/achrI 7,941,375contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Iswi One Complex; SGD:YMR044W
40srh-141T08G3.5n/achrV 16,444,803C. elegans SRH-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41M02B7.4M02B7.4n/achrIV 3,802,482contains similarity to Pfam domain PF08660 Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like contains similarity to Interpro domain IPR013969 (Oligosaccharide biosynthesis protein Alg14 like)
42srt-73T06C10.2n/achrIV 7,880,158C. elegans SRT-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43C36C9.1C36C9.1n/achrX 1,684,665contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Homo sapiens (Human). Dentin sialophosphoprotein [Contains:sDentin phosphoprotein (Dentin phosphophoryn) (DPP); Dentinssialoprotein (DSP)].; TR:Q869X8
44C34E10.8C34E10.8n/achrIII 5,251,598contains similarity to Leishmania major strain Friedlin Proteophosphoglycan 5.; TR:Q4FX62
45srw-142H05B21.3n/achrV 2,957,658C. elegans SRW-142 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
46R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
47R07E4.5R07E4.5n/achrX 5,951,318contains similarity to Plasmodium lophurae Histidine-rich glycoprotein precursor.; SW:P04929
48hex-3Y39A1C.4n/achrIII 10,851,789hex-3 encodes a beta-N-acetylhexosaminidase.
49M110.3M110.3n/achrII 8,215,496contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
50F02D10.6F02D10.6n/achrX 13,450,586contains similarity to Cryptophlebia leucotreta granulosis virus Hypothetical protein.; TR:Q7T5R9