UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1srb-19C54F6.110chrV 7,518,912C. elegans SRB-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
2F16C3.2F16C3.2n/achrI 10,152,680contains similarity to Clostridium acetobutylicum DNA repair protein recN, ATPase.; TR:Q97HD9
3F10D7.4F10D7.4n/achrX 17,380,140
4btb-1F40G9.4n/achrIII 186,286C. elegans BTB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
5F58B4.2F58B4.2n/achrV 10,918,030contains similarity to Pfam domain PF00173 Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001199 (Cytochrome b5)
6unc-79E03A3.6n/achrIII 4,074,729unc-79 encodes a novel, conserved protein; unc-79 functions in a pathway with nca-1 and nca-2, which encode ion channel subunits, to regulate locomotion and the response to specific volatile anesthetics; unc-79 exerts its effects on these processes, at least in part, by regulating the levels of NCA-1 and NCA-2 proteins; an unc-79::gfp reporter is expressed in the nervous system in ventral nerve cord neurons in L2 and L3 larvae and in one or two head neurons in adults.
7F16G10.11F16G10.11n/achrII 2,392,784contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
8sru-22F36G9.5n/achrV 15,973,922C. elegans SRU-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
9C44B11.1C44B11.1n/achrIII 3,156,820contains similarity to Pfam domain PF06905 Fas apoptotic inhibitory molecule (FAIM1) contains similarity to Interpro domain IPR010695 (Fas apoptotic inhibitory molecule)
10amt-2F49E11.3n/achrIV 13,044,619amt-2 encodes a transmembrane protein that is one of four C. elegans members of the ammonium transporter AMT/Rh family of proteins predicted to function in transport of ammonium ions across the plasma membrane.
11H40L08.3H40L08.3n/achrX 15,073,031contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
12col-132C39E9.9n/achrIV 13,090,324C. elegans COL-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
13T03G11.5T03G11.5n/achrX 5,168,923
14K09E4.2K09E4.2n/achrII 14,130,163contains similarity to Pfam domain PF05208 ALG3 protein contains similarity to Interpro domains IPR007873 (ALG3), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site)
15F48B9.1F48B9.1n/achrX 2,183,370contains similarity to Interpro domain IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
16Y38F1A.2Y38F1A.2n/achrII 12,956,401contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
17gst-18F37B1.7n/achrII 13,630,251C. elegans GST-18 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
18dmd-4C27C12.6n/achrX 14,859,502C. elegans DMD-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF00751 (DM DNA binding domain) , PF03474 (DMRTA motif) contains similarity to Interpro domains IPR005173 (DMRTA motif), IPR001275 (DM DNA-binding)
19T11F1.2T11F1.2n/achrII 2,957,123contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
20srbc-56F54B8.12n/achrV 15,831,110C. elegans SRBC-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
21AH10.3AH10.3n/achrV 14,144,698contains similarity to Tomato yellow leaf curl virus Hypothetical 10.9 kDa protein (C4 protein).; SW:YC4_TYLCU
22C08G5.5C08G5.5n/achrII 756,602contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003882 (Pistil-specific extensin-like protein)
23str-217Y102A5C.28n/achrV 16,999,587C. elegans STR-217 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24F37C4.1F37C4.1n/achrIV 3,890,907contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
25F46F5.11F46F5.11n/achrII 810,328contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
26T02G6.2T02G6.2n/achrI 11,801,906contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9C9Y9
27glb-11C36E8.2n/achrIII 3,990,752glb-11 encodes a globin; glb-11 transcription is higher in L3 and dauers than in young adults; glb-11 has no obvious function in mass RNAi assays; glb-11 expression is induced by anoxia in a HIF-1 dependent manner, although it is also paradoxically upregulated in a hif-1 mutant background.
