UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1C54C8.3C54C8.30chrI 12,447,783contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
2skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
3F56C3.3F56C3.3n/achrX 1,358,147
4nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5srt-47Y41E3.12n/achrIV 15,051,352C. elegans SRT-47 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein)
6srh-212T22F3.6n/achrV 3,596,155C. elegans SRH-212 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR001463 (Sodium:alanine symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7Y37H2B.1Y37H2B.1n/achrV 18,227,570contains similarity to Xylella fastidiosa Beta-hexosaminidase precursor.; TR:Q9PF31
8srh-24R10D12.11n/achrV 13,959,859C. elegans SRH-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9T08G3.6T08G3.6n/achrV 16,446,543contains similarity to Interpro domain IPR008975 ()
10F36F12.1F36F12.1n/achrV 2,101,648contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
11sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12C47E8.6C47E8.6n/achrV 14,690,485contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
13fbxa-7T20H9.1n/achrIII 2,250,698C. elegans FBXA-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
14W09D10.4W09D10.4n/achrIII 10,713,760contains similarity to Pfam domain PF07228 Stage II sporulation protein E (SpoIIE) contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR010822 (Sporulation stage II, protein E C-terminal)
15scl-26C50E3.10n/achrV 7,601,057C. elegans SCL-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
16scl-8C39E9.6n/achrIV 13,072,085C. elegans SCL-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
17R08E5.4R08E5.4n/achrV 3,769,592
18R10F2.5R10F2.5n/achrIII 2,924,200contains similarity to Interpro domain IPR000443 (Islet amyloid polypeptide)
19sri-19Y69E1A.6n/achrIV 10,960,112C. elegans SRI-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20T08G3.7T08G3.7n/achrV 16,464,369contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
21cyp-13A5T10B9.2n/achrII 9,799,242C. elegans CYP-13A5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
22T25B6.3T25B6.3n/achrX 9,027,882
23C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
24fbxa-186F47H4.6n/achrV 17,337,347This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
25srt-12E03D2.4n/achrV 4,241,727C. elegans SRT-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26T26H2.5T26H2.5n/achrV 19,231,365contains similarity to Pfam domain PF00569 Zinc finger, ZZ type contains similarity to Interpro domain IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)
27dpy-28Y39A1B.3n/achrIII 10,770,127dpy-28 encodes a non-SMC condensin subunit homolog, similar to XCAP-D2 in Xenopus, Cnd1 in S. pombe, and Ycs4p in S. cerevisiae, that is required for negative, chromosome-wide regulation of X-chromosomal genes in XX but not XO animals (dosage compensation), and for some undetermined aspect of body morphogenesis; DPY-28 is part of a multiprotein 'dosage compensation' complex with DPY-26, DPY-27 and MIX-1.
28T23F1.5T23F1.5n/achrV 15,461,926contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
29clec-156F26A1.11n/achrIII 4,842,010C. elegans CLEC-156 protein; contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
30srz-19F56D6.4n/achrIV 3,920,703C. elegans SRZ-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31C08A9.3C08A9.3n/achrX 17,089,713contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
32E03H4.11E03H4.112e-151chrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
33srab-11C36C5.8n/achrV 3,146,053C. elegans SRAB-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
34srbc-65Y32B12B.3n/achrV 16,551,603C. elegans SRBC-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35F35D11.1F35D11.1n/achrII 4,627,370
36ttr-11F46B3.3n/achrV 20,599,260C. elegans TTR-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
37T03E6.2T03E6.2n/achrV 16,582,078contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38B0554.7B0554.7n/achrV 439,300contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40C03B1.3C03B1.3n/achrX 6,366,380
41C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
42F46B3.1F46B3.1n/achrV 20,592,082contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
43gnrr-3ZC374.1n/achrX 10,050,904C. elegans GNRR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
44C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
45E03G2.1E03G2.1n/achrX 15,927,754contains similarity to Plasmodium falciparum Glutamate--cysteine ligase (EC 6.3.2.2).; TR:Q9TY17
46C25A1.15C25A1.15n/achrI 10,197,447contains similarity to Human herpesvirus 6 Hypothetical protein.; TR:Q89893
47C56G7.3C56G7.3n/achrIII 3,391,206contains similarity to Pfam domain PF04727 ELMO/CED-12 family contains similarity to Interpro domain IPR006816 (Engulfment and cell motility, ELM)
48nhr-169C54C8.1n/achrI 12,443,002C. elegans NHR-169 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
49agr-1F41G3.12n/achrII 6,767,868agr-1 encodes a large (1396-residue) putative agrin, orthologous to human AGRIN (OMIM:103320), EGFLAM, and Q9NQ15; AGR-1 is expressed in buccal epithelium and deposited in pharyngeal basal epithelium; AGR-1 is also expressed in IL1 neurons, distal tip cells, and intestine; an AGR-1 fragment can cluster vertebrate dystroglycan in cell culture; agr-1(eg1770) mutations show no obvious phenotype, including levimasole resistance, and do not enhance other mutations perturbing acetylcholine signalling, the dystrophin-glycoprotein-complex, muscle cell differentiation, or the extracellular matrix.
50Y116A8C.43Y116A8C.43n/achrIV 17,089,705contains similarity to Bacillus thuringiensis Pesticidial crystal protein cry12Aa (Insecticidal delta-endotoxinsCryXIIA(a)) (Crystaline entomocidal protoxin) (142 kDa crystalsprotein).; SW:CCAA_BACTU