28T24C12.1T24C12.1n/achrX 2,200,143contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
29E02C12.12E02C12.12n/achrV 9,380,457contains similarity to Pfam domain PF07914 Protein of unknown function (DUF1679) contains similarity to Interpro domain IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species)
30srg-13T23F11.5n/achrIII 4,673,171C. elegans SRG-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
31F28B4.1F28B4.1n/achrX 3,205,615
32skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
33tbx-41T26C11.1n/achrX 1,865,937C. elegans TBX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
34del-1E02H4.1n/achrX 14,274,420del-1 encodes an ion channel protein of the DEG/ENaC (degenerin/epithelial Na+ channel) family; like other members of the degenerin family, DEL-1 is predicted to function as a sensory mechanotransduction channel, however detailed analysis of the DEL-1 mutant phenotype has not yet been reported; DEL-1 is expressed postembryonically in the VA and VB motor neurons and in the FLP sensory neurons; the DEL-1 expression pattern overlaps that of UNC-8, an additional C. elegans degenerin involved in movement control, with which DEL-1 may coassemble to form mechanically activated cation channels.
35ZK180.1ZK180.1n/achrIV 4,497,817contains similarity to Pfam domain PF00003 7 transmembrane receptor (metabotropic glutamate family) contains similarity to Interpro domains IPR000337 (GPCR, family 3), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
36fbxa-224ZK1290.9n/achrII 7,547,404fbxa-224 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37stdh-1C06B3.4n/achrV 13,907,215stdh-1 encodes a putative steroid dehydrogenase required for normally short lifespan; STDH-1 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767 and STDH-2/-4; STDH-1 is expressed in larval intestine, and in both larval and adult body wall muscle and neurons.
38tag-19C09G9.4n/achrIV 8,875,605tag-19 superficially resembles aromatic-L-amino-acid/L-histidine decarboxylases; however, it is distantly related, being no closer to them than to glutamine decarboxylase/sphingosinge lyase (e.g., tag-38, spl-1); tag-19 thus might be termed a Pyridoxal-phosphate (PLP) dependent decarboxylase-like protei, but is missing the absolutely conserved Lys residue of all PLP-DCs (hence the -like would be needed); tag-19 is dispensable in mass RNAi assays.
39hum-7F56A6.2n/achrI 596,704hum-7 encodes a class IX unconventional myosin heavy chain that contains a myosin motor domain in the head region and zinc-finger and rhoGAP (rho GTPase activating protein) domains in the tail region; HUM-7 is required during embryogenesis for cytokinesis and normal cytoplasmic rearrangements, and by homology, may function in organization of the actin cytoskeleton; the precise expression and localization patterns of HUM-7 are not yet known.
40F07G6.5F07G6.5n/achrX 1,706,500
41ZK1290.10ZK1290.10n/achrII 7,552,859contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
42F44E7.7F44E7.7n/achrV 5,784,253contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43C06A5.10C06A5.10n/achrI 5,982,746
44ceh-12F33D11.4n/achrI 5,841,090ceh-12 encodes a homeobox protein orthologous to human HLXB9 (OMIM:142994, mutated in Currarino syndrome) that is required for normal synaptic inputs to motor neurons VA2-VA10 (sisters to VB3-VB11); ceh-12 is expressed in VB motor neurons, but repressed in their VA siblings by UNC-4 and UNC-37; unc-4 or unc-37 mutants show ectopic CEH-12 expression in VA neurons, which is both necessary and sufficient to induce VA neurons to form gap junctions with normally VB-specific interneurons; ceh-12 mutations have no grossly obvious phenotype, and have no effect on del-1 or acr-5 repression in VB neurons, but do suppress the backward movement defect of unc-4 mutants, and do derepress vab-7 (normally restricted to DB and VC motor neurons); CEH-12, like other HLXB9 orthologs, has an N-terminal eh1 domain that may interact with UNC-37/Groucho, and that may indicate CEH-12 to be a transcriptional repressor.
45F49B2.6F49B2.6n/achrI 14,335,445contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
46W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
47spp-16F32D8.9n/achrV 10,900,900C. elegans SPP-16 protein; contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
48zig-1K10C3.3n/achrI 9,848,900zig-1 encodes a predicted transmembrane protein that is a member of the immunoglobulin superfamily of proteins; a zig-1::gfp reporter fusion is expressed in most neurons, including the PVT interneuron, as well as in body wall muscle; zig-1::gfp expression begins during the L1 larval stage of development.
49F49C12.1F49C12.1n/achrIV 9,295,603contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
50srd-8B0547.4n/achrIV 5,644,418C. elegans SRD-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)